ZCCHC8

Ідентифікатори

Символи

ZCCHC8, zinc finger CCHC-type containing 8, PFBMFT5

Зовнішні ІД

OMIM: 616381 MGI: 1917900 HomoloGene: 32349 GeneCards: ZCCHC8

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA binding
Клітинна компонента	• catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • нуклеоплазма • ядерні тільця • клітинне ядро • ядерце • TRAMP complex
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • Сплайсинг РНК
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55596


70650

Ensembl


ENSG00000033030


ENSMUSG00000029427

UniProt


Q6NZY4


Q9CYA6

RefSeq (мРНК)


NM_017612 NM_001350935 NM_001350936 NM_001350937 NM_001350938


NM_027494

RefSeq (білок)


NP_060082 NP_001337864 NP_001337865 NP_001337866 NP_001337867


NP_081770

Локус (UCSC)

Хр. 12: 122.47 – 122.5 Mb

Хр. 5: 123.84 – 123.86 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZCCHC8 (англ. Zinc finger CCHC-type containing 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 707 амінокислот, а молекулярна маса — 78 577^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAEVYFGDL	ELFEPFDHPE	ESIPKPVHTR	FKDDDGDEED	ENGVGDAELR
ERLRQCEETI	EQLRAENQEL	KRKLNILTRP	SGILVNDTKL	DGPILQILFM
NNAISKQYHQ	EIEEFVSNLV	KRFEEQQKND	VEKTSFNLLP	QPSSIVLEED
HKVEESCAIK	NNKEAFSVVG	SVLYFTNFCL	DKLGQPLLNE	NPQLSEGWEI
PKYHQVFSHI	VSLEGQEIQV	KAKRPKPHCF	NCGSEEHQMK	DCPMPRNAAR
ISEKRKEYMD	ACGEANNQNF	QQRYHAEEVE	ERFGRFKPGV	ISEELQDALG
VTDKSLPPFI	YRMRQLGYPP	GWLKEAELEN	SGLALYDGKD	GTDGETEVGE
IQQNKSVTYD	LSKLVNYPGF	NISTPRGIPD	EWRIFGSIPM	QACQQKDVFA
NYLTSNFQAP	GVKSGNKRSS	SHSSPGSPKK	QKNESNSAGS	PADMELDSDM
EVPHGSQSSE	SFQFQPPLPP	DTPPLPRGTP	PPVFTPPLPK	GTPPLTPSDS
PQTRTASGAV	DEDALTLEEL	EEQQRRIWAA	LEQAESVNSD	SDVPVDTPLT
GNSVASSPCP	NELDLPVPEG	KTSEKQTLDE	PEVPEIFTKK	SEAGHASSPD
SEVTSLCQKE	KAELAPVNTE	GALLDNGSVV	PNCDISNGGS	QKLFPADTSP
STATKIHSPI	PDMSKFATGI	TPFEFENMAE	STGMYLRIRS	LLKNSPRNQQ
KNKKASE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
Sloan K.E., Schneider C., Watkins N.J. (2012). Comparison of the yeast and human nuclear exosome complexes. Biochem. Soc. Trans. 40: 850—855. PMID 22817747 DOI:10.1042/BST20120061

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25265 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q6NZY4 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.