ALCAM |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ALCAM, CD166, MEMD, activated leukocyte cell adhesion molecule |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601662 MGI: 1313266 HomoloGene: 1229 GeneCards: ALCAM |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signaling receptor binding • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • cell projection • мембрана • focal adhesion • intrinsic component of plasma membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • T cell receptor complex • extracellular region • аксон • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • immunological synapse • екзосома • external side of plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • адаптивна імунна відповідь • процес імунної системи • neuron projection extension • адгезія клітин • motor neuron axon guidance • axon extension involved in axon guidance • GO:0072468 сигнальна трансдукція • retinal ganglion cell axon guidance • axon guidance |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001627 NM_001243280 NM_001243281 NM_001243283 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001230209 NP_001230210 NP_001230212 NP_001618 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 105.37 – 105.58 Mb | Хр. 16: 52.07 – 52.27 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ALCAM (англ. Activated leukocyte cell adhesion molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 583 амінокислот, а молекулярна маса — 65 102[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MESKGASSCR | | LLFCLLISAT | | VFRPGLGWYT | | VNSAYGDTII | | IPCRLDVPQN |
LMFGKWKYEK | | PDGSPVFIAF | | RSSTKKSVQY | | DDVPEYKDRL | | NLSENYTLSI |
SNARISDEKR | | FVCMLVTEDN | | VFEAPTIVKV | | FKQPSKPEIV | | SKALFLETEQ |
LKKLGDCISE | | DSYPDGNITW | | YRNGKVLHPL | | EGAVVIIFKK | | EMDPVTQLYT |
MTSTLEYKTT | | KADIQMPFTC | | SVTYYGPSGQ | | KTIHSEQAVF | | DIYYPTEQVT |
IQVLPPKNAI | | KEGDNITLKC | | LGNGNPPPEE | | FLFYLPGQPE | | GIRSSNTYTL |
TDVRRNATGD | | YKCSLIDKKS | | MIASTAITVH | | YLDLSLNPSG | | EVTRQIGDAL |
PVSCTISASR | | NATVVWMKDN | | IRLRSSPSFS | | SLHYQDAGNY | | VCETALQEVE |
GLKKRESLTL | | IVEGKPQIKM | | TKKTDPSGLS | | KTIICHVEGF | | PKPAIQWTIT |
GSGSVINQTE | | ESPYINGRYY | | SKIIISPEEN | | VTLTCTAENQ | | LERTVNSLNV |
SAISIPEHDE | | ADEISDENRE | | KVNDQAKLIV | | GIVVGLLLAA | | LVAGVVYWLY |
MKKSKTASKH | | VNKDLGNMEE | | NKKLEENNHK | | TEA |
Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, адаптивний імунітет, імунітет, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках. Також секретований назовні.
Література
- Ikeda K., Quertermous T. (2004). Molecular isolation and characterization of a soluble isoform of activated leukocyte cell adhesion molecule that modulates endothelial cell function. J. Biol. Chem. 279: 55315—55323. PMID 15496415 DOI:10.1074/jbc.M407776200
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Skonier J.E., Bowen M.A., Emswiler J., Aruffo A., Bajorath J. (1996). Recognition of diverse proteins by members of the immunoglobulin superfamily: delineation of the receptor binding site in the human CD6 ligand ALCAM. Biochemistry. 35: 12287—12291. PMID 8823162 DOI:10.1021/bi961038k
- Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827
- Hassan N.J., Barclay A.N., Brown M.H. (2004). Frontline: Optimal T cell activation requires the engagement of CD6 and CD166. Eur. J. Immunol. 34: 930—940. PMID 15048703 DOI:10.1002/eji.200424856
- Bajorath J., Bowen M.A., Aruffo A. (1995). Molecular model of the N-terminal receptor-binding domain of the human CD6 ligand ALCAM. Protein Sci. 4: 1644—1647. PMID 8520490 DOI:10.1002/pro.5560040822
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:400 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q13740 (англ.) . Архів оригіналу за 27 листопада 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації |
---|
| 1-50 | |
---|
| 51-100 | |
---|
| 101-150 | |
---|
| 151-200 | |
---|
| 201-250 | |
---|
| 251-300 | |
---|
| 301-350 | |
---|
|