YTHDC1

YTHDC1
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتينOrtholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين

2YUD, 4R3H, 4R3I

معرفات
أسماء بديلة YTHDC1, YT521, YT521-B, YTH domain containing 1
معرفات خارجية الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 617283 MGI: MGI:2443713 HomoloGene: 15796 GeneCards: 91746
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية

• ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني
• RNA binding
• N6-methyladenosine-containing RNA binding

مكونات خلوية

• نواة
• nuclear speck
• غشاء خلوي
• بلازم نووي

عمليات حيوية

• mRNA processing
• mRNA splice site selection
• تضفير الآر أن إيه
• regulation of mRNA splicing, via spliceosome
• mRNA export from nucleus
• dosage compensation by inactivation of X chromosome
• posttranscriptional regulation of gene expression

المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
أنواع الإنسان الفأر
أنتريه 91746 231386
Ensembl ‏ENSG00000083896;db=core ENSG00000275272، ‏ENSG00000083896 ENSMUSG00000035851
يونيبروت

Q96MU7

E9Q5K9

RefSeq (رنا مرسال.)

‏NM_133370، ‏XM_005265708، ‏NM_001330698 NM_001031732، ‏NM_133370، ‏XM_005265708، ‏NM_001330698

‏XM_006534863، ‏XM_006534865، ‏XM_006534867، ‏XR_389269، ‏XM_017320843، ‏NM_001347375، ‏NM_001347376، ‏NM_001359907، ‏NM_001359908، ‏NR_153372، ‏XM_030254395، ‏XR_003955632، ‏XR_004942503 NM_177680، ‏XM_006534863، ‏XM_006534865، ‏XM_006534867، ‏XR_389269، ‏XM_017320843، ‏NM_001347375، ‏NM_001347376، ‏NM_001359907، ‏NM_001359908، ‏NR_153372، ‏XM_030254395، ‏XR_003955632، ‏XR_004942503

RefSeq (بروتين)

‏NP_001317627، ‏NP_588611، ‏XP_005265764، ‏XP_005265765، ‏XP_016864321، ‏XP_016864322 NP_001026902، ‏NP_001317627، ‏NP_588611، ‏XP_005265764، ‏XP_005265765، ‏XP_016864321، ‏XP_016864322

‏NP_001334305، ‏NP_808348، ‏XP_006534926، ‏XP_006534928، ‏XP_006534930، ‏XP_017176332، ‏NP_001346836، ‏NP_001346837، ‏XP_030110255 NP_001334304، ‏NP_001334305، ‏NP_808348، ‏XP_006534926، ‏XP_006534928، ‏XP_006534930، ‏XP_017176332، ‏NP_001346836، ‏NP_001346837، ‏XP_030110255

الموقع (UCSC n/a Chr 5: 86.95 – 86.98 Mb
بحث ببمد [1] [2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنساناعرض/عدّل فأر

YTHDC1‏ (YTH domain containing 1) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين YTHDC1 في الإنسان.[1][2][3]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

  1. ^ "Entrez Gene: YTHDC1 YTH domain containing 1". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.
  2. ^ Stoilov P، Rafalska I، Stamm S (أكتوبر 2002). "YTH: a new domain in nuclear proteins". Trends Biochem Sci. ج. 27 ع. 10: 495–7. DOI:10.1016/S0968-0004(02)02189-8. PMID:12368078.
  3. ^ Hartmann AM، Nayler O، Schwaiger FW، Obermeier A، Stamm S (ديسمبر 1999). "The interaction and colocalization of Sam68 with the splicing-associated factor YT521-B in nuclear dots is regulated by the Src family kinase p59(fyn)". Mol Biol Cell. ج. 10 ع. 11: 3909–26. DOI:10.1091/mbc.10.11.3909. PMC:25688. PMID:10564280.

