TLR6 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TLR6, CD286, toll like receptor 6 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605403 MGI: 1341296 HomoloGene: 21223 GeneCards: TLR6 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • Toll-like receptor 2 binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane signaling receptor activity • ліпопептидний зв'язок • amyloid-beta binding • signaling receptor binding • signaling receptor activity • identical protein binding • protein heterodimerization activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • phagocytic vesicle membrane • мембрана • integral component of plasma membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • комплекс Ґольджі • membrane raft • Toll-like receptor 2-Toll-like receptor 6 protein complex • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • receptor complex |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of NLRP3 inflammasome complex assembly • процес імунної системи • positive regulation of JUN kinase activity • cellular response to diacyl bacterial lipopeptide • activation of NF-kappaB-inducing kinase activity • toll-like receptor 6 signaling pathway • defense response to bacterium • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • inflammatory response • toll-like receptor TLR6:TLR2 signaling pathway • detection of diacyl bacterial lipopeptide • GO:0072468 сигнальна трансдукція • вроджений імунітет • T-helper 1 type immune response • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • nitric oxide metabolic process • response to bacterial lipoprotein • microglial cell activation • toll-like receptor signaling pathway • cell activation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of toll-like receptor 2 signaling pathway • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • positive regulation of macrophage activation • positive regulation of nitric oxide biosynthetic process • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • cellular response to oxidised low-density lipoprotein particle stimulus • positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response • positive regulation of oxidative stress-induced neuron death • positive regulation of reactive oxygen species biosynthetic process • cellular response to amyloid-beta |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_011604 NM_001359180 NM_001384171 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_035734 NP_001346109 NP_001371100 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 38.82 – 38.86 Mb | Хр. 5: 65.11 – 65.12 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TLR6 (англ. Toll like receptor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 796 амінокислот, а молекулярна маса — 91 880[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTKDKEPIVK | | SFHFVCLMII | | IVGTRIQFSD | | GNEFAVDKSK | | RGLIHVPKDL |
PLKTKVLDMS | | QNYIAELQVS | | DMSFLSELTV | | LRLSHNRIQL | | LDLSVFKFNQ |
DLEYLDLSHN | | QLQKISCHPI | | VSFRHLDLSF | | NDFKALPICK | | EFGNLSQLNF |
LGLSAMKLQK | | LDLLPIAHLH | | LSYILLDLRN | | YYIKENETES | | LQILNAKTLH |
LVFHPTSLFA | | IQVNISVNTL | | GCLQLTNIKL | | NDDNCQVFIK | | FLSELTRGST |
LLNFTLNHIE | | TTWKCLVRVF | | QFLWPKPVEY | | LNIYNLTIIE | | SIREEDFTYS |
KTTLKALTIE | | HITNQVFLFS | | QTALYTVFSE | | MNIMMLTISD | | TPFIHMLCPH |
APSTFKFLNF | | TQNVFTDSIF | | EKCSTLVKLE | | TLILQKNGLK | | DLFKVGLMTK |
DMPSLEILDV | | SWNSLESGRH | | KENCTWVESI | | VVLNLSSNML | | TDSVFRCLPP |
RIKVLDLHSN | | KIKSVPKQVV | | KLEALQELNV | | AFNSLTDLPG | | CGSFSSLSVL |
IIDHNSVSHP | | SADFFQSCQK | | MRSIKAGDNP | | FQCTCELREF | | VKNIDQVSSE |
VLEGWPDSYK | | CDYPESYRGS | | PLKDFHMSEL | | SCNITLLIVT | | IGATMLVLAV |
TVTSLCIYLD | | LPWYLRMVCQ | | WTQTRRRARN | | IPLEELQRNL | | QFHAFISYSE |
HDSAWVKSEL | | VPYLEKEDIQ | | ICLHERNFVP | | GKSIVENIIN | | CIEKSYKSIF |
VLSPNFVQSE | | WCHYELYFAH | | HNLFHEGSNN | | LILILLEPIP | | QNSIPNKYHK |
LKALMTQRTY | | LQWPKEKSKR | | GLFWANIRAA | | FNMKLTLVTE | | NNDVKS |
Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bulut Y., Faure E., Thomas L., Equils O., Arditi M. (2001). Cooperation of Toll-like receptor 2 and 6 for cellular activation by soluble tuberculosis factor and Borrelia burgdorferi outer surface protein A lipoprotein: role of Toll-interacting protein and IL-1 receptor signaling molecules in Toll-like receptor 2 signaling. J. Immunol. 167: 987—994. PMID 11441107 DOI:10.4049/jimmunol.167.2.987
- Jang T.H., Park H.H. (2014). Crystal structure of TIR domain of TLR6 reveals novel dimeric interface of TIR-TIR interaction for toll-like receptor signaling pathway. J. Mol. Biol. 426: 3305—3313. PMID 25088687 DOI:10.1016/j.jmb.2014.07.024
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16711 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y2C9 (англ.) . Архів оригіналу за 5 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації |
---|
| 1-50 | |
---|
| 51-100 | |
---|
| 101-150 | |
---|
| 151-200 | |
---|
| 201-250 | |
---|
| 251-300 | |
---|
| 301-350 | |
---|
|