CLCA4 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CLCA4, CaCC, CaCC2, chloride channel accessory 4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 616857 MGI: 2139744 HomoloGene: 40808 GeneCards: CLCA4 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • зв'язування з іоном металу • chloride channel activity • metalloendopeptidase activity • intracellular calcium activated chloride channel activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • extracellular region • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • apical plasma membrane • мембрана |
---|
Біологічний процес | • ion transmembrane transport • chloride transport • протеоліз • chloride transmembrane transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 86.55 – 86.58 Mb | Хр. 3: 144.66 – 144.68 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CLCA4 (англ. Chloride channel accessory 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 919 амінокислот, а молекулярна маса — 101 283[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGLFRGFVFL | | LVLCLLHQSN | | TSFIKLNNNG | | FEDIVIVIDP | | SVPEDEKIIE |
QIEDMVTTAS | | TYLFEATEKR | | FFFKNVSILI | | PENWKENPQY | | KRPKHENHKH |
ADVIVAPPTL | | PGRDEPYTKQ | | FTECGEKGEY | | IHFTPDLLLG | | KKQNEYGPPG |
KLFVHEWAHL | | RWGVFDEYNE | | DQPFYRAKSK | | KIEATRCSAG | | ISGRNRVYKC |
QGGSCLSRAC | | RIDSTTKLYG | | KDCQFFPDKV | | QTEKASIMFM | | QSIDSVVEFC |
NEKTHNQEAP | | SLQNIKCNFR | | STWEVISNSE | | DFKNTIPMVT | | PPPPPVFSLL |
KISQRIVCLV | | LDKSGSMGGK | | DRLNRMNQAA | | KHFLLQTVEN | | GSWVGMVHFD |
STATIVNKLI | | QIKSSDERNT | | LMAGLPTYPL | | GGTSICSGIK | | YAFQVIGELH |
SQLDGSEVLL | | LTDGEDNTAS | | SCIDEVKQSG | | AIVHFIALGR | | AADEAVIEMS |
KITGGSHFYV | | SDEAQNNGLI | | DAFGALTSGN | | TDLSQKSLQL | | ESKGLTLNSN |
AWMNDTVIID | | STVGKDTFFL | | ITWNSLPPSI | | SLWDPSGTIM | | ENFTVDATSK |
MAYLSIPGTA | | KVGTWAYNLQ | | AKANPETLTI | | TVTSRAANSS | | VPPITVNAKM |
NKDVNSFPSP | | MIVYAEILQG | | YVPVLGANVT | | AFIESQNGHT | | EVLELLDNGA |
GADSFKNDGV | | YSRYFTAYTE | | NGRYSLKVRA | | HGGANTARLK | | LRPPLNRAAY |
IPGWVVNGEI | | EANPPRPEID | | EDTQTTLEDF | | SRTASGGAFV | | VSQVPSLPLP |
DQYPPSQITD | | LDATVHEDKI | | ILTWTAPGDN | | FDVGKVQRYI | | IRISASILDL |
RDSFDDALQV | | NTTDLSPKEA | | NSKESFAFKP | | ENISEENATH | | IFIAIKSIDK |
SNLTSKVSNI | | AQVTLFIPQA | | NPDDIDPTPT | | PTPTPTPDKS | | HNSGVNISTL |
VLSVIGSVVI | | VNFILSTTI |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Agnel M., Vermat T., Culouscou J.-M. (1999). Identification of three novel members of the calcium-dependent chloride channel (CaCC) family predominantly expressed in the digestive tract and trachea. FEBS Lett. 455: 295—301. PMID 10437792 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00891-1
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2018 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q14CN2 (англ.) . Архів оригіналу за 29 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|