KIF5A |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4UXT, 4UXY, 4UY0 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | KIF5A, D12S1889, MY050, NKHC, SPG10, kinesin family member 5A, NEIMY, ALS25 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602821 MGI: 109564 HomoloGene: 55861 GeneCards: KIF5A |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ревматоїдний артрит, hereditary spastic paraplegia 10[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • microtubule motor activity • microtubule binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cytoskeletal motor activity • plus-end-directed microtubule motor activity • ATP binding • kinesin binding • ATPase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • Кінезин • neuronal cell body • ciliary rootlet • perinuclear region of cytoplasm • neuron projection • мікротрубочка • цитоскелет • dendrite cytoplasm • синапс • axon cytoplasm |
---|
Біологічний процес | • GO:0034613 protein localization • cytoskeleton-dependent intracellular transport • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • axon guidance • chemical synaptic transmission • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • vesicle-mediated transport • microtubule-based movement • anterograde dendritic transport of neurotransmitter receptor complex • synaptic vesicle transport • anterograde axonal protein transport • retrograde neuronal dense core vesicle transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_004984 NM_001354705 NM_032624 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 57.55 – 57.59 Mb | Хр. 10: 127.06 – 127.1 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
KIF5A (англ. Kinesin family member 5A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 032 амінокислот, а молекулярна маса — 117 378[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAETNNECSI | | KVLCRFRPLN | | QAEILRGDKF | | IPIFQGDDSV | | VIGGKPYVFD |
RVFPPNTTQE | | QVYHACAMQI | | VKDVLAGYNG | | TIFAYGQTSS | | GKTHTMEGKL |
HDPQLMGIIP | | RIARDIFNHI | | YSMDENLEFH | | IKVSYFEIYL | | DKIRDLLDVT |
KTNLSVHEDK | | NRVPFVKGCT | | ERFVSSPEEI | | LDVIDEGKSN | | RHVAVTNMNE |
HSSRSHSIFL | | INIKQENMET | | EQKLSGKLYL | | VDLAGSEKVS | | KTGAEGAVLD |
EAKNINKSLS | | ALGNVISALA | | EGTKSYVPYR | | DSKMTRILQD | | SLGGNCRTTM |
FICCSPSSYN | | DAETKSTLMF | | GQRAKTIKNT | | ASVNLELTAE | | QWKKKYEKEK |
EKTKAQKETI | | AKLEAELSRW | | RNGENVPETE | | RLAGEEAALG | | AELCEETPVN |
DNSSIVVRIA | | PEERQKYEEE | | IRRLYKQLDD | | KDDEINQQSQ | | LIEKLKQQML |
DQEELLVSTR | | GDNEKVQREL | | SHLQSENDAA | | KDEVKEVLQA | | LEELAVNYDQ |
KSQEVEEKSQ | | QNQLLVDELS | | QKVATMLSLE | | SELQRLQEVS | | GHQRKRIAEV |
LNGLMKDLSE | | FSVIVGNGEI | | KLPVEISGAI | | EEEFTVARLY | | ISKIKSEVKS |
VVKRCRQLEN | | LQVECHRKME | | VTGRELSSCQ | | LLISQHEAKI | | RSLTEYMQSV |
ELKKRHLEES | | YDSLSDELAK | | LQAQETVHEV | | ALKDKEPDTQ | | DADEVKKALE |
LQMESHREAH | | HRQLARLRDE | | INEKQKTIDE | | LKDLNQKLQL | | ELEKLQADYE |
KLKSEEHEKS | | TKLQELTFLY | | ERHEQSKQDL | | KGLEETVARE | | LQTLHNLRKL |
FVQDVTTRVK | | KSAEMEPEDS | | GGIHSQKQKI | | SFLENNLEQL | | TKVHKQLVRD |
NADLRCELPK | | LEKRLRATAE | | RVKALEGALK | | EAKEGAMKDK | | RRYQQEVDRI |
KEAVRYKSSG | | KRGHSAQIAK | | PVRPGHYPAS | | SPTNPYGTRS | | PECISYTNSL |
FQNYQNLYLQ | | ATPSSTSDMY | | FANSCTSSGA | | TSSGGPLASY | | QKANMDNGNA |
TDINDNRSDL | | PCGYEAEDQA | | KLFPLHQETA | | AS |
Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- Niclas J., Navone F., Hom-Booher N., Vale R.D. (1994). Cloning and localization of a conventional kinesin motor expressed exclusively in neurons. Neuron. 12: 1059—1072. PMID 7514426 DOI:10.1016/0896-6273(94)90314-X
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Blair M.A., Ma S., Hedera P. (2006). Mutation in KIF5A can also cause adult-onset hereditary spastic paraplegia. Neurogenetics. 7: 47—50. PMID 16489470 DOI:10.1007/s10048-005-0027-8
- DaRe J.T., Vasta V., Penn J., Tran N.T., Hahn S.H. (2013). Targeted exome sequencing for mitochondrial disorders reveals high genetic heterogeneity. BMC Med. Genet. 14: 118—118. PMID 24215330 DOI:10.1186/1471-2350-14-118
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з KIF5A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6323 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q12840 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
Незгруповані альфа | |
---|
Не-альфа | |
---|
|
---|
Тип 3 | |
---|
Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
Тип 5 | |
---|
|
---|
Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
Катеніни | |
---|
Мембранні | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Нелюдські | |
---|