MYO9B |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 5C5S, 5HPY | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | MYO9B, CELIAC4, MYR5, myosin IXB |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602129 MGI: 106624 HomoloGene: 3058 GeneCards: MYO9B |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • protein homodimerization activity • зв'язування з іоном металу • calmodulin binding • microfilament motor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • cytoskeletal motor activity • ATP binding • Roundabout binding • ADP binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • ATPase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • мембрана • cell cortex • actin cytoskeleton • perinuclear region of cytoplasm • цитоскелет • myosin complex • мікрофіламент • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • GO:0007243 intracellular signal transduction • ARF protein signal transduction • Roundabout signaling pathway • actin filament-based movement • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of Rho protein signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція • Rho protein signal transduction |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001142322 NM_001142323 NM_015742 |
|
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 17.08 – 17.21 Mb | Хр. 8: 71.73 – 71.81 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
MYO9B (англ. Myosin IXB) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 157 амінокислот, а молекулярна маса — 243 401[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSVKEAGSSG | | RREQAAYHLH | | IYPQLSTTES | | QASCRVTATK | | DSTTSDVIKD |
AIASLRLDGT | | KCYVLVEVKE | | SGGEEWVLDA | | NDSPVHRVLL | | WPRRAQDEHP |
QEDGYYFLLQ | | ERNADGTIKY | | VHMQLVAQAT | | ATRRLVERGL | | LPRQQADFDD |
LCNLPELTEG | | NLLKNLKHRF | | LQQKIYTYAG | | SILVAINPFK | | FLPIYNPKYV |
KMYENQQLGK | | LEPHVFALAD | | VAYYTMLRKR | | VNQCIVISGE | | SGSGKTQSTN |
FLIHCLTALS | | QKGYASGVER | | TILGAGPVLE | | AFGNAKTAHN | | NNSSRFGKFI |
QVSYLESGIV | | RGAVVEKYLL | | EKSRLVSQEK | | DERNYHVFYY | | LLLGVSEEER |
QEFQLKQPED | | YFYLNQHNLK | | IEDGEDLKHD | | FERLKQAMEM | | VGFLPATKKQ |
IFAVLSAILY | | LGNVTYKKRA | | TGREEGLEVG | | PPEVLDTLSQ | | LLKVKREILV |
EVLTKRKTVT | | VNDKLILPYS | | LSEAITARDS | | MAKSLYSALF | | DWIVLRINHA |
LLNKKDVEEA | | VSCLSIGVLD | | IFGFEDFERN | | SFEQFCINYA | | NEQLQYYFNQ |
HIFKLEQEEY | | QGEGITWHNI | | GYTDNVGCIH | | LISKKPTGLF | | YLLDEESNFP |
HATSQTLLAK | | FKQQHEDNKY | | FLGTPVMEPA | | FIIQHFAGKV | | KYQIKDFREK |
NMDYMRPDIV | | ALLRGSDSSY | | VRELIGMDPV | | AVFRWAVLRA | | AIRAMAVLRE |
AGRLRAERAE | | KAAGMSSPGA | | QSHPEELPRG | | ASTPSEKLYR | | DLHNQMIKSI |
KGLPWQGEDP | | RSLLQSLSRL | | QKPRAFILKS | | KGIKQKQIIP | | KNLLDSKSLK |
LIISMTLHDR | | TTKSLLHLHK | | KKKPPSISAQ | | FQTSLNKLLE | | ALGKAEPFFI |
RCIRSNAEKK | | ELCFDDELVL | | QQLRYTGMLE | | TVRIRRSGYS | | AKYTFQDFTE |
QFQVLLPKDA | | QPCREVISTL | | LEKMKIDKRN | | YQIGKTKVFL | | KETERQALQE |
TLHREVVRKI | | LLLQSWFRMV | | LERRHFLQMK | | RAAVTIQACW | | RSYRVRRALE |
RTQAAVYLQA | | SWRGYWQRKL | | YRHQKQSIIR | | LQSLCRGHLQ | | RKSFSQMISE |
KQKAEEKERE | | ALEAARAGAE | | EGGQGQAAGG | | QQVAEQGPEP | | AEDGGHLASE |
PEVQPSDRSP | | LEHSSPEKEA | | PSPEKTLPPQ | | KTVAAESHEK | | VPSSREKRES |
RRQRGLEHVK | | FQNKHIQSCK | | EESALREPSR | | RVTQEQGVSL | | LEDKKESRED |
ETLLVVETEA | | ENTSQKQPTE | | QPQAMAVGKV | | SEETEKTLPS | | GSPRPGQLER |
PTSLALDSRV | | SPPAPGSAPE | | TPEDKSKPCG | | SPRVQEKPDS | | PGGSTQIQRY |
LDAERLASAV | | ELWRGKKLVA | | AASPSAMLSQ | | SLDLSDRHRA | | TGAALTPTEE |
RRTSFSTSDV | | SKLLPSLAKA | | QPAAETTDGE | | RSAKKPAVQK | | KKPGDASSLP |
DAGLSPGSQV | | DSKSTFKRLF | | LHKTKDKKYS | | LEGAEELENA | | VSGHVVLEAT |
TMKKGLEAPS | | GQQHRHAAGE | | KRTKEPGGKG | | KKNRNVKIGK | | ITVSEKWRES |
VFRQITNANE | | LKYLDEFLLN | | KINDLRSQKT | | PIESLFIEAT | | EKFRSNIKTM |
YSVPNGKIHV | | GYKDLMENYQ | | IVVSNLATER | | GQKDTNLVLN | | LFQSLLDEFT |
RGYTKNDFEP | | VKQSKAQKKK | | RKQERAVQEH | | NGHVFASYQV | | SIPQSCEQCL |
SYIWLMDKAL | | LCSVCKMTCH | | KKCVHKIQSH | | CSYTYGRKGE | | PGVEPGHFGV |
CVDSLTSDKA | | SVPIVLEKLL | | EHVEMHGLYT | | EGLYRKSGAA | | NRTRELRQAL |
QTDPAAVKLE | | NFPIHAITGV | | LKQWLRELPE | | PLMTFAQYGD | | FLRAVELPEK |
QEQLAAIYAV | | LEHLPEANHN | | SLERLIFHLV | | KVALLEDVNR | | MSPGALAIIF |
APCLLRCPDN | | SDPLTSMKDV | | LKITTCVEML | | IKEQMRKYKV | | KMEEISQLEA |
AESIAFRRLS | | LLRQNAPWPL | | KLGFSSPYEG | | VLNKSPKTRD | | IQEEELEVLL |
EEEAAGGDED | | REKEILIERI | | QSIKEEKEDI | | TYRLPELDPR | | GSDEENLDSE |
TSASTESLLE | | ERAGRGASEG | | PPAPALPCPG | | APTPSPLPTV | | AAPPRRRPSS |
FVTVRVKTPR | | RTPIMPTANI | | KLPPGLPSHL | | PRWAPGAREA | | AAPVRRREPP |
ARRPDQIHSV | | YITPGADLPV | | QGALEPLEED | | GQPPGAKRRY | | SDPPTYCLPP |
ASGQTNG |
Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, міозинів, активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою актину, молекулою кальмодуліну, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
- Wirth J.A., Jensen K.A., Post P.L., Bement W.M., Mooseker M.S. (1996). Human myosin-IXb, an unconventional myosin with a chimerin-like rho/rac GTPase-activating protein domain in its tail. J. Cell Sci. 109: 653—661. PMID 8907710
- Post P.L., Bokoch G.M., Mooseker M.S. (1998). Human myosin-IXb is a mechanochemically active motor and a GAP for rho. J. Cell Sci. 111: 941—950. PMID 9490638
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7609 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q13459 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
Незгруповані альфа | |
---|
Не-альфа | |
---|
|
---|
Тип 3 | |
---|
Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
Тип 5 | |
---|
|
---|
Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
Катеніни | |
---|
Мембранні | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Нелюдські | |
---|