PPL |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PPL, periplakin |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602871 MGI: 1194898 HomoloGene: 2026 GeneCards: PPL |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • structural constituent of cytoskeleton • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cadherin binding • structural molecule activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • Десмосома • екзосома • цитоскелет • мембрана • мітохондрія • клітинне ядро • cornified envelope • гіалоплазма • Проміжні філаменти |
---|
Біологічний процес | • keratinization • cytoskeleton organization • cornification • response to mechanical stimulus • Загоєння ран • intermediate filament cytoskeleton organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 4.88 – 4.96 Mb | Хр. 16: 4.9 – 4.95 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PPL (англ. Periplakin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 756 амінокислот, а молекулярна маса — 204 747[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNSLFRKRNK | | GKYSPTVQTR | | SISNKELSEL | | IEQLQKNADQ | | VEKNIVDTEA |
KMQSDLARLQ | | EGRQPEHRDV | | TLQKVLDSEK | | LLYVLEADAA | | IAKHMKHPQG |
DMIAEDIRQL | | KERVTNLRGK | | HKQIYRLAVK | | EVDPQVNWAA | | LVEEKLDKLN |
NQSFGTDLPL | | VDHQVEEHNI | | FHNEVKAIGP | | HLAKDGDKEQ | | NSELRAKYQK |
LLAASQARQQ | | HLSSLQDYMQ | | RCTNELYWLD | | QQAKGRMQYD | | WSDRNLDYPS |
RRRQYENFIN | | RNLEAKEERI | | NKLHSEGDQL | | LAAEHPGRNS | | IEAHMEAVHA |
DWKEYLNLLI | | CEESHLKYME | | DYHQFHEDVK | | DAQELLRKVD | | SDLNQKYGPD |
FKDRYQIELL | | LRELDDQEKV | | LDKYEDVVQG | | LQKRGQQVVP | | LKYRRETPLK |
PIPVEALCDF | | EGEQGLISRG | | YSYTLQKNNG | | ESWELMDSAG | | NKLIAPAVCF |
VIPPTDPEAL | | ALADSLGSQY | | RSVRQKAAGS | | KRTLQQRYEV | | LKTENPGDAS |
DLQGRQLLAG | | LDKVASDLDR | | QEKAITGILR | | PPLEQGRAVQ | | DSAERAKDLK |
NITNELLRIE | | PEKTRSTAEG | | EAFIQALPGS | | GTTPLLRTRV | | EDTNRKYEHL |
LQLLDLAQEK | | VDVANRLEKS | | LQQSWELLAT | | HENHLNQDDT | | VPESSRVLDS |
KGQELAAMAC | | ELQAQKSLLG | | EVEQNLQAAK | | QCSSTLASRF | | QEHCPDLERQ |
EAEVHKLGQR | | FNNLRQQVER | | RAQSLQSAKA | | AYEHFHRGHD | | HVLQFLVSIP |
SYEPQETDSL | | SQMETKLKNQ | | KNLLDEIASR | | EQEVQKICAN | | SQQYQQAVKD |
YELEAEKLRS | | LLDLENGRRS | | HVSKRARLQS | | PATKVKEEEA | | ALAAKFTEVY |
AINRQRLQNL | | EFALNLLRQQ | | PEVEVTHETL | | QRNRPDSGVE | | EAWKIRKELD |
EETERRRQLE | | NEVKSTQEEI | | WTLRNQGPQE | | SVVRKEVLKK | | VPDPVLEESF |
QQLQRTLAEE | | QHKNQLLQEE | | LEALQLQLRA | | LEQETRDGGQ | | EYVVKEVLRI |
EPDRAQADEV | | LQLREELEAL | | RRQKGAREAE | | VLLLQQRVAA | | LAEEKSRAQE |
KVTEKEVVKL | | QNDPQLEAEY | | QQLQEDHQRQ | | DQLREKQEEE | | LSFLQDKLKR |
LEKERAMAEG | | KITVKEVLKV | | EKDAATEREV | | SDLTRQYEDE | | AAKARASQRE |
KTELLRKIWA | | LEEENAKVVV | | QEKVREIVRP | | DPKAESEVAN | | LRLELVEQER |
KYRGAEEQLR | | SYQSELEALR | | RRGPQVEVKE | | VTKEVIKYKT | | DPEMEKELQR |
LREEIVDKTR | | LIERCDLEIY | | QLKKEIQALK | | DTKPQVQTKE | | VVQEILQFQE |
DPQTKEEVAS | | LRAKLSEEQK | | KQVDLERERA | | SQEEQIARKE | | EELSRVKERV |
VQQEVVRYEE | | EPGLRAEASA | | FAESIDVELR | | QIDKLRAELR | | RLQRRRTELE |
RQLEELERER | | QARREAEREV | | QRLQQRLAAL | | EQEEAEAREK | | VTHTQKVVLQ |
QDPQQAREHA | | LLRLQLEEEQ | | HRRQLLEGEL | | ETLRRKLAAL | | EKAEVKEKVV |
LSESVQVEKG | | DTEQEIQRLK | | SSLEEESRSK | | RELDVEVSRL | | EARLSELEFH |
NSKSSKELDF | | LREENHKLQL | | ERQNLQLETR | | RLQSEINMAA | | TETRDLRNMT |
VADSGTNHDS | | RLWSLERELD | | DLKRLSKDKD | | LEIDELQKRL | | GSVAVKREQR |
ENHLRRSIVV | | IHPDTGRELS | | PEEAHRAGLI | | DWNMFVKLRS | | QECDWEEISV |
KGPNGESSVI | | HDRKSGKKFS | | IEEALQSGRL | | TPAQYDRYVN | | KDMSIQELAV |
LVSGQK |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як кератинізація. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, мітохондрії, клітинних контактах.
Література
- Ruhrberg C., Hajibagheri M.A.N., Parry D.A.D., Watt F.M. (1997). Periplakin, a novel component of cornified envelopes and desmosomes that belongs to the plakin family and forms complexes with envoplakin. J. Cell Biol. 139: 1835—1849. PMID 9412476 DOI:10.1083/jcb.139.7.1835
- Aho S., McLean W.H.I., Li K., Uitto J. (1998). cDNA cloning, mRNA expression, and chromosomal mapping of human and mouse periplakin genes. Genomics. 48: 242—247. PMID 9521878 DOI:10.1006/geno.1997.5188
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beekman J.M., Bakema J.E., van de Winkel J.G.J., Leusen J.H.W. (2004). Direct interaction between FcgammaRI (CD64) and periplakin controls receptor endocytosis and ligand binding capacity. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 10392—10397. PMID 15229321 DOI:10.1073/pnas.0401217101
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9273 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O60437 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
Незгруповані альфа | |
---|
Не-альфа | |
---|
|
---|
Тип 3 | |
---|
Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
Тип 5 | |
---|
|
---|
Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
Катеніни | |
---|
Мембранні | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Нелюдські | |
---|