LRP1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1CR8, 1D2L, 1J8E, 2FYJ, 2FYL, 2KNX, 2KNY | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | LRP1, A2MR, APOER, APR, CD91, IGFBP3R, LRP, LRP1A, TGFBR5, low density lipoprotein receptor-related protein 1, LDL receptor related protein 1, KPA, IGFBP3R1, IGFBP-3R |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 107770 MGI: 96828 HomoloGene: 1744 GeneCards: LRP1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
мігрень, migraine without aura, Аневризма черевної аорти[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • apolipoprotein binding • lipoprotein particle receptor binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • зв'язування з іоном металу • protease binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • low-density lipoprotein particle receptor activity • RNA binding • amyloid-beta binding • scavenger receptor activity • coreceptor activity • alpha-2 macroglobulin receptor activity • apolipoprotein receptor activity • clathrin heavy chain binding • signaling receptor activity • cargo receptor activity • heparan sulfate proteoglycan binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • endocytic vesicle membrane • ендосома • мембрана • focal adhesion • receptor complex • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • lysosomal membrane • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • ядерце • clathrin-coated pit • clathrin-coated vesicle • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • early endosome • basolateral plasma membrane • insulin-responsive compartment • axonal growth cone • apical part of cell • plasma membrane protein complex |
---|
Біологічний процес | • lipoprotein metabolic process • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • negative regulation of platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway • negative regulation of neuron projection development • ендоцитоз • regulation of actin cytoskeleton organization • regulation of phospholipase A2 activity • amyloid-beta clearance • negative regulation of Wnt signaling pathway • GO:0010260 старіння людини • negative regulation of smooth muscle cell migration • positive regulation of lipid transport • рецептор-опосередкований ендоцитоз • aorta morphogenesis • retinoid metabolic process • regulation of cholesterol transport • positive regulation of protein transport • apoptotic cell clearance • multicellular organism development • protein kinase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway • positive regulation of cholesterol efflux • cerebral cortex development • проліферація • lipoprotein transport • regulation of extracellular matrix disassembly • astrocyte activation involved in immune response • lipid metabolism • Фагоцитоз • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • negative regulation of cell-substrate adhesion • positive regulation of cell death • positive regulation of neuron projection development • receptor internalization • positive regulation of protein binding • positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • negative regulation of apoptotic process • cellular lipid catabolic process • Цитопемпсис • positive regulation of axon extension • positive regulation of endocytosis • positive regulation of axon extension involved in regeneration • positive regulation of collateral sprouting of injured axon • positive regulation of phagocytosis • negative regulation of cytosolic calcium ion concentration • negative regulation of focal adhesion assembly • negative regulation of cell death • chemoattraction of axon • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • amyloid-beta clearance by transcytosis • amyloid-beta clearance by cellular catabolic process • positive regulation of Schwann cell migration • positive regulation of amyloid-beta clearance • positive regulation of protein localization to plasma membrane • positive regulation of cholesterol import • cellular response to amyloid-beta • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell migration • positive regulation of lysosomal protein catabolic process • lysosomal transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 57.13 – 57.21 Mb | Хр. 10: 127.37 – 127.46 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LRP1 (англ. LDL receptor related protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 544 амінокислот, а молекулярна маса — 504 606[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLTPPLLLLL | | PLLSALVAAA | | IDAPKTCSPK | | QFACRDQITC | | ISKGWRCDGE |
RDCPDGSDEA | | PEICPQSKAQ | | RCQPNEHNCL | | GTELCVPMSR | | LCNGVQDCMD |
GSDEGPHCRE | | LQGNCSRLGC | | QHHCVPTLDG | | PTCYCNSSFQ | | LQADGKTCKD |
FDECSVYGTC | | SQLCTNTDGS | | FICGCVEGYL | | LQPDNRSCKA | | KNEPVDRPPV |
LLIANSQNIL | | ATYLSGAQVS | | TITPTSTRQT | | TAMDFSYANE | | TVCWVHVGDS |
AAQTQLKCAR | | MPGLKGFVDE | | HTINISLSLH | | HVEQMAIDWL | | TGNFYFVDDI |
DDRIFVCNRN | | GDTCVTLLDL | | ELYNPKGIAL | | DPAMGKVFFT | | DYGQIPKVER |
CDMDGQNRTK | | LVDSKIVFPH | | GITLDLVSRL | | VYWADAYLDY | | IEVVDYEGKG |
RQTIIQGILI | | EHLYGLTVFE | | NYLYATNSDN | | ANAQQKTSVI | | RVNRFNSTEY |
QVVTRVDKGG | | ALHIYHQRRQ | | PRVRSHACEN | | DQYGKPGGCS | | DICLLANSHK |
ARTCRCRSGF | | SLGSDGKSCK | | KPEHELFLVY | | GKGRPGIIRG | | MDMGAKVPDE |
HMIPIENLMN | | PRALDFHAET | | GFIYFADTTS | | YLIGRQKIDG | | TERETILKDG |
IHNVEGVAVD | | WMGDNLYWTD | | DGPKKTISVA | | RLEKAAQTRK | | TLIEGKMTHP |
RAIVVDPLNG | | WMYWTDWEED | | PKDSRRGRLE | | RAWMDGSHRD | | IFVTSKTVLW |
PNGLSLDIPA | | GRLYWVDAFY | | DRIETILLNG | | TDRKIVYEGP | | ELNHAFGLCH |
HGNYLFWTEY | | RSGSVYRLER | | GVGGAPPTVT | | LLRSERPPIF | | EIRMYDAQQQ |
QVGTNKCRVN | | NGGCSSLCLA | | TPGSRQCACA | | EDQVLDADGV | | TCLANPSYVP |
PPQCQPGEFA | | CANSRCIQER | | WKCDGDNDCL | | DNSDEAPALC | | HQHTCPSDRF |
KCENNRCIPN | | RWLCDGDNDC | | GNSEDESNAT | | CSARTCPPNQ | | FSCASGRCIP |
ISWTCDLDDD | | CGDRSDESAS | | CAYPTCFPLT | | QFTCNNGRCI | | NINWRCDNDN |
DCGDNSDEAG | | CSHSCSSTQF | | KCNSGRCIPE | | HWTCDGDNDC | | GDYSDETHAN |
CTNQATRPPG | | GCHTDEFQCR | | LDGLCIPLRW | | RCDGDTDCMD | | SSDEKSCEGV |
THVCDPSVKF | | GCKDSARCIS | | KAWVCDGDND | | CEDNSDEENC | | ESLACRPPSH |
PCANNTSVCL | | PPDKLCDGND | | DCGDGSDEGE | | LCDQCSLNNG | | GCSHNCSVAP |
GEGIVCSCPL | | GMELGPDNHT | | CQIQSYCAKH | | LKCSQKCDQN | | KFSVKCSCYE |
GWVLEPDGES | | CRSLDPFKPF | | IIFSNRHEIR | | RIDLHKGDYS | | VLVPGLRNTI |
ALDFHLSQSA | | LYWTDVVEDK | | IYRGKLLDNG | | ALTSFEVVIQ | | YGLATPEGLA |
VDWIAGNIYW | | VESNLDQIEV | | AKLDGTLRTT | | LLAGDIEHPR | | AIALDPRDGI |
LFWTDWDASL | | PRIEAASMSG | | AGRRTVHRET | | GSGGWPNGLT | | VDYLEKRILW |
IDARSDAIYS | | ARYDGSGHME | | VLRGHEFLSH | | PFAVTLYGGE | | VYWTDWRTNT |
LAKANKWTGH | | NVTVVQRTNT | | QPFDLQVYHP | | SRQPMAPNPC | | EANGGQGPCS |
HLCLINYNRT | | VSCACPHLMK | | LHKDNTTCYE | | FKKFLLYARQ | | MEIRGVDLDA |
PYYNYIISFT | | VPDIDNVTVL | | DYDAREQRVY | | WSDVRTQAIK | | RAFINGTGVE |
TVVSADLPNA | | HGLAVDWVSR | | NLFWTSYDTN | | KKQINVARLD | | GSFKNAVVQG |
LEQPHGLVVH | | PLRGKLYWTD | | GDNISMANMD | | GSNRTLLFSG | | QKGPVGLAID |
FPESKLYWIS | | SGNHTINRCN | | LDGSGLEVID | | AMRSQLGKAT | | ALAIMGDKLW |
WADQVSEKMG | | TCSKADGSGS | | VVLRNSTTLV | | MHMKVYDESI | | QLDHKGTNPC |
SVNNGDCSQL | | CLPTSETTRS | | CMCTAGYSLR | | SGQQACEGVG | | SFLLYSVHEG |
IRGIPLDPND | | KSDALVPVSG | | TSLAVGIDFH | | AENDTIYWVD | | MGLSTISRAK |
RDQTWREDVV | | TNGIGRVEGI | | AVDWIAGNIY | | WTDQGFDVIE | | VARLNGSFRY |
VVISQGLDKP | | RAITVHPEKG | | YLFWTEWGQY | | PRIERSRLDG | | TERVVLVNVS |
ISWPNGISVD | | YQDGKLYWCD | | ARTDKIERID | | LETGENREVV | | LSSNNMDMFS |
VSVFEDFIYW | | SDRTHANGSI | | KRGSKDNATD | | SVPLRTGIGV | | QLKDIKVFNR |
DRQKGTNVCA | | VANGGCQQLC | | LYRGRGQRAC | | ACAHGMLAED | | GASCREYAGY |
LLYSERTILK | | SIHLSDERNL | | NAPVQPFEDP | | EHMKNVIALA | | FDYRAGTSPG |
TPNRIFFSDI | | HFGNIQQIND | | DGSRRITIVE | | NVGSVEGLAY | | HRGWDTLYWT |
SYTTSTITRH | | TVDQTRPGAF | | ERETVITMSG | | DDHPRAFVLD | | ECQNLMFWTN |
WNEQHPSIMR | | AALSGANVLT | | LIEKDIRTPN | | GLAIDHRAEK | | LYFSDATLDK |
IERCEYDGSH | | RYVILKSEPV | | HPFGLAVYGE | | HIFWTDWVRR | | AVQRANKHVG |
SNMKLLRVDI | | PQQPMGIIAV | | ANDTNSCELS | | PCRINNGGCQ | | DLCLLTHQGH |
VNCSCRGGRI | | LQDDLTCRAV | | NSSCRAQDEF | | ECANGECINF | | SLTCDGVPHC |
KDKSDEKPSY | | CNSRRCKKTF | | RQCSNGRCVS | | NMLWCNGADD | | CGDGSDEIPC |
NKTACGVGEF | | RCRDGTCIGN | | SSRCNQFVDC | | EDASDEMNCS | | ATDCSSYFRL |
GVKGVLFQPC | | ERTSLCYAPS | | WVCDGANDCG | | DYSDERDCPG | | VKRPRCPLNY |
FACPSGRCIP | | MSWTCDKEDD | | CEHGEDETHC | | NKFCSEAQFE | | CQNHRCISKQ |
WLCDGSDDCG | | DGSDEAAHCE | | GKTCGPSSFS | | CPGTHVCVPE | | RWLCDGDKDC |
ADGADESIAA | | GCLYNSTCDD | | REFMCQNRQC | | IPKHFVCDHD | | RDCADGSDES |
PECEYPTCGP | | SEFRCANGRC | | LSSRQWECDG | | ENDCHDQSDE | | APKNPHCTSQ |
EHKCNASSQF | | LCSSGRCVAE | | ALLCNGQDDC | | GDSSDERGCH | | INECLSRKLS |
GCSQDCEDLK | | IGFKCRCRPG | | FRLKDDGRTC | | ADVDECSTTF | | PCSQRCINTH |
GSYKCLCVEG | | YAPRGGDPHS | | CKAVTDEEPF | | LIFANRYYLR | | KLNLDGSNYT |
LLKQGLNNAV | | ALDFDYREQM | | IYWTDVTTQG | | SMIRRMHLNG | | SNVQVLHRTG |
LSNPDGLAVD | | WVGGNLYWCD | | KGRDTIEVSK | | LNGAYRTVLV | | SSGLREPRAL |
VVDVQNGYLY | | WTDWGDHSLI | | GRIGMDGSSR | | SVIVDTKITW | | PNGLTLDYVT |
ERIYWADARE | | DYIEFASLDG | | SNRHVVLSQD | | IPHIFALTLF | | EDYVYWTDWE |
TKSINRAHKT | | TGTNKTLLIS | | TLHRPMDLHV | | FHALRQPDVP | | NHPCKVNNGG |
CSNLCLLSPG | | GGHKCACPTN | | FYLGSDGRTC | | VSNCTASQFV | | CKNDKCIPFW |
WKCDTEDDCG | | DHSDEPPDCP | | EFKCRPGQFQ | | CSTGICTNPA | | FICDGDNDCQ |
DNSDEANCDI | | HVCLPSQFKC | | TNTNRCIPGI | | FRCNGQDNCG | | DGEDERDCPE |
VTCAPNQFQC | | SITKRCIPRV | | WVCDRDNDCV | | DGSDEPANCT | | QMTCGVDEFR |
CKDSGRCIPA | | RWKCDGEDDC | | GDGSDEPKEE | | CDERTCEPYQ | | FRCKNNRCVP |
GRWQCDYDND | | CGDNSDEESC | | TPRPCSESEF | | SCANGRCIAG | | RWKCDGDHDC |
ADGSDEKDCT | | PRCDMDQFQC | | KSGHCIPLRW | | RCDADADCMD | | GSDEEACGTG |
VRTCPLDEFQ | | CNNTLCKPLA | | WKCDGEDDCG | | DNSDENPEEC | | ARFVCPPNRP |
FRCKNDRVCL | | WIGRQCDGTD | | NCGDGTDEED | | CEPPTAHTTH | | CKDKKEFLCR |
NQRCLSSSLR | | CNMFDDCGDG | | SDEEDCSIDP | | KLTSCATNAS | | ICGDEARCVR |
TEKAAYCACR | | SGFHTVPGQP | | GCQDINECLR | | FGTCSQLCNN | | TKGGHLCSCA |
RNFMKTHNTC | | KAEGSEYQVL | | YIADDNEIRS | | LFPGHPHSAY | | EQAFQGDESV |
RIDAMDVHVK | | AGRVYWTNWH | | TGTISYRSLP | | PAAPPTTSNR | | HRRQIDRGVT |
HLNISGLKMP | | RGIAIDWVAG | | NVYWTDSGRD | | VIEVAQMKGE | | NRKTLISGMI |
DEPHAIVVDP | | LRGTMYWSDW | | GNHPKIETAA | | MDGTLRETLV | | QDNIQWPTGL |
AVDYHNERLY | | WADAKLSVIG | | SIRLNGTDPI | | VAADSKRGLS | | HPFSIDVFED |
YIYGVTYINN | | RVFKIHKFGH | | SPLVNLTGGL | | SHASDVVLYH | | QHKQPEVTNP |
CDRKKCEWLC | | LLSPSGPVCT | | CPNGKRLDNG | | TCVPVPSPTP | | PPDAPRPGTC |
NLQCFNGGSC | | FLNARRQPKC | | RCQPRYTGDK | | CELDQCWEHC | | RNGGTCAASP |
SGMPTCRCPT | | GFTGPKCTQQ | | VCAGYCANNS | | TCTVNQGNQP | | QCRCLPGFLG |
DRCQYRQCSG | | YCENFGTCQM | | AADGSRQCRC | | TAYFEGSRCE | | VNKCSRCLEG |
ACVVNKQSGD | | VTCNCTDGRV | | APSCLTCVGH | | CSNGGSCTMN | | SKMMPECQCP |
PHMTGPRCEE | | HVFSQQQPGH | | IASILIPLLL | | LLLLVLVAGV | | VFWYKRRVQG |
AKGFQHQRMT | | NGAMNVEIGN | | PTYKMYEGGE | | PDDVGGLLDA | | DFALDPDKPT |
NFTNPVYATL | | YMGGHGSRHS | | LASTDEKREL | | LGRGPEDEIG | | DPLA |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі як ендоцитоз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани.
Література
- Van Leuven F., Stas L., Thiry E., Nelissen B., Miyake Y. (1998). Strategy to sequence the 89 exons of the human LRP1 gene coding for the lipoprotein receptor related protein: identification of one expressed mutation among 48 polymorphisms. Genomics. 52: 138—144. PMID 9782078 DOI:10.1006/geno.1998.5408
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- May P., Reddy Y.K., Herz J. (2002). Proteolytic processing of low density lipoprotein receptor-related protein mediates regulated release of its intracellular domain. J. Biol. Chem. 277: 18736—18743. PMID 11907044 DOI:10.1074/jbc.M201979200
- Kinoshita A., Shah T., Tangredi M.M., Strickland D.K., Hyman B.T. (2003). The intracellular domain of the low density lipoprotein receptor-related protein modulates transactivation mediated by amyloid precursor protein and Fe65. J. Biol. Chem. 278: 41182—41188. PMID 12888553 DOI:10.1074/jbc.M306403200
- May P., Herz J. (2003). LDL receptor-related proteins in neurodevelopment. Traffic. 4: 291—301. PMID 12713657 DOI:10.1034/j.1600-0854.2003.00086_4_5.x
- Huang W., Dolmer K., Gettins P.G.W. (1999). NMR solution structure of complement-like repeat CR8 from the low density lipoprotein receptor-related protein. J. Biol. Chem. 274: 14130—14136. PMID 10318830 DOI:10.1074/jbc.274.20.14130
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з LRP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6692 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q07954 (англ.) . Архів оригіналу за 2 грудня 2008. Процитовано 21 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації |
---|
| 1-50 | |
---|
| 51-100 | |
---|
| 101-150 | |
---|
| 151-200 | |
---|
| 201-250 | |
---|
| 251-300 | |
---|
| 301-350 | |
---|
|