قراءة متعمقة

  • Imai Y، Matsuo N، Ogawa S، Tohyama M، Takagi T (1998). "Cloning of a gene, YT521, for a novel RNA splicing-related protein induced by hypoxia/reoxygenation". Brain Res. Mol. Brain Res. ج. 53 ع. 1–2: 33–40. DOI:10.1016/S0169-328X(97)00262-3. PMID:9473574.
  • Nayler O، Hartmann AM، Stamm S (2000). "The ER repeat protein YT521-B localizes to a novel subnuclear compartment". J. Cell Biol. ج. 150 ع. 5: 949–62. DOI:10.1083/jcb.150.5.949. PMC:2175241. PMID:10973987.
  • Stoss O، Olbrich M، Hartmann AM، Konig H، Memmott J، Andreadis A، Stamm S (2001). "The STAR/GSG family protein rSLM-2 regulates the selection of alternative splice sites". J. Biol. Chem. ج. 276 ع. 12: 8665–73. DOI:10.1074/jbc.M006851200. PMID:11118435.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Nagase T، Kikuno R، Ohara O (2002). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXII. The complete sequences of 50 new cDNA clones which code for large proteins". DNA Res. ج. 8 ع. 6: 319–27. DOI:10.1093/dnares/8.6.319. PMID:11853319.
  • Wilkinson FL، Holaska JM، Zhang Z، Sharma A، Manilal S، Holt I، Stamm S، Wilson KL، Morris GE (2003). "Emerin interacts in vitro with the splicing-associated factor, YT521-B". Eur. J. Biochem. ج. 270 ع. 11: 2459–66. DOI:10.1046/j.1432-1033.2003.03617.x. PMID:12755701.
  • Rafalska I، Zhang Z، Benderska N، Wolff H، Hartmann AM، Brack-Werner R، Stamm S (2005). "The intranuclear localization and function of YT521-B is regulated by tyrosine phosphorylation". Hum. Mol. Genet. ج. 13 ع. 15: 1535–49. DOI:10.1093/hmg/ddh167. PMID:15175272.
  • Beausoleil SA، Jedrychowski M، Schwartz D، Elias JE، Villén J، Li J، Cohn MA، Cantley LC، Gygi SP (2004). "Large-scale characterization of HeLa cell nuclear phosphoproteins". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 101 ع. 33: 12130–5. DOI:10.1073/pnas.0404720101. PMC:514446. PMID:15302935.
  • Stoss O، Novoyatleva T، Gencheva M، Olbrich M، Benderska N، Stamm S (2005). "p59(fyn)-mediated phosphorylation regulates the activity of the tissue-specific splicing factor rSLM-1". Mol. Cell. Neurosci. ج. 27 ع. 1: 8–21. DOI:10.1016/j.mcn.2004.04.011. PMID:15345239.
  • Kimura K، Wakamatsu A، Suzuki Y، Ota T، Nishikawa T، Yamashita R، Yamamoto J، Sekine M، Tsuritani K، Wakaguri H، Ishii S، Sugiyama T، Saito K، Isono Y، Irie R، Kushida N، Yoneyama T، Otsuka R، Kanda K، Yokoi T، Kondo H، Wagatsuma M، Murakawa K، Ishida S، Ishibashi T، Takahashi-Fujii A، Tanase T، Nagai K، Kikuchi H، Nakai K، Isogai T، Sugano S (2006). "Diversification of transcriptional modulation: large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes". Genome Res. ج. 16 ع. 1: 55–65. DOI:10.1101/gr.4039406. PMC:1356129. PMID:16344560.
  • Nousiainen M، Silljé HH، Sauer G، Nigg EA، Körner R (2006). "Phosphoproteome analysis of the human mitotic spindle". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 103 ع. 14: 5391–6. DOI:10.1073/pnas.0507066103. PMC:1459365. PMID:16565220.
  • Beausoleil SA، Villén J، Gerber SA، Rush J، Gygi SP (2006). "A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization". Nat. Biotechnol. ج. 24 ع. 10: 1285–92. DOI:10.1038/nbt1240. PMID:16964243.
  • Olsen JV، Blagoev B، Gnad F، Macek B، Kumar C، Mortensen P، Mann M (2006). "Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks". Cell. ج. 127 ع. 3: 635–48. DOI:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID:17081983.
معرفات كيميائية
  • ع
  • ن
  • ت
جينات الكروموسوم 4
جينات الكروموسوم 4
  • أيقونة بوابةبوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
  • أيقونة بوابةبوابة طب
  • أيقونة بوابةبوابة الكيمياء الحيوية
أيقونة بذرة

هذه بذرة مقالة عن جين على كروموسوم 4 بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

التصنيفات الطبية
المعرفات الخارجية