KCNK1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3UKM

Ідентифікатори

Символи

KCNK1, DPK, HOHO, K2P1, K2p1.1, KCNO1, TWIK-1, TWIK1, potassium two pore domain channel subfamily K member 1

Зовнішні ІД

OMIM: 601745 MGI: 109322 HomoloGene: 1691 GeneCards: KCNK1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• sodium channel activity • potassium ion leak channel activity • voltage-gated potassium channel activity • inward rectifier potassium channel activity • potassium channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • recycling endosome • перикаріон • ендосома • cell projection • мембрана • voltage-gated potassium channel complex • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • синапс • inward rectifier potassium channel complex • brush border membrane • міжклітинні контакти • дендрит (нейробіологія) • potassium channel complex • apical plasma membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • внутрішньоклітинна мембранна органела
Біологічний процес	• sodium ion transmembrane transport • response to nicotine • ion transport • potassium ion transport • cardiac conduction • potassium ion transmembrane transport • regulation of resting membrane potential • stabilization of membrane potential
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3775


16525

Ensembl


ENSG00000135750


ENSMUSG00000033998

UniProt


O00180


O08581

RefSeq (мРНК)


NM_002245


NM_008430

RefSeq (білок)


NP_002236


NP_032456

Локус (UCSC)

Хр. 1: 233.61 – 233.67 Mb

Хр. 8: 126.72 – 126.76 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KCNK1 (англ. Potassium two pore domain channel subfamily K member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 336 амінокислот, а молекулярна маса — 38 143^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLQSLAGSSC	VRLVERHRSA	WCFGFLVLGY	LLYLVFGAVV	FSSVELPYED
LLRQELRKLK	RRFLEEHECL	SEQQLEQFLG	RVLEASNYGV	SVLSNASGNW
NWDFTSALFF	ASTVLSTTGY	GHTVPLSDGG	KAFCIIYSVI	GIPFTLLFLT
AVVQRITVHV	TRRPVLYFHI	RWGFSKQVVA	IVHAVLLGFV	TVSCFFFIPA
AVFSVLEDDW	NFLESFYFCF	ISLSTIGLGD	YVPGEGYNQK	FRELYKIGIT
CYLLLGLIAM	LVVLETFCEL	HELKKFRKMF	YVKKDKDEDQ	VHIIEHDQLS
FSSITDQAAG	MKEDQKQNEP	FVATQSSACV	DGPANH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію. Білок має сайт для зв'язування з калію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, синапсах, ендосомах.

Література

Goldstein S.A.N., Wang K.-W., Ilan N., Pausch M.H. (1998). Sequence and function of the two P domain potassium channels: implications of an emerging superfamily. J. Mol. Med. 76: 13—20. PMID 9462864 DOI:10.1007/s109-1998-8100-0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Rajan S., Plant L.D., Rabin M.L., Butler M.H., Goldstein S.A. (2005). Sumoylation silences the plasma membrane leak K+ channel K2P1. Cell. 121: 37—47. PMID 15820677 DOI:10.1016/j.cell.2005.01.019
Ma L., Zhang X., Chen H. (2011). TWIK-1 two-pore domain potassium channels change ion selectivity and conduct inward leak sodium currents in hypokalemia. Sci. Signal. 4: RA37—RA37. PMID 21653227 DOI:10.1126/scisignal.2001726
Zhao K.Q., Xiong G., Wilber M., Cohen N.A., Kreindler J.L. (2012). A role for two-pore K? channels in modulating Na? absorption and Cl? secretion in normal human bronchial epithelial cells. Am. J. Physiol. 302: L4—L12. PMID 21964404 DOI:10.1152/ajplung.00102.2011
Plant L.D., Zuniga L., Araki D., Marks J.D., Goldstein S.A. (2012). SUMOylation silences heterodimeric TASK potassium channels containing K2P1 subunits in cerebellar granule neurons. Sci. Signal. 5: RA84—RA84. PMID 23169818 DOI:10.1126/scisignal.2003431

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6272 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, O00180 (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані