ZCCHC6 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TUT7, PAPD6, zinc finger CCHC-type containing 6, TENT3B, ZCCHC6, terminal uridylyl transferase 7 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 613467 MGI: 2387179 HomoloGene: 51941 GeneCards: TUT7 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transferase activity • nucleotidyltransferase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA binding • RNA uridylyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • miRNA binding • uridylyltransferase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • нуклеоплазма • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • histone mRNA catabolic process • RNA 3'-end processing • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • oocyte maturation • negative regulation of transposition, RNA-mediated • GO:0061715 miRNA metabolic process • pre-miRNA processing • RNA 3' uridylation • polyuridylation-dependent mRNA catabolic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a0/PBB_GE_ZCCHC6_220933_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_ZCCHC6_220933_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001185059 NM_001185074 NM_024617 NM_001330718 |
| | NM_153538 NM_001373962 NM_001373963 NM_001373964 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001171988 NP_001172003 NP_001317647 NP_078893 |
| | NP_705766 NP_001360891 NP_001360892 NP_001360893 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 86.29 – 86.35 Mb | Хр. 13: 59.92 – 59.97 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ZCCHC6 (англ. Zinc finger CCHC-type containing 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 495 амінокислот, а молекулярна маса — 171 229[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGDTAKPYFV | | KRTKDRGTMD | | DDDFRRGHPQ | | QDYLIIDDHA | | KGHGSKMEKG |
LQKKKITPGN | | YGNTPRKGPC | | AVSSNPYAFK | | NPIYSQPAWM | | NDSHKDQSKR |
WLSDEHTGNS | | DNWREFKPGP | | RIPVINRQRK | | DSFQENEDGY | | RWQDTRGCRT |
VRRLFHKDLT | | SLETTSEMEA | | GSPENKKQRS | | RPRKPRKTRN | | EENEQDGDLE |
GPVIDESVLS | | TKELLGLQQA | | EERLKRDCID | | RLKRRPRNYP | | TAKYTCRLCD |
VLIESIAFAH | | KHIKEKRHKK | | NIKEKQEEEL | | LTTLPPPTPS | | QINAVGIAID |
KVVQEFGLHN | | ENLEQRLEIK | | RIMENVFQHK | | LPDCSLRLYG | | SSCSRLGFKN |
SDVNIDIQFP | | AIMSQPDVLL | | LVQECLKNSD | | SFIDVDADFH | | ARVPVVVCRE |
KQSGLLCKVS | | AGNENACLTT | | KHLTALGKLE | | PKLVPLVIAF | | RYWAKLCSID |
RPEEGGLPPY | | VFALMAIFFL | | QQRKEPLLPV | | YLGSWIEGFS | | LSKLGNFNLQ |
DIEKDVVIWE | | HTDSAAGDTG | | ITKEEAPRET | | PIKRGQVSLI | | LDVKHQPSVP |
VGQLWVELLR | | FYALEFNLAD | | LVISIRVKEL | | VSRELKDWPK | | KRIAIEDPYS |
VKRNVARTLN | | SQPVFEYILH | | CLRTTYKYFA | | LPHKITKSSL | | LKPLNAITCI |
SEHSKEVINH | | HPDVQTKDDK | | LKNSVLAQGP | | GATSSAANTC | | KVQPLTLKET |
AESFGSPPKE | | EMGNEHISVH | | PENSDCIQAD | | VNSDDYKGDK | | VYHPETGRKN |
EKEKVGRKGK | | HLLTVDQKRG | | EHVVCGSTRN | | NESESTLDLE | | GFQNPTAKEC |
EGLATLDNKA | | DLDGESTEGT | | EELEDSLNHF | | THSVQGQTSE | | MIPSDEEEED |
DEEEEEEEEP | | RLTINQREDE | | DGMANEDELD | | NTYTGSGDED | | ALSEEDDELG |
EAAKYEDVKE | | CGKHVERALL | | VELNKISLKE | | ENVCEEKNSP | | VDQSDFFYEF |
SKLIFTKGKS | | PTVVCSLCKR | | EGHLKKDCPE | | DFKRIQLEPL | | PPLTPKFLNI |
LDQVCIQCYK | | DFSPTIIEDQ | | AREHIRQNLE | | SFIRQDFPGT | | KLSLFGSSKN |
GFGFKQSDLD | | VCMTINGLET | | AEGLDCVRTI | | EELARVLRKH | | SGLRNILPIT |
TAKVPIVKFF | | HLRSGLEVDI | | SLYNTLALHN | | TRLLSAYSAI | | DPRVKYLCYT |
MKVFTKMCDI | | GDASRGSLSS | | YAYTLMVLYF | | LQQRNPPVIP | | VLQEIYKGEK |
KPEIFVDGWN | | IYFFDQIDEL | | PTYWSECGKN | | TESVGQLWLG | | LLRFYTEEFD |
FKEHVISIRR | | KSLLTTFKKQ | | WTSKYIVIED | | PFDLNHNLGA | | GLSRKMTNFI |
MKAFINGRRV | | FGIPVKGFPK | | DYPSKMEYFF | | DPDVLTEGEL | | APNDRCCRIC |
GKIGHFMKDC | | PMRRKVRRRR | | DQEDALNQRY | | PENKEKRSKE | | DKEIHNKYTE |
REVSTKEDKP | | IQCTPQKAKP | | MRAAADLGRE | | KILRPPVEKW | | KRQDDKDLRE |
KRCFICGREG | | HIKKECPQFK | | GSSGSLSSKY | | MTQGKASAKR | | TQQES |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном магнію, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Mullen T.E., Marzluff W.F. (2008). Degradation of histone mRNA requires oligouridylation followed by decapping and simultaneous degradation of the mRNA both 5' to 3' and 3' to 5'. Genes Dev. 22: 50—65. PMID 18172165 DOI:10.1101/gad.1622708
- Rissland O.S., Mikulasova A., Norbury C.J. (2007). Efficient RNA polyuridylation by noncanonical poly(A) polymerases. Mol. Cell. Biol. 27: 3612—3624. PMID 17353264 DOI:10.1128/MCB.02209-06
- Thornton J.E., Chang H.M., Piskounova E., Gregory R.I. (2012). Lin28-mediated control of let-7 microRNA expression by alternative TUTases Zcchc11 (TUT4) and Zcchc6 (TUT7). RNA. 18: 1875—1885. PMID 22898984 DOI:10.1261/rna.034538.112
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25817 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q5VYS8 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |