KIF5C |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1VFV, 1VFW, 1VFX, 1VFZ, 3J6H, 3WRD, 3X2T | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | KIF5C, CDCBM2, KINN, NKHC, NKHC-2, NKHC2, kinesin family member 5C |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604593 MGI: 1098269 HomoloGene: 56234 GeneCards: KIF5C |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
complex cortical dysplasia with other brain malformations 2[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • microtubule motor activity • nucleotide binding • microtubule binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • plus-end-directed microtubule motor activity • ATP binding • ATPase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • Кінезин • ciliary rootlet • neuron projection • мікротрубочка • цитоскелет • дендрит (нейробіологія) • dendrite cytoplasm • cell projection • neuronal cell body • axonal growth cone • синапс • distal axon • axon cytoplasm |
---|
Біологічний процес | • GO:0034613 protein localization • cytoskeleton-dependent intracellular transport • mRNA transport • organelle organization • axon guidance • microtubule-based movement • motor neuron axon guidance • synaptic vesicle transport • anterograde dendritic transport of neurotransmitter receptor complex • anterograde axonal protein transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000168280 ENSG00000276734 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 148.88 – 149.03 Mb | Хр. 2: 49.51 – 49.66 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
KIF5C (англ. Kinesin family member 5C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 957 амінокислот, а молекулярна маса — 109 495[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MADPAECSIK | | VMCRFRPLNE | | AEILRGDKFI | | PKFKGDETVV | | IGQGKPYVFD |
RVLPPNTTQE | | QVYNACAKQI | | VKDVLEGYNG | | TIFAYGQTSS | | GKTHTMEGKL |
HDPQLMGIIP | | RIAHDIFDHI | | YSMDENLEFH | | IKVSYFEIYL | | DKIRDLLDVS |
KTNLAVHEDK | | NRVPYVKGCT | | ERFVSSPEEV | | MDVIDEGKAN | | RHVAVTNMNE |
HSSRSHSIFL | | INIKQENVET | | EKKLSGKLYL | | VDLAGSEKVS | | KTGAEGAVLD |
EAKNINKSLS | | ALGNVISALA | | EGTKTHVPYR | | DSKMTRILQD | | SLGGNCRTTI |
VICCSPSVFN | | EAETKSTLMF | | GQRAKTIKNT | | VSVNLELTAE | | EWKKKYEKEK |
EKNKTLKNVI | | QHLEMELNRW | | RNGEAVPEDE | | QISAKDQKNL | | EPCDNTPIID |
NIAPVVAGIS | | TEEKEKYDEE | | ISSLYRQLDD | | KDDEINQQSQ | | LAEKLKQQML |
DQDELLASTR | | RDYEKIQEEL | | TRLQIENEAA | | KDEVKEVLQA | | LEELAVNYDQ |
KSQEVEDKTR | | ANEQLTDELA | | QKTTTLTTTQ | | RELSQLQELS | | NHQKKRATEI |
LNLLLKDLGE | | IGGIIGTNDV | | KTLADVNGVI | | EEEFTMARLY | | ISKMKSEVKS |
LVNRSKQLES | | AQMDSNRKMN | | ASERELAACQ | | LLISQHEAKI | | KSLTDYMQNM |
EQKRRQLEES | | QDSLSEELAK | | LRAQEKMHEV | | SFQDKEKEHL | | TRLQDAEEMK |
KALEQQMESH | | REAHQKQLSR | | LRDEIEEKQK | | IIDEIRDLNQ | | KLQLEQEKLS |
SDYNKLKIED | | QEREMKLEKL | | LLLNDKREQA | | REDLKGLEET | | VSRELQTLHN |
LRKLFVQDLT | | TRVKKSVELD | | NDDGGGSAAQ | | KQKISFLENN | | LEQLTKVHKQ |
LVRDNADLRC | | ELPKLEKRLR | | ATAERVKALE | | SALKEAKENA | | MRDRKRYQQE |
VDRIKEAVRA | | KNMARRAHSA | | QIAKPIRPGH | | YPASSPTAVH | | AIRGGGGSSS |
NSTHYQK |
Кодований геном білок за функцією належить до білкових моторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Brickley K., Smith M.J., Beck M., Stephenson F.A. (2005). GRIF-1 and OIP106, members of a novel gene family of coiled-coil domain proteins: association in vivo and in vitro with kinesin. J. Biol. Chem. 280: 14723—14732. PMID 15644324 DOI:10.1074/jbc.M409095200
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з KIF5C переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6325 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O60282 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
Незгруповані альфа | |
---|
Не-альфа | |
---|
|
---|
Тип 3 | |
---|
Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
Тип 5 | |
---|
|
---|
Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
Катеніни | |
---|
Мембранні | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Нелюдські | |
---|