ABCB1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ABCB1, ABC20, CD243, CLCS, GP170, MDR1, P-GP, PGY1, ATP binding cassette subfamily B member 1, P-glycoprotein, P-gp, Pgp |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 171050 MGI: 97570 HomoloGene: 55496 GeneCards: ABCB1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
inflammatory bowel disease 13[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • ATPase-coupled transmembrane transporter activity • nucleotide binding • transporter activity • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding • ABC-type xenobiotic transporter activity • phosphatidylethanolamine flippase activity • phosphatidylcholine floppase activity • ceramide floppase activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • cell surface • екзосома • apical plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • stem cell proliferation • xenobiotic transport • G2/M transition of mitotic cell cycle • трансмембранний транспорт • phospholipid translocation • xenobiotic transmembrane transport • ceramide translocation • regulation of response to osmotic stress • positive regulation of anion channel activity • regulation of chloride transport • GO:0015915 транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | NP_000918 NP_001335873 NP_001335874 NP_001335875 |
| |
---|
Локус (UCSC) | н/д | Хр. 5: 8.71 – 8.8 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ABCB1 (англ. ATP binding cassette subfamily B member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 280 амінокислот, а молекулярна маса — 141 479[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDLEGDRNGG | | AKKKNFFKLN | | NKSEKDKKEK | | KPTVSVFSMF | | RYSNWLDKLY |
MVVGTLAAII | | HGAGLPLMML | | VFGEMTDIFA | | NAGNLEDLMS | | NITNRSDIND |
TGFFMNLEED | | MTRYAYYYSG | | IGAGVLVAAY | | IQVSFWCLAA | | GRQIHKIRKQ |
FFHAIMRQEI | | GWFDVHDVGE | | LNTRLTDDVS | | KINEGIGDKI | | GMFFQSMATF |
FTGFIVGFTR | | GWKLTLVILA | | ISPVLGLSAA | | VWAKILSSFT | | DKELLAYAKA |
GAVAEEVLAA | | IRTVIAFGGQ | | KKELERYNKN | | LEEAKRIGIK | | KAITANISIG |
AAFLLIYASY | | ALAFWYGTTL | | VLSGEYSIGQ | | VLTVFFSVLI | | GAFSVGQASP |
SIEAFANARG | | AAYEIFKIID | | NKPSIDSYSK | | SGHKPDNIKG | | NLEFRNVHFS |
YPSRKEVKIL | | KGLNLKVQSG | | QTVALVGNSG | | CGKSTTVQLM | | QRLYDPTEGM |
VSVDGQDIRT | | INVRFLREII | | GVVSQEPVLF | | ATTIAENIRY | | GRENVTMDEI |
EKAVKEANAY | | DFIMKLPHKF | | DTLVGERGAQ | | LSGGQKQRIA | | IARALVRNPK |
ILLLDEATSA | | LDTESEAVVQ | | VALDKARKGR | | TTIVIAHRLS | | TVRNADVIAG |
FDDGVIVEKG | | NHDELMKEKG | | IYFKLVTMQT | | AGNEVELENA | | ADESKSEIDA |
LEMSSNDSRS | | SLIRKRSTRR | | SVRGSQAQDR | | KLSTKEALDE | | SIPPVSFWRI |
MKLNLTEWPY | | FVVGVFCAII | | NGGLQPAFAI | | IFSKIIGVFT | | RIDDPETKRQ |
NSNLFSLLFL | | ALGIISFITF | | FLQGFTFGKA | | GEILTKRLRY | | MVFRSMLRQD |
VSWFDDPKNT | | TGALTTRLAN | | DAAQVKGAIG | | SRLAVITQNI | | ANLGTGIIIS |
FIYGWQLTLL | | LLAIVPIIAI | | AGVVEMKMLS | | GQALKDKKEL | | EGSGKIATEA |
IENFRTVVSL | | TQEQKFEHMY | | AQSLQVPYRN | | SLRKAHIFGI | | TFSFTQAMMY |
FSYAGCFRFG | | AYLVAHKLMS | | FEDVLLVFSA | | VVFGAMAVGQ | | VSSFAPDYAK |
AKISAAHIIM | | IIEKTPLIDS | | YSTEGLMPNT | | LEGNVTFGEV | | VFNYPTRPDI |
PVLQGLSLEV | | KKGQTLALVG | | SSGCGKSTVV | | QLLERFYDPL | | AGKVLLDGKE |
IKRLNVQWLR | | AHLGIVSQEP | | ILFDCSIAEN | | IAYGDNSRVV | | SQEEIVRAAK |
EANIHAFIES | | LPNKYSTKVG | | DKGTQLSGGQ | | KQRIAIARAL | | VRQPHILLLD |
EATSALDTES | | EKVVQEALDK | | AREGRTCIVI | | AHRLSTIQNA | | DLIVVFQNGR |
VKEHGTHQQL | | LAQKGIYFSM | | VSVQAGTKRQ |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Gekeler V., Weger S., Probst H. (1990). mdr1/P-glycoprotein gene segments analyzed from various human leukemic cell lines exhibiting different multidrug resistance profiles. Biochem. Biophys. Res. Commun. 169: 796—802. PMID 1972623 DOI:10.1016/0006-291X(90)90401-8
- Kerb R., Hoffmeyer S., Brinkmann U. (2001). ABC drug transporters: hereditary polymorphisms and pharmacological impact in MDR1, MRP1 and MRP2. Pharmacogenomics. 2: 51—64. PMID 11258197 DOI:10.1517/14622416.2.1.51
- Begley G.S., Horvath A.R., Taylor J.C., Higgins C.F. (2005). Cytoplasmic domains of the transporter associated with antigen processing and P-glycoprotein interact with subunits of the proteasome. Mol. Immunol. 42: 137—141. PMID 15488952 DOI:10.1016/j.molimm.2004.07.005
- Katayama K., Yamaguchi M., Noguchi K., Sugimoto Y. (2014). Protein phosphatase complex PP5/PPP2R3C dephosphorylates P-glycoprotein/ABCB1 and down-regulates the expression and function. Cancer Lett. 345: 124—131. PMID 24333728 DOI:10.1016/j.canlet.2013.12.007
- Choi K.H., Chen C.-J., Kriegler M., Roninson I.B. (1988). An altered pattern of cross-resistance in multidrug-resistant human cells results from spontaneous mutations in the mdr1 (P-glycoprotein) gene. Cell. 53: 519—529. PMID 2897240 DOI:10.1016/0092-8674(88)90568-5
- Decleves X., Chevillard S., Charpentier C., Vielh P., Laplanche J.-L. (2000). A new polymorphism (N21D) in the exon 2 of the human MDR1 gene encoding the P-glycoprotein. Hum. Mutat. 15: 486—486. PMID 10790226 DOI:10.1002/(SICI)1098-1004(200005)15:5<486::AID-HUMU26>3.0.CO;2-P
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ABCB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:40 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P08183 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації |
---|
| 1-50 | |
---|
| 51-100 | |
---|
| 101-150 | |
---|
| 151-200 | |
---|
| 201-250 | |
---|
| 251-300 | |
---|
| 301-350 | |
---|
|