COL24A1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | COL24A1, collagen, type XXIV, alpha 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610025 MGI: 1918605 HomoloGene: 65061 GeneCards: COL24A1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • extracellular matrix structural constituent • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • колаген • endoplasmic reticulum lumen • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • hematopoietic progenitor cell differentiation • extracellular matrix organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | н/д | Хр. 3: 145 – 145.26 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
COL24A1 (англ. Collagen type XXIV alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 714 амінокислот, а молекулярна маса — 175 496[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MHLRAHRTRR | | GKVSPTAKTK | | SLLHFIVLCV | | AGVVVHAQEQ | | GIDILHQLGL |
GGKDVRHSSP | | ATAVPSASTP | | LPQGVHLTES | | GVIFKNDAYI | | ETPFVKILPV |
NLGQPFTILT | | GLQSHRVNNA | | FLFSIRNKNR | | LQLGVQLLPK | | KLVVHIRGKQ |
PAVFNYSVHD | | EQWHSFAITI | | RNQSVSMFVE | | CGKKYFSTET | | IPEVQTFDSN |
SVFTLGSMNN | | NSIHFEGIVC | | QLDIIPSAEA | | SADYCRYVKQ | | QCRQADKYQP |
ETSIPCTTLI | | PTKIPEHSPP | | PKLFAEKVLS | | EDTFTEGKSI | | PNIIKNDSET |
VYKRQEHQIS | | RSQLSSLQSG | | NVSAVDLTNH | | GIQAKEMITE | | EDTQTNFSLS |
VTTHRISEAK | | MNTKEKFSSL | | LNMSDNITQH | | DDRVTGLSLF | | KKMPSILPQI |
KQDTITNLKK | | AITANLHTNE | | LMEMQPILNT | | SLHRVTNEPS | | VDNHLDLRKE |
GEFYPDATYP | | IENSYETELY | | DYYYYEDLNT | | MLEMEYLRGP | | KGDTGPPGPP |
GPAGIPGPSG | | KRGPRGIPGP | | HGNPGLPGLP | | GPKGPKGDPG | | FSPGQPVPGE |
KGDQGLSGLM | | GPPGMQGDKG | | LKGHPGLPGL | | PGEQGIPGFA | | GNIGSPGYPG |
RQGLAGPEGN | | PGPKGAQGFI | | GSPGEAGQLG | | PEGERGIPGI | | RGKKGFKGRQ |
GFPGDFGDRG | | PAGLDGSPGL | | VGGTGPPGFP | | GLRGSVGPVG | | PIGPAGIPGP |
MGLSGNKGLP | | GIKGDKGEQG | | TAGELGEPGY | | PGDKGAVGLP | | GPPGMRGKSG |
PSGQTGDPGL | | QGPSGPPGPE | | GFPGDIGIPG | | QNGPEGPKGL | | LGNRGPPGPP |
GLKGTQGEEG | | PIGAFGELGP | | RGKPGQKGYA | | GEPGPEGLKG | | EVGDQGNIGK |
IGETGPVGLP | | GEVGMTGSIG | | EKGERGSPGP | | LGPQGEKGVM | | GYPGPPGVPG |
PIGPLGLPGH | | VGARGPPGSQ | | GPKGQRGSRG | | PDGLLGEQGI | | QGAKGEKGDQ |
GKRGPHGLIG | | KTGNPGERGF | | QGKPGLQGLP | | GSTGDRGLPG | | EPGLRGLQGD |
VGPPGEMGME | | GPPGTEGESG | | LQGEPGAKGD | | VGTAGSVGGT | | GEPGLRGEPG |
APGEEGLQGK | | DGLKGVPGGR | | GLPGEDGEKG | | EMGLPGIIGP | | LGRSGQTGLP |
GPEGIVGIPG | | QRGRPGKKGD | | KGQIGPTGEV | | GSRGPPGKIG | | KSGPKGARGT |
RGAVGHLGLM | | GPDGEPGIPG | | YRGHQGQPGP | | SGLPGPKGEK | | GYPGEDSTVL |
GPPGPRGEPG | | PVGDQGERGE | | PGAEGYKGHV | | GVPGLRGATG | | QQGPPGEPGD |
QGEQGLKGER | | GSEGNKGKKG | | APGPSGKPGI | | PGLQGLLGPK | | GIQGYHGADG |
ISGNPGKIGP | | PGKQGLPGIR | | GGPGRTGLAG | | APGPPGVKGS | | SGLPGSPGIQ |
GPKGEQGLPG | | QPGIQGKRGH | | RGAQGDQGPC | | GDPGLKGQPG | | EYGVQGLTGF |
QGFPGPKGPE | | GDAGIVGISG | | PKGPIGHRGN | | TGPLGREGII | | GPTGRTGPRG |
EKGFRGETGP | | QGPRGQPGPP | | GPPGAPGPRK | | QMDINAAIQA | | LIESNTALQM |
ESYQNTEVTL | | IDHSEEIFKT | | LNYLSNLLHS | | IKNPLGTRDN | | PARICKDLLN |
CEQKVSDGKY | | WIDPNLGCPS | | DAIEVFCNFS | | AGGQTCLPPV | | SVTKLEFGVG |
KVQMNFLHLL | | SSEATHIITI | | HCLNTPRWTS | | TQTSGPGLPI | | GFKGWNGQIF |
KVNTLLEPKV | | LSDDCKIQDG | | SWHKATFLFH | | TQEPNQLPVI | | EVQKLPHLKT |
ERKYYIDSSS | | VCFL |
Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20821 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 25 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q17RW2 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |