TLR3 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1ZIW, 2A0Z, 3ULU, 3ULV, 2MK9, 2MKA | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TLR3, CD283, IIAE2, toll like receptor 3, IMD83 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603029 MGI: 2156367 HomoloGene: 20696 GeneCards: TLR3 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
herpesviral encephalitis[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • RNA binding • double-stranded RNA binding • transmembrane signaling receptor activity • signaling receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • integral component of membrane • ендосома • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Golgi membrane • integral component of plasma membrane • внутрішньоклітинний • cell surface • lysosomal membrane • early endosome • ендоплазматичний ретикулум • endolysosome membrane • endosome membrane • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of interferon-beta production • response to dsRNA • defense response • positive regulation of toll-like receptor signaling pathway • positive regulation of protein phosphorylation • male gonad development • positive regulation of inflammatory response • positive regulation of interleukin-12 production • positive regulation of type III interferon production • cellular response to interferon-beta • response to exogenous dsRNA • negative regulation of osteoclast differentiation • GO:0032737 positive regulation of cytokine production • процес імунної системи • response to virus • activation of NF-kappaB-inducing kinase activity • I-kappaB phosphorylation • positive regulation of JNK cascade • hyperosmotic response • cellular response to dsRNA • regulation of dendritic cell cytokine production • microglial cell activation • toll-like receptor signaling pathway • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • cellular response to mechanical stimulus • microglial cell activation involved in immune response • GO:1901313 positive regulation of gene expression • defense response to bacterium • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • defense response to virus • necroptotic signaling pathway • positive regulation of interleukin-8 production • cellular response to exogenous dsRNA • positive regulation of interleukin-6 production • positive regulation of tumor necrosis factor production • cellular response to interferon-gamma • positive regulation of chemokine production • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • detection of virus • inflammatory response • вроджений імунітет • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • toll-like receptor 3 signaling pathway • positive regulation of type I interferon production • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0060554, GO:0060555 Некроптоз • apoptotic signaling pathway • negative regulation of MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • extrinsic apoptotic signaling pathway • positive regulation of angiogenesis • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_126166 NM_001357316 NM_001357317 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_569054 NP_001344245 NP_001344246 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 186.07 – 186.09 Mb | Хр. 8: 45.85 – 45.86 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TLR3 (англ. Toll like receptor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 904 амінокислот, а молекулярна маса — 103 829[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRQTLPCIYF | | WGGLLPFGML | | CASSTTKCTV | | SHEVADCSHL | | KLTQVPDDLP |
TNITVLNLTH | | NQLRRLPAAN | | FTRYSQLTSL | | DVGFNTISKL | | EPELCQKLPM |
LKVLNLQHNE | | LSQLSDKTFA | | FCTNLTELHL | | MSNSIQKIKN | | NPFVKQKNLI |
TLDLSHNGLS | | STKLGTQVQL | | ENLQELLLSN | | NKIQALKSEE | | LDIFANSSLK |
KLELSSNQIK | | EFSPGCFHAI | | GRLFGLFLNN | | VQLGPSLTEK | | LCLELANTSI |
RNLSLSNSQL | | STTSNTTFLG | | LKWTNLTMLD | | LSYNNLNVVG | | NDSFAWLPQL |
EYFFLEYNNI | | QHLFSHSLHG | | LFNVRYLNLK | | RSFTKQSISL | | ASLPKIDDFS |
FQWLKCLEHL | | NMEDNDIPGI | | KSNMFTGLIN | | LKYLSLSNSF | | TSLRTLTNET |
FVSLAHSPLH | | ILNLTKNKIS | | KIESDAFSWL | | GHLEVLDLGL | | NEIGQELTGQ |
EWRGLENIFE | | IYLSYNKYLQ | | LTRNSFALVP | | SLQRLMLRRV | | ALKNVDSSPS |
PFQPLRNLTI | | LDLSNNNIAN | | INDDMLEGLE | | KLEILDLQHN | | NLARLWKHAN |
PGGPIYFLKG | | LSHLHILNLE | | SNGFDEIPVE | | VFKDLFELKI | | IDLGLNNLNT |
LPASVFNNQV | | SLKSLNLQKN | | LITSVEKKVF | | GPAFRNLTEL | | DMRFNPFDCT |
CESIAWFVNW | | INETHTNIPE | | LSSHYLCNTP | | PHYHGFPVRL | | FDTSSCKDSA |
PFELFFMINT | | SILLIFIFIV | | LLIHFEGWRI | | SFYWNVSVHR | | VLGFKEIDRQ |
TEQFEYAAYI | | IHAYKDKDWV | | WEHFSSMEKE | | DQSLKFCLEE | | RDFEAGVFEL |
EAIVNSIKRS | | RKIIFVITHH | | LLKDPLCKRF | | KVHHAVQQAI | | EQNLDSIILV |
FLEEIPDYKL | | NHALCLRRGM | | FKSHCILNWP | | VQKERIGAFR | | HKLQVALGSK |
NSVH |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, ендосомах.
Література
- Rock F.L., Hardiman G., Timans J.C., Kastelein R.A., Bazan J.F. (1998). A family of human receptors structurally related to Drosophila Toll. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 588—593. PMID 9435236 DOI:10.1073/pnas.95.2.588
- Lafon M., Megret F., Lafage M., Prehaud C. (2006). The innate immune facet of brain: human neurons express TLR-3 and sense viral dsRNA. J. Mol. Neurosci. 29: 185—194. PMID 17085778 DOI:10.1385/JMN:29:3:185
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
- Oshiumi H., Matsumoto M., Funami K., Akazawa T., Seya T. (2003). TICAM-1, an adapter molecule that participates in Toll-like receptor 3 mediated interferon-beta induction. Nat. Immunol. 4: 161—167. PMID 12539043 DOI:10.1038/ni886
- Bell J.K., Askins J., Hall P.R., Davies D.R., Segal D.M. (2006). The dsRNA binding site of human Toll-like receptor 3. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 8792—8797. PMID 16720699 DOI:10.1073/pnas.0603245103
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TLR3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11849 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O15455 (англ.) . Архів оригіналу за 30 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації |
---|
| 1-50 | |
---|
| 51-100 | |
---|
| 101-150 | |
---|
| 151-200 | |
---|
| 201-250 | |
---|
| 251-300 | |
---|
| 301-350 | |
---|
|