ZCCHC6

Ідентифікатори

Символи

TUT7, PAPD6, zinc finger CCHC-type containing 6, TENT3B, ZCCHC6, terminal uridylyl transferase 7

Зовнішні ІД

OMIM: 613467 MGI: 2387179 HomoloGene: 51941 GeneCards: TUT7

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • nucleotidyltransferase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA binding • RNA uridylyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • miRNA binding • uridylyltransferase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• histone mRNA catabolic process • RNA 3'-end processing • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • oocyte maturation • negative regulation of transposition, RNA-mediated • GO:0061715 miRNA metabolic process • pre-miRNA processing • RNA 3' uridylation • polyuridylation-dependent mRNA catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


79670


214290

Ensembl


ENSG00000083223


ENSMUSG00000035248

UniProt


Q5VYS8


Q5BLK4

RefSeq (мРНК)


NM_001185059 NM_001185074 NM_024617 NM_001330718


NM_153538 NM_001373962 NM_001373963 NM_001373964

RefSeq (білок)


NP_001171988 NP_001172003 NP_001317647 NP_078893


NP_705766 NP_001360891 NP_001360892 NP_001360893

Локус (UCSC)

Хр. 9: 86.29 – 86.35 Mb

Хр. 13: 59.92 – 59.97 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZCCHC6 (англ. Zinc finger CCHC-type containing 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 495 амінокислот, а молекулярна маса — 171 229^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGDTAKPYFV	KRTKDRGTMD	DDDFRRGHPQ	QDYLIIDDHA	KGHGSKMEKG
LQKKKITPGN	YGNTPRKGPC	AVSSNPYAFK	NPIYSQPAWM	NDSHKDQSKR
WLSDEHTGNS	DNWREFKPGP	RIPVINRQRK	DSFQENEDGY	RWQDTRGCRT
VRRLFHKDLT	SLETTSEMEA	GSPENKKQRS	RPRKPRKTRN	EENEQDGDLE
GPVIDESVLS	TKELLGLQQA	EERLKRDCID	RLKRRPRNYP	TAKYTCRLCD
VLIESIAFAH	KHIKEKRHKK	NIKEKQEEEL	LTTLPPPTPS	QINAVGIAID
KVVQEFGLHN	ENLEQRLEIK	RIMENVFQHK	LPDCSLRLYG	SSCSRLGFKN
SDVNIDIQFP	AIMSQPDVLL	LVQECLKNSD	SFIDVDADFH	ARVPVVVCRE
KQSGLLCKVS	AGNENACLTT	KHLTALGKLE	PKLVPLVIAF	RYWAKLCSID
RPEEGGLPPY	VFALMAIFFL	QQRKEPLLPV	YLGSWIEGFS	LSKLGNFNLQ
DIEKDVVIWE	HTDSAAGDTG	ITKEEAPRET	PIKRGQVSLI	LDVKHQPSVP
VGQLWVELLR	FYALEFNLAD	LVISIRVKEL	VSRELKDWPK	KRIAIEDPYS
VKRNVARTLN	SQPVFEYILH	CLRTTYKYFA	LPHKITKSSL	LKPLNAITCI
SEHSKEVINH	HPDVQTKDDK	LKNSVLAQGP	GATSSAANTC	KVQPLTLKET
AESFGSPPKE	EMGNEHISVH	PENSDCIQAD	VNSDDYKGDK	VYHPETGRKN
EKEKVGRKGK	HLLTVDQKRG	EHVVCGSTRN	NESESTLDLE	GFQNPTAKEC
EGLATLDNKA	DLDGESTEGT	EELEDSLNHF	THSVQGQTSE	MIPSDEEEED
DEEEEEEEEP	RLTINQREDE	DGMANEDELD	NTYTGSGDED	ALSEEDDELG
EAAKYEDVKE	CGKHVERALL	VELNKISLKE	ENVCEEKNSP	VDQSDFFYEF
SKLIFTKGKS	PTVVCSLCKR	EGHLKKDCPE	DFKRIQLEPL	PPLTPKFLNI
LDQVCIQCYK	DFSPTIIEDQ	AREHIRQNLE	SFIRQDFPGT	KLSLFGSSKN
GFGFKQSDLD	VCMTINGLET	AEGLDCVRTI	EELARVLRKH	SGLRNILPIT
TAKVPIVKFF	HLRSGLEVDI	SLYNTLALHN	TRLLSAYSAI	DPRVKYLCYT
MKVFTKMCDI	GDASRGSLSS	YAYTLMVLYF	LQQRNPPVIP	VLQEIYKGEK
KPEIFVDGWN	IYFFDQIDEL	PTYWSECGKN	TESVGQLWLG	LLRFYTEEFD
FKEHVISIRR	KSLLTTFKKQ	WTSKYIVIED	PFDLNHNLGA	GLSRKMTNFI
MKAFINGRRV	FGIPVKGFPK	DYPSKMEYFF	DPDVLTEGEL	APNDRCCRIC
GKIGHFMKDC	PMRRKVRRRR	DQEDALNQRY	PENKEKRSKE	DKEIHNKYTE
REVSTKEDKP	IQCTPQKAKP	MRAAADLGRE	KILRPPVEKW	KRQDDKDLRE
KRCFICGREG	HIKKECPQFK	GSSGSLSSKY	MTQGKASAKR	TQQES

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном магнію, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Mullen T.E., Marzluff W.F. (2008). Degradation of histone mRNA requires oligouridylation followed by decapping and simultaneous degradation of the mRNA both 5' to 3' and 3' to 5'. Genes Dev. 22: 50—65. PMID 18172165 DOI:10.1101/gad.1622708
Rissland O.S., Mikulasova A., Norbury C.J. (2007). Efficient RNA polyuridylation by noncanonical poly(A) polymerases. Mol. Cell. Biol. 27: 3612—3624. PMID 17353264 DOI:10.1128/MCB.02209-06
Thornton J.E., Chang H.M., Piskounova E., Gregory R.I. (2012). Lin28-mediated control of let-7 microRNA expression by alternative TUTases Zcchc11 (TUT4) and Zcchc6 (TUT7). RNA. 18: 1875—1885. PMID 22898984 DOI:10.1261/rna.034538.112

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25817 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q5VYS8 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.