ITGB4 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | |
---|
Зовнішні ІД | GeneCards: [1] |
---|
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | н/д | н/д |
---|
PubMed search | н/д | н/д |
---|
Вікідані |
|
ITGB4 (англ. Integrin subunit beta 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[1] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 822 амінокислот, а молекулярна маса — 202 167[2].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAGPRPSPWA | | RLLLAALISV | | SLSGTLANRC | | KKAPVKSCTE | | CVRVDKDCAY |
CTDEMFRDRR | | CNTQAELLAA | | GCQRESIVVM | | ESSFQITEET | | QIDTTLRRSQ |
MSPQGLRVRL | | RPGEERHFEL | | EVFEPLESPV | | DLYILMDFSN | | SMSDDLDNLK |
KMGQNLARVL | | SQLTSDYTIG | | FGKFVDKVSV | | PQTDMRPEKL | | KEPWPNSDPP |
FSFKNVISLT | | EDVDEFRNKL | | QGERISGNLD | | APEGGFDAIL | | QTAVCTRDIG |
WRPDSTHLLV | | FSTESAFHYE | | ADGANVLAGI | | MSRNDERCHL | | DTTGTYTQYR |
TQDYPSVPTL | | VRLLAKHNII | | PIFAVTNYSY | | SYYEKLHTYF | | PVSSLGVLQE |
DSSNIVELLE | | EAFNRIRSNL | | DIRALDSPRG | | LRTEVTSKMF | | QKTRTGSFHI |
RRGEVGIYQV | | QLRALEHVDG | | THVCQLPEDQ | | KGNIHLKPSF | | SDGLKMDAGI |
ICDVCTCELQ | | KEVRSARCSF | | NGDFVCGQCV | | CSEGWSGQTC | | NCSTGSLSDI |
QPCLREGEDK | | PCSGRGECQC | | GHCVCYGEGR | | YEGQFCEYDN | | FQCPRTSGFL |
CNDRGRCSMG | | QCVCEPGWTG | | PSCDCPLSNA | | TCIDSNGGIC | | NGRGHCECGR |
CHCHQQSLYT | | DTICEINYSA | | IHPGLCEDLR | | SCVQCQAWGT | | GEKKGRTCEE |
CNFKVKMVDE | | LKRAEEVVVR | | CSFRDEDDDC | | TYSYTMEGDG | | APGPNSTVLV |
HKKKDCPPGS | | FWWLIPLLLL | | LLPLLALLLL | | LCWKYCACCK | | ACLALLPCCN |
RGHMVGFKED | | HYMLRENLMA | | SDHLDTPMLR | | SGNLKGRDVV | | RWKVTNNMQR |
PGFATHAASI | | NPTELVPYGL | | SLRLARLCTE | | NLLKPDTREC | | AQLRQEVEEN |
LNEVYRQISG | | VHKLQQTKFR | | QQPNAGKKQD | | HTIVDTVLMA | | PRSAKPALLK |
LTEKQVEQRA | | FHDLKVAPGY | | YTLTADQDAR | | GMVEFQEGVE | | LVDVRVPLFI |
RPEDDDEKQL | | LVEAIDVPAG | | TATLGRRLVN | | ITIIKEQARD | | VVSFEQPEFS |
VSRGDQVARI | | PVIRRVLDGG | | KSQVSYRTQD | | GTAQGNRDYI | | PVEGELLFQP |
GEAWKELQVK | | LLELQEVDSL | | LRGRQVRRFH | | VQLSNPKFGA | | HLGQPHSTTI |
IIRDPDELDR | | SFTSQMLSSQ | | PPPHGDLGAP | | QNPNAKAAGS | | RKIHFNWLPP |
SGKPMGYRVK | | YWIQGDSESE | | AHLLDSKVPS | | VELTNLYPYC | | DYEMKVCAYG |
AQGEGPYSSL | | VSCRTHQEVP | | SEPGRLAFNV | | VSSTVTQLSW | | AEPAETNGEI |
TAYEVCYGLV | | NDDNRPIGPM | | KKVLVDNPKN | | RMLLIENLRE | | SQPYRYTVKA |
RNGAGWGPER | | EAIINLATQP | | KRPMSIPIIP | | DIPIVDAQSG | | EDYDSFLMYS |
DDVLRSPSGS | | QRPSVSDDTG | | CGWKFEPLLG | | EELDLRRVTW | | RLPPELIPRL |
SASSGRSSDA | | EAPHGPPDDG | | GAGGKGGSLP | | RSATPGPPGE | | HLVNGRMDFA |
FPGSTNSLHR | | MTTTSAAAYG | | THLSPHVPHR | | VLSTSSTLTR | | DYNSLTRSEH |
SHSTTLPRDY | | STLTSVSSHD | | SRLTAGVPDT | | PTRLVFSALG | | PTSLRVSWQE |
PRCERPLQGY | | SVEYQLLNGG | | ELHRLNIPNP | | AQTSVVVEDL | | LPNHSYVFRV |
RAQSQEGWGR | | EREGVITIES | | QVHPQSPLCP | | LPGSAFTLST | | PSAPGPLVFT |
ALSPDSLQLS | | WERPRRPNGD | | IVGYLVTCEM | | AQGGGPATAF | | RVDGDSPESR |
LTVPGLSENV | | PYKFKVQART | | TEGFGPEREG | | IITIESQDGG | | PFPQLGSRAG |
LFQHPLQSEY | | SSITTTHTSA | | TEPFLVDGLT | | LGAQHLEAGG | | SLTRHVTQEF |
VSRTLTTSGT | | LSTHMDQQFF | | QT |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.
Література
- Iacovacci S., Gagnoux-Palacios L., Zambruno G., Meneguzzi G., D'Alessio M. (1997). Genomic organization of the human integrin beta 4 gene. Mamm. Genome. 8: 448—450. PMID 9166594 DOI:10.1007/s003359900467
- van Leusden M.R., Kuikman I., Sonnenberg A. (1997). The unique cytoplasmic domain of the human integrin variant beta4E is produced by partial retention of intronic sequences. Biochem. Biophys. Res. Commun. 235: 826—830. PMID 9207246 DOI:10.1006/bbrc.1997.6892
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hopkinson S.B., Jones J.C. (2000). The N terminus of the transmembrane protein BP180 interacts with the N-terminal domain of BP230, thereby mediating keratin cytoskeleton anchorage to the cell surface at the site of the hemidesmosome. Mol. Biol. Cell. 11: 277—286. PMID 10637308 DOI:10.1091/mbc.11.1.277
- Koster J., Geerts D., Favre B., Borradori L., Sonnenberg A. (2003). Analysis of the interactions between BP180, BP230, plectin and the integrin alpha6beta4 important for hemidesmosome assembly. J. Cell Sci. 116: 387—399. PMID 12482924 DOI:10.1242/jcs.00241
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6158 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P16144 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації |
---|
| 1-50 | |
---|
| 51-100 | |
---|
| 101-150 | |
---|
| 151-200 | |
---|
| 201-250 | |
---|
| 251-300 | |
---|
| 301-350 | |
---|
|