果蝠冠状病毒GCCDC1 |
病毒分類 |
(未分级): | 病毒 Virus |
域: | 核糖病毒域 Riboviria |
界: | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
门: | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
纲: | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
目: | 套式病毒目 Nidovirales |
科: | 冠状病毒科 Coronaviridae |
属: | 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus |
种: | 果蝠冠状病毒GCCDC1 Rousettus bat coronavirus GCCDC1 |
果蝠冠状病毒GCCDC1(Rousettus bat coronavirus GCCDC1、Ro-BatCoV GCCDC1)是乙型冠狀病毒屬的一種病毒,與果蝠冠狀病毒HKU9的關係接近,於2016年在中國雲南的棕果蝠體內發現。此病毒有一輔助蛋白基因p10不見於其他冠狀病毒中,可能是來自正呼腸孤病毒屬的病毒[1]。
基因組
果蝠冠状病毒GCCDC1的基因組長約30100nt,編碼冠狀病毒皆有的複製酶(1a/1b)和刺突蛋白(S)、膜蛋白(M)、外膜蛋白(E)與衣殼蛋白(N)等四種結構蛋白,另外還有NS3、p10、NS7a、NS7b與NS7c等五個開放閱讀框編碼輔助蛋白,其基因順序為1ab-S-NS3-E-M-N-p10-NS7a-NS7b-NS7c。其中p10蛋白為果蝠冠状病毒GCCDC1的最大特色,此蛋白不見於任何其他冠狀病毒,卻與感染鳥類、蝙蝠的正呼腸孤病毒屬(屬呼腸孤病毒科,為雙股RNA病毒(英语:Double-stranded RNA viruses))病毒的p10蛋白序列相似,很可能是與正呼腸孤病毒發生重組的結果[1]。
分類
序列分析顯示果蝠冠状病毒GCCDC1與果蝠冠狀病毒HKU9的關係接近,這兩種病毒共同組成乙型冠狀病毒屬的支系D(lineage D),後來有學者將其稱為Nobecovirus亞屬,在乙型冠狀病毒屬中與Sarbecovirus(SARS-CoV、SARS-CoV-2)和Hibecovirus(蹄蝠乙型冠狀病毒浙江2013)關係較為接近[2]。
參考文獻
- ^ 1.0 1.1 Baker, Susan; Huang, Canping; Liu, William J.; Xu, Wen; Jin, Tao; Zhao, Yingze; Song, Jingdong; Shi, Yi; Ji, Wei; Jia, Hao; Zhou, Yongming; Wen, Honghua; Zhao, Honglan; Liu, Huaxing; Li, Hong; Wang, Qihui; Wu, Ying; Wang, Liang; Liu, Di; Liu, Guang; Yu, Hongjie; Holmes, Edward C.; Lu, Lin; Gao, George F. A Bat-Derived Putative Cross-Family Recombinant Coronavirus with a Reovirus Gene. PLOS Pathogens. 2016, 12 (9): e1005883. ISSN 1553-7374. doi:10.1371/journal.ppat.1005883.
- ^ Lu, Roujian; Zhao, Xiang; Li, Juan; Niu, Peihua; Yang, Bo; Wu, Honglong; Wang, Wenling; Song, Hao; Huang, Baoying; Zhu, Na; Bi, Yuhai; Ma, Xuejun; Zhan, Faxian; Wang, Liang; Hu, Tao; Zhou, Hong; Hu, Zhenhong; Zhou, Weimin; Zhao, Li; Chen, Jing; Meng, Yao; Wang, Ji; Lin, Yang; Yuan, Jianying; Xie, Zhihao; Ma, Jinmin; Liu, William J; Wang, Dayan; Xu, Wenbo; Holmes, Edward C; Gao, George F; Wu, Guizhen; Chen, Weijun; Shi, Weifeng; Tan, Wenjie. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. The Lancet. 2020, 395 (10224): 565–574. ISSN 0140-6736. doi:10.1016/S0140-6736(20)30251-8.
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| 甲型冠狀病毒屬 (α-CoV) | | | |
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| | | 229E病毒 | |
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| NL63病毒 | 人類冠狀病毒NL63(HCoV-NL63) · NL63相關蝙蝠冠狀病毒(英语:NL63-related bat coronavirus strain BtKYNL63-9b) |
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| 其他 | |
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| 乙型冠狀病毒屬 (β-CoV) | Embecovirus(英语:Embecovirus) (支系A) | | |
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| | 鼠冠狀病毒(M-CoV) | 鼠肝炎病毒(MHV) · 大鼠冠狀病毒(RCoV)(大鼠涎淚腺炎病毒SDAV · 帕克RCoV) |
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| | Merbecovirus(英语:Merbecovirus) (支系C) | |
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| | Nobecovirus(英语:Nobecovirus)(支系D) | 果蝠冠状病毒GCCDC1(Ro-BatCoV GCCDC1) · 果蝠冠状病毒HKU9(Ro-BatCoV HKU9) |
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| 丙型冠状病毒属 (γ-CoV) | Cegacovirus | 鯨豚冠狀病毒(白鯨冠狀病毒SW1 · 瓶鼻海豚冠狀病毒HKU22) |
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| | Brangacovirus(英语:Brangacovirus) | |
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| Igacovirus(英语:Igacovirus) | |
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| 丁型冠狀病毒屬 (δ-CoV) | 鵯冠狀病毒HKU11(BuCoV HKU11) · 鶇冠狀病毒HKU12(ThCoV HKU12) · 文鳥冠狀病毒HKU13(英语:Munia coronavirus HKU13)(MuCoV HKU13) · 猪丁型冠状病毒(PdCV) · 繡眼冠狀病毒HKU16(英语:White-eye coronavirus HKU16)(WeCoV HKU16) · 麻雀冠狀病毒HKU17(SpCoV HKU17) · 鵲鴝冠狀病毒HKU18(MRCoV HKU18) · 夜鷺冠狀病毒HKU19 · 鴨冠狀病毒HKU20(WiCoV HKU20) · 紅冠水雞冠狀病毒HKU21(英语:Common moorhen coronavirus HKU21)(CMCoV HKU21) · 隼冠狀病毒HKU27(FalCoV UAE-HKU27) · 翎頜鴇冠狀病毒HKU28(HouCoV UAE-HKU28) · 鴿冠狀病毒HKU29(PiCoV UAE-HKU29) · 鵪鶉冠狀病毒HKU30(QuaCoV UAE-HKU30) |
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