ARHGAP35 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2K85, 3C5H, 3FK2 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ARHGAP35, GRF-1, GRLF1, P190-A, P190A, p190ARhoGAP, p190RhoGAP, Rho GTPase activating protein 35 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605277 MGI: 1929494 HomoloGene: 35136 GeneCards: ARHGAP35 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GTP binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • phospholipid binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • GO:0006184 GTPase activity • nucleotide binding • lipid binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • actin cytoskeleton • клітинне ядро • цитоскелет • cell projection • клітинна мембрана • мембрана • ciliary basal body |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of Rho protein signal transduction • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • neural tube closure • regulation of cell shape • forebrain development • camera-type eye development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of vascular permeability • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • axon guidance • axonal fasciculation • regulation of actin polymerization or depolymerization • positive regulation of neuron projection development • cell migration • central nervous system neuron axonogenesis • mammary gland development • establishment or maintenance of actin cytoskeleton polarity • cellular response to extracellular stimulus • regulation of actin cytoskeleton organization • wound healing, spreading of cells • positive regulation of cilium assembly • regulation of axonogenesis • neuron projection guidance |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 46.86 – 47.01 Mb | Хр. 7: 16.23 – 16.35 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ARHGAP35 (англ. Rho GTPase activating protein 35) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 499 амінокислот, а молекулярна маса — 170 514[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MMMARKQDVR | | IPTYNISVVG | | LSGTEKEKGQ | | CGIGKSCLCN | | RFVRPSADEF |
HLDHTSVLST | | SDFGGRVVNN | | DHFLYWGEVS | | RSLEDCVECK | | MHIVEQTEFI |
DDQTFQPHRS | | TALQPYIKRA | | AATKLASAEK | | LMYFCTDQLG | | LEQDFEQKQM |
PDGKLLVDGF | | LLGIDVSRGM | | NRNFDDQLKF | | VSNLYNQLAK | | TKKPIVVVLT |
KCDEGVERYI | | RDAHTFALSK | | KNLQVVETSA | | RSNVNVDLAF | | STLVQLIDKS |
RGKTKIIPYF | | EALKQQSQQI | | ATAKDKYEWL | | VSRIVKNHNE | | NWLSVSRKMQ |
ASPEYQDYVY | | LEGTQKAKKL | | FLQHIHRLKH | | EHIERRRKLY | | LAALPLAFEA |
LIPNLDEIDH | | LSCIKAKKLL | | ETKPEFLKWF | | VVLEETPWDA | | TSHIDNMENE |
RIPFDLMDTV | | PAEQLYEAHL | | EKLRNERKRV | | EMRRAFKENL | | ETSPFITPGK |
PWEEARSFIM | | NEDFYQWLEE | | SVYMDIYGKH | | QKQIIDKAKE | | EFQELLLEYS |
ELFYELELDA | | KPSKEKMGVI | | QDVLGEEQRF | | KALQKLQAER | | DALILKHIHF |
VYHPTKETCP | | SCPACVDAKI | | EHLISSRFIR | | PSDRNQKNSL | | SDPNIDRINL |
VILGKDGLAR | | ELANEIRALC | | TNDDKYVIDG | | KMYELSLRPI | | EGNVRLPVNS |
FQTPTFQPHG | | CLCLYNSKES | | LSYVVESIEK | | SRESTLGRRD | | NHLVHLPLTL |
ILVNKRGDTS | | GETLHSLIQQ | | GQQIASKLQC | | VFLDPASAGI | | GYGRNINEKQ |
ISQVLKGLLD | | SKRNLNLVSS | | TASIKDLADV | | DLRIVMCLMC | | GDPFSADDIL |
FPVLQSQTCK | | SSHCGSNNSV | | LLELPIGLHK | | KRIELSVLSY | | HSSFSIRKSR |
LVHGYIVFYS | | AKRKASLAML | | RAFLCEVQDI | | IPIQLVALTD | | GAVDVLDNDL |
SREQLTEGEE | | IAQEIDGRFT | | SIPCSQPQHK | | LEIFHPFFKD | | VVEKKNIIEA |
THMYDNAAEA | | CSTTEEVFNS | | PRAGSPLCNS | | NLQDSEEDIE | | PSYSLFREDT |
SLPSLSKDHS | | KLSMELEGND | | GLSFIMSNFE | | SKLNNKVPPP | | VKPKPPVHFE |
ITKGDLSYLD | | QGHRDGQRKS | | VSSSPWLPQD | | GFDPSDYAEP | | MDAVVKPRNE |
EENIYSVPHD | | STQGKIITIR | | NINKAQSNGS | | GNGSDSEMDT | | SSLERGRKVS |
IVSKPVLYRT | | RCTRLGRFAS | | YRTSFSVGSD | | DELGPIRKKE | | EDQASQGYKG |
DNAVIPYETD | | EDPRRRNILR | | SLRRNTKKPK | | PKPRPSITKA | | TWESNYFGVP |
LTTVVTPEKP | | IPIFIERCIE | | YIEATGLSTE | | GIYRVSGNKS | | EMESLQRQFD |
QDHNLDLAEK | | DFTVNTVAGA | | MKSFFSELPD | | PLVPYNMQID | | LVEAHKINDR |
EQKLHALKEV | | LKKFPKENHE | | VFKYVISHLN | | KVSHNNKVNL | | MTSENLSICF |
WPTLMRPDFS | | TMDALTATRT | | YQTIIELFIQ | | QCPFFFYNRP | | ITEPPGARPS |
SPSAVASTVP | | FLTSTPVTSQ | | PSPPQSPPPT | | PQSPMQPLLP | | SQLQAEHTL |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних відростках.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Levay M., Settleman J., Ligeti E. (2009). Regulation of the substrate preference of p190RhoGAP by protein kinase C-mediated phosphorylation of a phospholipid binding site. Biochemistry. 48: 8615—8623. PMID 19673492 DOI:10.1021/bi900667y
- Bonet R., Ruiz L., Aragon E., Martin-Malpartida P., Macias M.J. (2009). NMR structural studies on human p190-A RhoGAPFF1 revealed that domain phosphorylation by the PDGF-receptor alpha requires its previous unfolding. J. Mol. Biol. 389: 230—237. PMID 19393245 DOI:10.1016/j.jmb.2009.04.035
- LeClerc S., Palaniswami R., Xie B.X., Govindan M.V. (1991). Molecular cloning and characterization of a factor that binds the human glucocorticoid receptor gene and represses its expression. J. Biol. Chem. 266: 17333—17340. PMID 1894621
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4591 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NRY4 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|