| ZC3H12A |
|---|
|
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| Список кодів PDB | | 3V32, 3V33, 3V34 | | |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | ZC3H12A, MCPIP, MCPIP1, dJ423B22.1, zinc finger CCCH-type containing 12A, Reg1, MCPIP-1 |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 610562 MGI: 2385891 HomoloGene: 11824 GeneCards: ZC3H12A |
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • miRNA binding
• chromatin binding
• зв'язування з іоном металу
• ribonuclease activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• nuclease activity
• endonuclease activity
• mRNA binding
• hydrolase activity
• ribosome binding
• mRNA 3'-UTR binding
• mRNA 3'-UTR AU-rich region binding
• DNA binding
• RNA binding
• endoribonuclease activity
• exoribonuclease activity
• thiol-dependent deubiquitinase
• RNA stem-loop binding
|
|---|
| Клітинна компонента | • цитоплазма
• нуклеоплазма
• цитоскелет
• клітинне ядро
• extrinsic component of endoplasmic reticulum membrane
• ендоплазматичний ретикулум
• rough endoplasmic reticulum membrane
• rough endoplasmic reticulum
• P-body
• мембрана
• cytoplasmic ribonucleoprotein granule
• GO:0009327 protein-containing complex
|
|---|
| Біологічний процес | • positive regulation of p38MAPK cascade
• cellular response to virus
• диференціація клітин
• positive regulation of cell death
• positive regulation of autophagy
• negative regulation of interleukin-6 production
• positive regulation of lipid storage
• negative regulation of macrophage activation
• cellular response to tumor necrosis factor
• negative regulation of gene expression
• positive regulation of angiogenesis
• negative regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA
• positive regulation of endothelial cell migration
• multicellular organism development
• protein deubiquitination
• GO:1901313 positive regulation of gene expression
• positive regulation of reactive oxygen species metabolic process
• protein complex oligomerization
• Ангіогенез
• регуляція експресії генів
• positive regulation of protein import into nucleus
• negative regulation by host of viral genome replication
• negative regulation of tumor necrosis factor production
• positive regulation of miRNA catabolic process
• negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity
• positive regulation of defense response to virus by host
• GO:0097285 апоптоз
• RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic
• процес імунної системи
• negative regulation of muscle cell apoptotic process
• negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• transcription, DNA-templated
• positive regulation of fat cell differentiation
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• nuclear-transcribed mRNA catabolic process, endonucleolytic cleavage-dependent decay
• defense response to virus
• cellular response to glucose starvation
• нейробіологія розвитку
• negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response
• cellular response to sodium arsenite
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
• GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation
• cellular response to ionomycin
• positive regulation of mRNA catabolic process
• cellular response to lipopolysaccharide
• cellular response to oxidative stress
• RNA phosphodiester bond hydrolysis
• negative regulation of nitric oxide biosynthetic process
• cellular response to interleukin-1
• positive regulation of protein deubiquitination
• cellular response to chemokine
• inflammatory response
• 3'-UTR-mediated mRNA destabilization
• negative regulation of cardiac muscle contraction
• positive regulation of execution phase of apoptosis
• RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic
• cellular response to DNA damage stimulus
• immune response-activating signal transduction
• negative regulation of NIK/NF-kappaB signaling
• T cell receptor signaling pathway
• negative regulation of T-helper 17 cell differentiation
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | NM_025079
NM_001323550
NM_001323551 |
| |
|---|
| RefSeq (білок) | | NP_001310479
NP_001310480
NP_079355 |
| |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 1: 37.47 – 37.48 Mb | Хр. 4: 125.01 – 125.02 Mb |
|---|
| PubMed search | [1] | [2] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ZC3H12A (англ. Zinc finger CCCH-type containing 12A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 599 амінокислот, а молекулярна маса — 65 699[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MSGPCGEKPV | | LEASPTMSLW | | EFEDSHSRQG | | TPRPGQELAA | | EEASALELQM |
| KVDFFRKLGY | | SSTEIHSVLQ | | KLGVQADTNT | | VLGELVKHGT | | ATERERQTSP |
| DPCPQLPLVP | | RGGGTPKAPN | | LEPPLPEEEK | | EGSDLRPVVI | | DGSNVAMSHG |
| NKEVFSCRGI | | LLAVNWFLER | | GHTDITVFVP | | SWRKEQPRPD | | VPITDQHILR |
| ELEKKKILVF | | TPSRRVGGKR | | VVCYDDRFIV | | KLAYESDGIV | | VSNDTYRDLQ |
| GERQEWKRFI | | EERLLMYSFV | | NDKFMPPDDP | | LGRHGPSLDN | | FLRKKPLTLE |
| HRKQPCPYGR | | KCTYGIKCRF | | FHPERPSCPQ | | RSVADELRAN | | ALLSPPRAPS |
| KDKNGRRPSP | | SSQSSSLLTE | | SEQCSLDGKK | | LGAQASPGSR | | QEGLTQTYAP |
| SGRSLAPSGG | | SGSSFGPTDW | | LPQTLDSLPY | | VSQDCLDSGI | | GSLESQMSEL |
| WGVRGGGPGE | | PGPPRAPYTG | | YSPYGSELPA | | TAAFSAFGRA | | MGAGHFSVPA |
| DYPPAPPAFP | | PREYWSEPYP | | LPPPTSVLQE | | PPVQSPGAGR | | SPWGRAGSLA |
| KEQASVYTKL | | CGVFPPHLVE | | AVMGRFPQLL | | DPQQLAAEIL | | SYKSQHPSE |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, нуклеаз, білків розвитку, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, імунітет, відповідь на стрес, транскрипція, регуляція транскрипції, запальна відповідь, пошкодження ДНК, ангіогенез, диференціація, нейрогенез, антивірусний захист, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, іоном магнію, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Niu J., Azfer A., Zhelyabovska O., Fatma S., Kolattukudy P.E. (2008). Monocyte chemotactic protein (MCP)-1 promotes angiogenesis via a novel transcription factor, MCP-1-induced protein (MCPIP). J. Biol. Chem. 283: 14542—14551. PMID 18364357 DOI:10.1074/jbc.M802139200
- Vrotsos E.G., Kolattukudy P.E., Sugaya K. (2009). MCP-1 involvement in glial differentiation of neuroprogenitor cells through APP signaling. Brain Res. Bull. 79: 97—103. PMID 19185603 DOI:10.1016/j.brainresbull.2009.01.004
- Roy A., Zhang M., Saad Y., Kolattukudy P.E. (2013). Antidicer RNase activity of monocyte chemotactic protein-induced protein-1 is critical for inducing angiogenesis. Am. J. Physiol. 305: C1021—C1032. PMID 24048733 DOI:10.1152/ajpcell.00203.2013
- Uehata T., Akira S. (2013). mRNA degradation by the endoribonuclease Regnase-1/ZC3H12a/MCPIP-1. Biochim. Biophys. Acta. 1829: 708—713. PMID 23500036 DOI:10.1016/j.bbagrm.2013.03.001
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26259 (англ.) . Архів оригіналу за 7 червня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q5D1E8 (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
| На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
