KDM2B

KDM2B
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتينOrtholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين

4O64

معرفات
أسماء بديلة KDM2B, CXXC2, FBXL10, Fbl10, JHDM1B, PCCX2, lysine demethylase 2B
معرفات خارجية الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 609078 MGI: MGI:1354737 HomoloGene: 13069 GeneCards: 84678
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية

ربط دي إن إي
rRNA binding
ربط أيون الزنك
dioxygenase activity
ربط أيون فلزي
histone demethylase activity
‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني
histone H3-methyl-lysine-36 demethylase activity
RNA binding
oxidoreductase activity
‏GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding

مكونات خلوية

بلازم نووي
نوية
PcG protein complex
نواة
صبغي

عمليات حيوية

‏GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process
midbrain-hindbrain boundary morphogenesis
‏GO:0009373 ضبط نسخ الدنا
lateral ventricle development
histone H2A monoubiquitination
negative regulation of neural precursor cell proliferation
hindbrain development
‏GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
نسخ الدنا
third ventricle development
positive regulation of cell growth
embryonic camera-type eye morphogenesis
histone H3-K36 demethylation
تكون الحيوانات المنوية
forebrain development
positive regulation of stem cell population maintenance
initiation of neural tube closure
midbrain development
fourth ventricle development
‏GO:0031497، ‏GO:0006336، ‏GO:0034724، ‏GO:0001301، ‏GO:0007580، ‏GO:0034652، ‏GO:0010847 chromatin organization

المصادر:Amigo / QuickGO
تماثلات متسلسلة
أنواع الإنسان الفأر
أنتريه 84678 30841
Ensembl ENSG00000089094 ENSMUSG00000029475
يونيبروت

Q8NHM5
F5H4A7

Q6P1G2

RefSeq (رنا مرسال.)

‏NM_032590، ‏XM_005253955، ‏XM_005253956، ‏XM_005253961، ‏XM_011538867، ‏XM_011538868، ‏XM_011538869، ‏XM_011538875 NM_001005366، ‏NM_032590، ‏XM_005253955، ‏XM_005253956، ‏XM_005253961، ‏XM_011538867، ‏XM_011538868، ‏XM_011538869، ‏XM_011538875

‏NM_001005866، ‏NM_013910، ‏XM_006530376، ‏XM_011248208، ‏XM_011248209، ‏XM_011248210، ‏XM_011248211، ‏XM_011248212، ‏XM_011248213، ‏XM_011248214، ‏XM_011248215، ‏XM_011248216، ‏NM_001378863، ‏NM_001378864، ‏NM_001378865، ‏XM_036165165، ‏XM_036165166، ‏XM_036165167 NM_001003953، ‏NM_001005866، ‏NM_013910، ‏XM_006530376، ‏XM_011248208، ‏XM_011248209، ‏XM_011248210، ‏XM_011248211، ‏XM_011248212، ‏XM_011248213، ‏XM_011248214، ‏XM_011248215، ‏XM_011248216، ‏NM_001378863، ‏NM_001378864، ‏NM_001378865، ‏XM_036165165، ‏XM_036165166، ‏XM_036165167

RefSeq (بروتين)

‏NP_115979، ‏XP_005254012، ‏XP_005254013، ‏XP_005254018، ‏XP_011537169، ‏XP_011537170، ‏XP_011537171، ‏XP_011537177 NP_001005366، ‏NP_115979، ‏XP_005254012، ‏XP_005254013، ‏XP_005254018، ‏XP_011537169، ‏XP_011537170، ‏XP_011537171، ‏XP_011537177

‏NP_038938، ‏XP_006530439، ‏XP_011246510، ‏XP_011246511، ‏XP_011246512، ‏XP_011246513، ‏XP_011246514، ‏XP_011246515، ‏XP_011246516، ‏XP_011246517، ‏XP_011246518، ‏NP_001365792، ‏NP_001365793، ‏NP_001365794، ‏XP_036021058، ‏XP_036021059، ‏XP_036021060 NP_001003953، ‏NP_038938، ‏XP_006530439، ‏XP_011246510، ‏XP_011246511، ‏XP_011246512، ‏XP_011246513، ‏XP_011246514، ‏XP_011246515، ‏XP_011246516، ‏XP_011246517، ‏XP_011246518، ‏NP_001365792، ‏NP_001365793، ‏NP_001365794، ‏XP_036021058، ‏XP_036021059، ‏XP_036021060

الموقع (UCSC n/a Chr 5: 123.01 – 123.13 Mb
بحث ببمد [1] [2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنساناعرض/عدّل فأر

KDM2B‏ (Lysine demethylase 2B) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين KDM2B في الإنسان.[1]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

  1. ^ "Entrez Gene: Lysine (K)-specific demethylase 2B". مؤرشف من الأصل في 2016-11-03.

قراءة متعمقة

  • Fujino T، Hasegawa M، Shibata S، Kishimoto T، Imai S، Takano T (مايو 2000). "PCCX1, a novel DNA-binding protein with PHD finger and CXXC domain, is regulated by proteolysis". Biochemical and Biophysical Research Communications. ج. 271 ع. 2: 305–10. DOI:10.1006/bbrc.2000.2614. PMID:10799292.
  • Tzatsos A، Paskaleva P، Ferrari F، Deshpande V، Stoykova S، Contino G، Wong KK، Lan F، Trojer P، Park PJ، Bardeesy N (فبراير 2013). "KDM2B promotes pancreatic cancer via Polycomb-dependent and -independent transcriptional programs". The Journal of Clinical Investigation. ج. 123 ع. 2: 727–39. DOI:10.1172/JCI64535. PMC:3561797. PMID:23321669.
  • Tzatsos A، Pfau R، Kampranis SC، Tsichlis PN (فبراير 2009). "Ndy1/KDM2B immortalizes mouse embryonic fibroblasts by repressing the Ink4a/Arf locus". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 106 ع. 8: 2641–6. DOI:10.1073/pnas.0813139106. PMC:2650317. PMID:19202064.
  • Janzer A، Stamm K، Becker A، Zimmer A، Buettner R، Kirfel J (سبتمبر 2012). "The H3K4me3 histone demethylase Fbxl10 is a regulator of chemokine expression, cellular morphology, and the metabolome of fibroblasts". The Journal of Biological Chemistry. ج. 287 ع. 37: 30984–92. DOI:10.1074/jbc.M112.341040. PMC:3438931. PMID:22825849.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Frescas D، Guardavaccaro D، Bassermann F، Koyama-Nasu R، Pagano M (نوفمبر 2007). "JHDM1B/FBXL10 is a nucleolar protein that represses transcription of ribosomal RNA genes". Nature. ج. 450 ع. 7167: 309–13. DOI:10.1038/nature06255. PMID:17994099.
  • Koyama-Nasu R، David G، Tanese N (سبتمبر 2007). "The F-box protein Fbl10 is a novel transcriptional repressor of c-Jun". Nature Cell Biology. ج. 9 ع. 9: 1074–80. DOI:10.1038/ncb1628. PMID:17704768.
  • Szafranski K، Schindler S، Taudien S، Hiller M، Huse K، Jahn N، Schreiber S، Backofen R، Platzer M (2007). "Violating the splicing rules: TG dinucleotides function as alternative 3' splice sites in U2-dependent introns". Genome Biology. ج. 8 ع. 8: R154. DOI:10.1186/gb-2007-8-8-r154. PMC:2374985. PMID:17672918.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Tsukada Y، Fang J، Erdjument-Bromage H، Warren ME، Borchers CH، Tempst P، Zhang Y (فبراير 2006). "Histone demethylation by a family of JmjC domain-containing proteins". Nature. ج. 439 ع. 7078: 811–6. DOI:10.1038/nature04433. PMID:16362057.
  • Ge R، Wang Z، Zeng Q، Xu X، Olumi AF (يوليو 2011). "F-box protein 10, an NF-κB-dependent anti-apoptotic protein, regulates TRAIL-induced apoptosis through modulating c-Fos/c-FLIP pathway". Cell Death and Differentiation. ج. 18 ع. 7: 1184–95. DOI:10.1038/cdd.2010.185. PMC:3131965. PMID:21252908.
معرفات كيميائية
  • ع
  • ن
  • ت
جينات الكروموسوم 12
جينات الكروموسوم 12
  • أيقونة بوابةبوابة طب
  • أيقونة بوابةبوابة الكيمياء الحيوية
  • أيقونة بوابةبوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
أيقونة بذرة

هذه بذرة مقالة عن بروتين بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

التصنيفات الطبية
المعرفات الخارجية