YTHDC2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | YTHDC2, CAHL, YTH domain containing 2, hYTHDC2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 616530 MGI: 2448561 HomoloGene: 11265 GeneCards: YTHDC2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase binding • ATP binding • hydrolase activity • GO:0008026 helicase activity • nucleic acid binding • ATP-dependent activity, acting on RNA • RNA binding • N6-methyladenosine-containing RNA binding • GO:0034459 3'-5' RNA helicase activity |
---|
Клітинна компонента | • ендоплазматичний ретикулум • цитоплазма • клітинне ядро • ribonucleoprotein granule |
---|
Біологічний процес | • response to tumor necrosis factor • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • response to interleukin-1 • positive regulation by host of viral genome replication • Сперматогенез • spermatid development • диференціація клітин • Оогенез • oocyte development • GO:0007126 мейоз • germline cell cycle switching, mitotic to meiotic cell cycle |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_022828 NM_001345975 NM_001345976 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001332904 NP_001332905 NP_073739 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 113.51 – 113.6 Mb | Хр. 18: 44.96 – 45.02 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
YTHDC2 (англ. YTH domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 430 амінокислот, а молекулярна маса — 160 248[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSRPSSVSPR | | QPAPGGGGGG | | GPSPCGPGGG | | GRAKGLKDIR | | IDEEVKIAVN |
IALERFRYGD | | QREMEFPSSL | | TSTERAFIHR | | LSQSLGLVSK | | SKGKGANRYL |
TVKKKDGSET | | AHAMMTCNLT | | HNTKHAVRSL | | IQRFPVTNKE | | RTELLPKTER |
GNVFAVEAEN | | REMSKTSGRL | | NNGIPQIPVK | | RGESEFDSFR | | QSLPVFEKQE |
EIVKIIKENK | | VVLIVGETGS | | GKTTQIPQFL | | LDDCFKNGIP | | CRIFCTQPRR |
LAAIAVAERV | | AAERRERIGQ | | TIGYQIRLES | | RVSPKTLLTF | | CTNGVLLRTL |
MAGDSTLSTV | | THVIVDEVHE | | RDRFSDFLLT | | KLRDLLQKHP | | TLKLILSSAA |
LDVNLFIRYF | | GSCPVIYIQG | | RPFEVKEMFL | | EDILRTTGYT | | NKEMLKYKKE |
KQQEEKQQTT | | LTEWYSAQEN | | SFKPESQRQR | | TVLNVTDEYD | | LLDDGGDAVF |
SQLTEKDVNC | | LEPWLIKEMD | | ACLSDIWLHK | | DIDAFAQVFH | | LILTENVSVD |
YRHSETSATA | | LMVAAGRGFA | | SQVEQLISMG | | ANVHSKASNG | | WMALDWAKHF |
GQTEIVDLLE | | SYSATLEFGN | | LDESSLVQTN | | GSDLSAEDRE | | LLKAYHHSFD |
DEKVDLDLIM | | HLLYNICHSC | | DAGAVLIFLP | | GYDEIVGLRD | | RILFDDKRFA |
DSTHRYQVFM | | LHSNMQTSDQ | | KKVLKNPPAG | | VRKIILSTNI | | AETSITVNDV |
VFVIDSGKVK | | EKSFDALNFV | | TMLKMVWISK | | ASAIQRKGRA | | GRCRPGICFR |
LFSRLRFQNM | | LEFQTPELLR | | MPLQELCLHT | | KLLAPVNCPI | | ADFLMKAPEP |
PPALIVRNAV | | QMLKTIDAMD | | TWEDLTELGY | | HLADLPVEPH | | LGKMVLCAVV |
LKCLDPILTI | | ACTLAYRDPF | | VLPTQASQKR | | AAMLCRKRFT | | AGAFSDHMAL |
LRAFQAWQKA | | RSDGWERAFC | | EKNFLSQATM | | EIIIGMRTQL | | LGQLRASGFV |
RARGGGDIRD | | VNTNSENWAV | | VKAALVAGMY | | PNLVHVDREN | | LVLTGPKEKK |
VRFHPASVLS | | QPQYKKIPPA | | NGQAAAIKAL | | PTDWLIYDEM | | TRAHRIANIR |
CCSAVTPVTI | | LVFCGPARLA | | SNALQEPSSF | | RVDGIPNDSS | | DSEMEDKTTA |
NLAALKLDEW | | LHFTLEPEAA | | SLLLQLRQKW | | HSLFLRRMRA | | PSKPWSQVDE |
ATIRAIIAVL | | STEEQSAGLQ | | QPSGIGQRPR | | PMSSEELPLA | | SSWRSNNSRK |
SSADTEFSDE | | CTTAERVLMK | | SPSPALHPPQ | | KYKDRGILHP | | KRGTEDRSDQ |
SSLKSTDSSS | | YPSPCASPSP | | PSSGKGSKSP | | SPRPNMPVRY | | FIMKSSNLRN |
LEISQQKGIW | | STTPSNERKL | | NRAFWESSIV | | YLVFSVQGSG | | HFQGFSRMSS |
EIGREKSQDW | | GSAGLGGVFK | | VEWIRKESLP | | FQFAHHLLNP | | WNDNKKVQIS |
RDGQELEPLV | | GEQLLQLWER | | LPLGEKNTTD |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24721 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H6S0 (англ.) . Архів оригіналу за 20 листопада 2016. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |