ZNF451 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ZNF451, COASTER, dJ417I1.1, zinc finger protein 451, ZATT |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 615708 MGI: 2137896 HomoloGene: 9188 GeneCards: ZNF451 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • SUMO ligase activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • transferase activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding |
---|
Клітинна компонента | • PML body • клітинне ядро • нуклеоплазма • histone methyltransferase complex |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter • negative regulation of histone H3-K9 acetylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • protein sumoylation • transcription, DNA-templated • регуляція експресії генів |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001031623 NM_001257273 NM_015555 |
| | NM_001290699 NM_001290700 NM_133817 NM_001359274 NM_001359275 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001026794 NP_001244202 NP_056370 |
| | NP_001277628 NP_001277629 NP_598578 NP_001346203 NP_001346204 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 57.09 – 57.17 Mb | Хр. 1: 33.8 – 33.85 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ZNF451 (англ. Zinc finger protein 451) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 061 амінокислот, а молекулярна маса — 121 484[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGDPGSEIIE | | SVPPAGPEAS | | ESTTDENEDD | | IQFVSEGPLR | | PVLEYIDLVS |
SDDEEPSTSY | | TDENIKRKDH | | IDYQKDKVAL | | TLARLARHVE | | VEKQQKEEKN |
RAFREKIDFQ | | HAHGLQELEF | | IRGHSDTEAA | | RLCVDQWLKM | | PGLKTGTINC |
GTKSSFRRGG | | HTWVSGKPIL | | CPIMHCNKEF | | DNGHLLLGHL | | KRFDHSPCDP |
TITLHGPFFS | | SFACVVCYKK | | FVTQQQYRDH | | LFDKEATDDG | | HNNNLLPQII |
QCFACPNCFL | | LFSRKEECSK | | HMSGKNHFHQ | | SFKLGDNKGI | | AHPISFPSFA |
KKLLISLCKD | | VPFQVKCVAC | | HKTLRSHMEL | | TAHFRVHCRN | | AGPVAVAEKS |
ITQVAEKFIL | | RGYCPDCNQV | | FVDETSTQNH | | KQNSGHKVRV | | INSVEESVLL |
YCHSSEGNKD | | PSSDLHLLLD | | QSKFSSLKRT | | MSIKESSSLE | | CIAIPKKKMN |
LKDKSHEGVA | | CVQKEKSVVK | | TWFCECNQRF | | PSEDAVEKHV | | FSANTMGYKC |
VVCGKVCDDS | | GVIRLHMSRI | | HGGAHLNNFL | | FWCRTCKKEL | | TRKDTIMAHV |
TEFHNGHRYF | | YEMDEVEGET | | LPSSSTTLDN | | LTANKPSSAI | | TVIDHSPANS |
SPRGKWQCRI | | CEDMFDSQEY | | VKQHCMSLAS | | HKFHRYSCAH | | CRKPFHKIET |
LYRHCQDEHD | | NEIKIKYFCG | | LCDLIFNVEE | | AFLSHYEEHH | | SIDYVFVSEK |
TETSIKTEDD | | FPVIETSNQL | | TCGCRESYIC | | KVNRKEDYSR | | CLQIMLDKGK |
LWFRCSLCSA | | TAQNLTDMNT | | HIHQVHKEKS | | DEEEQQYVIK | | CGTCTKAFHD |
PESAQQHFHR | | KHCFLQKPSV | | AHFGSEKSNL | | YKFTASASHT | | ERKLKQAINY |
SKSLDMEKGV | | ENDLSYQNIE | | EEIVELPDLD | | YLRTMTHIVF | | VDFDNWSNFF |
GHLPGHLNQG | | TFIWGFQGGN | | TNWKPPLNCK | | IYNYLNRIGC | | FFLHPRCSKR |
KDAADFAICM | | HAGRLDEQLP | | KQIPFTILSG | | DQGFLELENQ | | FKKTQRPAHI |
LNPHHLEGDM | | MCALLNSISD | | TTKECDSDDN | | MGAKNTSIGE | | EFISTEDVEL |
EEAIRRSLEE | | M |
Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Karvonen U., Jaeaeskelaeinen T., Rytinki M., Kaikkonen S., Palvimo J.J. (2008). ZNF451 is a novel PML body- and SUMO-associated transcriptional coregulator. J. Mol. Biol. 382: 585—600. PMID 18656483 DOI:10.1016/j.jmb.2008.07.016
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
- Cappadocia L., Pichler A., Lima C.D. (2015). Structural basis for catalytic activation by the human ZNF451 SUMO E3 ligase. Nat. Struct. Mol. Biol. 22: 968—975. PMID 26524494 DOI:10.1038/nsmb.3116
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21091 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y4E5 (англ.) . Архів оригіналу за 19 жовтня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|