HCN4 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2MNG, 3OTF, 3U11, 4HBN, 4KL1, 4NVP | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | HCN4, SSS2, hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 4, BRGDA8, EIG18 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605206 MGI: 1298209 HomoloGene: 3997 GeneCards: HCN4 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Brugada syndrome 8, миготіння передсердь[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
івабрадин[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • potassium channel activity • cAMP binding • sodium channel activity • voltage-gated ion channel activity • ion channel activity • intracellular cAMP-activated cation channel activity • identical protein binding • voltage-gated potassium channel activity • voltage-gated sodium channel activity • voltage-gated potassium channel activity involved in SA node cell action potential depolarization |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • intrinsic component of plasma membrane • клітинна мембрана • perinuclear region of cytoplasm • HCN channel complex |
---|
Біологічний процес | • cellular response to cGMP • м'язове скорочення • sodium ion transmembrane transport • sodium ion transport • SA node cell action potential • regulation of membrane potential • regulation of ion transmembrane transport • cation transport • ion transport • кровообіг • regulation of membrane depolarization • регуляція серцевого ритму • potassium ion transport • трансмембранний транспорт • potassium ion transmembrane transport • regulation of cardiac muscle contraction • regulation of heart rate by cardiac conduction • cellular response to cAMP • membrane depolarization during cardiac muscle cell action potential • membrane depolarization during SA node cell action potential • sodium ion import across plasma membrane • regulation of cardiac muscle cell action potential involved in regulation of contraction • potassium ion import across plasma membrane |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 73.32 – 73.37 Mb | Хр. 9: 58.73 – 58.77 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
HCN4 (англ. Hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 203 амінокислот, а молекулярна маса — 129 042[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDKLPPSMRK | | RLYSLPQQVG | | AKAWIMDEEE | | DAEEEGAGGR | | QDPSRRSIRL |
RPLPSPSPSA | | AAGGTESRSS | | ALGAADSEGP | | ARGAGKSSTN | | GDCRRFRGSL |
ASLGSRGGGS | | GGTGSGSSHG | | HLHDSAEERR | | LIAEGDASPG | | EDRTPPGLAA |
EPERPGASAQ | | PAASPPPPQQ | | PPQPASASCE | | QPSVDTAIKV | | EGGAAAGDQI |
LPEAEVRLGQ | | AGFMQRQFGA | | MLQPGVNKFS | | LRMFGSQKAV | | EREQERVKSA |
GFWIIHPYSD | | FRFYWDLTML | | LLMVGNLIII | | PVGITFFKDE | | NTTPWIVFNV |
VSDTFFLIDL | | VLNFRTGIVV | | EDNTEIILDP | | QRIKMKYLKS | | WFMVDFISSI |
PVDYIFLIVE | | TRIDSEVYKT | | ARALRIVRFT | | KILSLLRLLR | | LSRLIRYIHQ |
WEEIFHMTYD | | LASAVVRIVN | | LIGMMLLLCH | | WDGCLQFLVP | | MLQDFPDDCW |
VSINNMVNNS | | WGKQYSYALF | | KAMSHMLCIG | | YGRQAPVGMS | | DVWLTMLSMI |
VGATCYAMFI | | GHATALIQSL | | DSSRRQYQEK | | YKQVEQYMSF | | HKLPPDTRQR |
IHDYYEHRYQ | | GKMFDEESIL | | GELSEPLREE | | IINFNCRKLV | | ASMPLFANAD |
PNFVTSMLTK | | LRFEVFQPGD | | YIIREGTIGK | | KMYFIQHGVV | | SVLTKGNKET |
KLADGSYFGE | | ICLLTRGRRT | | ASVRADTYCR | | LYSLSVDNFN | | EVLEEYPMMR |
RAFETVALDR | | LDRIGKKNSI | | LLHKVQHDLN | | SGVFNYQENE | | IIQQIVQHDR |
EMAHCAHRVQ | | AAASATPTPT | | PVIWTPLIQA | | PLQAAAATTS | | VAIALTHHPR |
LPAAIFRPPP | | GSGLGNLGAG | | QTPRHLKRLQ | | SLIPSALGSA | | SPASSPSQVD |
TPSSSSFHIQ | | QLAGFSAPAG | | LSPLLPSSSS | | SPPPGACGSP | | SAPTPSAGVA |
ATTIAGFGHF | | HKALGGSLSS | | SDSPLLTPLQ | | PGARSPQAAQ | | PSPAPPGARG |
GLGLPEHFLP | | PPPSSRSPSS | | SPGQLGQPPG | | ELSLGLATGP | | LSTPETPPRQ |
PEPPSLVAGA | | SGGASPVGFT | | PRGGLSPPGH | | SPGPPRTFPS | | APPRASGSHG |
SLLLPPASSP | | PPPQVPQRRG | | TPPLTPGRLT | | QDLKLISASQ | | PALPQDGAQT |
LRRASPHSSG | | ESMAAFPLFP | | RAGGGSGGSG | | SSGGLGPPGR | | PYGAIPGQHV |
TLPRKTSSGS | | LPPPLSLFGA | | RATSSGGPPL | | TAGPQREPGA | | RPEPVRSKLP |
SNL |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, транспорт натрію. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, калію, іоном натрію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Xu X., Vysotskaya Z.V., Liu Q., Zhou L. (2010). Structural basis for the cAMP-dependent gating in the human HCN4 channel. J. Biol. Chem. 285: 37082—37091. PMID 20829353 DOI:10.1074/jbc.M110.152033
- Milanesi R., Baruscotti M., Gnecchi-Ruscone T., DiFrancesco D. (2006). Familial sinus bradycardia associated with a mutation in the cardiac pacemaker channel. N. Engl. J. Med. 354: 151—157. PMID 16407510 DOI:10.1056/NEJMoa052475
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з HCN4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16882 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9Y3Q4 (англ.) . Архів оригіналу за 11 березня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|