JADE1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | JADE1, PHF17, jade family PHD finger 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610514 MGI: 1925835 HomoloGene: 18162 GeneCards: JADE1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001105 transcription coactivator activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана • нуклеоплазма • histone acetyltransferase complex • клітинне ядро • ciliary basal body • цитоскелет • cell projection • nuclear speck |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • histone H4-K5 acetylation • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • negative regulation of cell growth • histone H3 acetylation • histone H4-K16 acetylation • histone H4-K8 acetylation • histone H4-K12 acetylation • GO:0097285 апоптоз • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of nucleic acid-templated transcription |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001287437 NM_001287439 NM_001287440 NM_001287441 NM_001287442
| NM_001287443 NM_024900 NM_199320 |
| | NM_001130184 NM_001130185 NM_001130186 NM_172303 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001274366 NP_001274368 NP_001274369 NP_001274370 NP_001274371
| NP_001274372 NP_079176 NP_955352 |
| | NP_001123656 NP_001123657 NP_001123658 NP_758507 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 128.81 – 128.88 Mb | Хр. 3: 41.51 – 41.57 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
JADE1 (англ. Jade family PHD finger 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 842 амінокислот, а молекулярна маса — 95 533[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKRGRLPSSS | | EDSDDNGSLS | | TTWSQNSRSQ | | HRRSSCSRHE | | DRKPSEVFRT |
DLITAMKLHD | | SYQLNPDEYY | | VLADPWRQEW | | EKGVQVPVSP | | GTIPQPVARV |
VSEEKSLMFI | | RPKKYIVSSG | | SEPPELGYVD | | IRTLADSVCR | | YDLNDMDAAW |
LELTNEEFKE | | MGMPELDEYT | | MERVLEEFEQ | | RCYDNMNHAI | | ETEEGLGIEY |
DEDVVCDVCQ | | SPDGEDGNEM | | VFCDKCNICV | | HQACYGILKV | | PEGSWLCRTC |
ALGVQPKCLL | | CPKKGGAMKP | | TRSGTKWVHV | | SCALWIPEVS | | IGSPEKMEPI |
TKVSHIPSSR | | WALVCSLCNE | | KFGASIQCSV | | KNCRTAFHVT | | CAFDRGLEMK |
TILAENDEVK | | FKSYCPKHSS | | HRKPEESLGK | | GAAQENGAPE | | CSPRNPLEPF |
ASLEQNREEA | | HRVSVRKQKL | | QQLEDEFYTF | | VNLLDVARAL | | RLPEEVVDFL |
YQYWKLKRKV | | NFNKPLITPK | | KDEEDNLAKR | | EQDVLFRRLQ | | LFTHLRQDLE |
RVRNLTYMVT | | RREKIKRSVC | | KVQEQIFNLY | | TKLLEQERVS | | GVPSSCSSSS |
LENMLLFNSP | | SVGPDAPKIE | | DLKWHSAFFR | | KQMGTSLVHS | | LKKPHKRDPL |
QNSPGSEGKT | | LLKQPDLCGR | | REGMVVPESF | | LGLEKTFAEA | | RLISAQQKNG |
VVMPDHGKRR | | DNRFHCDLIK | | GDLKDKSFKQ | | SHKPLRSTDV | | SQRHLDNTRA |
ATSPGVGQSA | | PGTRKEIVPK | | CNGSLIKVNY | | NQTAVKVPTT | | PASPVKNWGG |
FRIPKKGERQ | | QQGEAHDGAC | | HQHSDYPYLG | | LGRVPAKERA | | KSKLKSDNEN |
DGYVPDVEMS | | DSESEASEKK | | CIHTSSTISR | | RTDIIRRSIL | | AS |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних відростках.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
- Tzouanacou E., Tweedie S., Wilson V. (2003). Identification of Jade1, a gene encoding a PHD zinc finger protein, in a gene trap mutagenesis screen for genes involved in anteroposterior axis development. Mol. Cell. Biol. 23: 8553—8562. PMID 14612400 DOI:10.1128/MCB.23.23.8553-8562.2003
- Panchenko M.V., Zhou M.I., Cohen H.T. (2004). von Hippel-Lindau partner Jade-1 is a transcriptional co-activator associated with histone acetyltransferase activity. J. Biol. Chem. 279: 56032—56041. PMID 15502158 DOI:10.1074/jbc.M410487200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30027 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q6IE81 (англ.) . Архів оригіналу за 20 червня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|