ZCCHC8 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ZCCHC8, zinc finger CCHC-type containing 8, PFBMFT5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 616381 MGI: 1917900 HomoloGene: 32349 GeneCards: ZCCHC8 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • нуклеоплазма • ядерні тільця • клітинне ядро • ядерце • TRAMP complex |
---|
Біологічний процес | • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • Сплайсинг РНК |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/35/PBB_GE_ZCCHC8_218478_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_ZCCHC8_218478_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/78/PBB_GE_ZCCHC8_gnf1h09282_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_ZCCHC8_gnf1h09282_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_017612 NM_001350935 NM_001350936 NM_001350937 NM_001350938 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_060082 NP_001337864 NP_001337865 NP_001337866 NP_001337867 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 122.47 – 122.5 Mb | Хр. 5: 123.84 – 123.86 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ZCCHC8 (англ. Zinc finger CCHC-type containing 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 707 амінокислот, а молекулярна маса — 78 577[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAAEVYFGDL | | ELFEPFDHPE | | ESIPKPVHTR | | FKDDDGDEED | | ENGVGDAELR |
ERLRQCEETI | | EQLRAENQEL | | KRKLNILTRP | | SGILVNDTKL | | DGPILQILFM |
NNAISKQYHQ | | EIEEFVSNLV | | KRFEEQQKND | | VEKTSFNLLP | | QPSSIVLEED |
HKVEESCAIK | | NNKEAFSVVG | | SVLYFTNFCL | | DKLGQPLLNE | | NPQLSEGWEI |
PKYHQVFSHI | | VSLEGQEIQV | | KAKRPKPHCF | | NCGSEEHQMK | | DCPMPRNAAR |
ISEKRKEYMD | | ACGEANNQNF | | QQRYHAEEVE | | ERFGRFKPGV | | ISEELQDALG |
VTDKSLPPFI | | YRMRQLGYPP | | GWLKEAELEN | | SGLALYDGKD | | GTDGETEVGE |
IQQNKSVTYD | | LSKLVNYPGF | | NISTPRGIPD | | EWRIFGSIPM | | QACQQKDVFA |
NYLTSNFQAP | | GVKSGNKRSS | | SHSSPGSPKK | | QKNESNSAGS | | PADMELDSDM |
EVPHGSQSSE | | SFQFQPPLPP | | DTPPLPRGTP | | PPVFTPPLPK | | GTPPLTPSDS |
PQTRTASGAV | | DEDALTLEEL | | EEQQRRIWAA | | LEQAESVNSD | | SDVPVDTPLT |
GNSVASSPCP | | NELDLPVPEG | | KTSEKQTLDE | | PEVPEIFTKK | | SEAGHASSPD |
SEVTSLCQKE | | KAELAPVNTE | | GALLDNGSVV | | PNCDISNGGS | | QKLFPADTSP |
STATKIHSPI | | PDMSKFATGI | | TPFEFENMAE | | STGMYLRIRS | | LLKNSPRNQQ |
KNKKASE |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
- Sloan K.E., Schneider C., Watkins N.J. (2012). Comparison of the yeast and human nuclear exosome complexes. Biochem. Soc. Trans. 40: 850—855. PMID 22817747 DOI:10.1042/BST20120061
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25265 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q6NZY4 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |