XIRP2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | XIRP2, CMYA3, xin actin binding repeat containing 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609778 MGI: 2685198 HomoloGene: 19388 GeneCards: XIRP2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • alpha-actinin binding • actin binding • actin filament binding |
---|
Клітинна компонента | • міжклітинні контакти • Z discdkac • stress fiber • focal adhesion • filamentous actin |
---|
Біологічний процес | • heart development • cell-cell junction organization • cardiac muscle tissue morphogenesis • ventricular septum development • actin cytoskeleton organization • GO:0022610 життєдіяльність |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_152381 NM_001079810 NM_001199143 NM_001199144 NM_001199145 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001073278 NP_001186072 NP_001186073 NP_001186074 NP_689594 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 166.89 – 167.26 Mb | Хр. 2: 67 – 67.36 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
XIRP2 (англ. Xin actin binding repeat containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 374 амінокислот, а молекулярна маса — 382 300[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSPESGHSRI | | FEATAGPNKP | | ESGFAEDSAA | | RGEGVSDLHE | | VVSLKERMAR |
YQAAVSRGDC | | RSFSANMMEE | | SEMCAVPGGL | | AKVKKQFEDE | | ITSSRNTFAQ |
YQYQHQNRSE | | QEAIHSSQVG | | TSRSSQEMAR | | NEQEGSKVQK | | IDVHGTEMVS |
HLEKHTEEVN | | QASQFHQYVQ | | ETVIDTPEDE | | EIPKVSTKLL | | KEQFEKSAQE |
KILYSDKEMT | | TPAKQIKTES | | EYEETFKPSS | | VVSTSSTSCV | | STSQRKETST |
TRYSDHSVTS | | STLAQINATS | | SGMTEEFPPP | | PPDVLQTSVD | | VTAFSQSPEL |
PSPPRRLPVP | | KDVYSKQRNL | | YELNRLYKHI | | HPELRKNLEK | | DYISEVSEIV |
SSQMNSGSSV | | SADVQQARYV | | FENTNDSSQK | | DLNSEREYLE | | WDEILKGEVQ |
SIRWIFENQP | | LDSINNGSPD | | EGDISRGIAD | | QEIIAGGDVK | | YTTWMFETQP |
IDTLGAYSSD | | TVENAEKIPE | | LARGDVCTAR | | WMFETRPLDS | | MNKMHQSQEE |
SAVTISKDIT | | GGDVKTVRYM | | FETQHLDQLG | | QLHSVDEVHL | | LQLRSELKEI |
KGNVKRSIKC | | FETQPLYVIR | | DGSGQMLEIK | | TVHREDVEKG | | DVRTARWMFE |
TQPLDTINKD | | ITEIKVVRGI | | SMEENVKGGV | | SKAKWLFETQ | | PLEKIKESEE |
VIIEKEKIIG | | TDVSRKCWMF | | ETQPLDILKE | | VPDADSLQRE | | EIIGGDVQTT |
KHLFETLPIE | | ALKDSPDIGK | | LQKITASEEE | | KGDVRHQKWI | | FETQPLEDIR |
KDKKEYTRTV | | KLEEVDRGDV | | KNYTHIFESN | | NLIKFDASHK | | IEVEGVTRGA |
VELNKSLFET | | TPLYAIQDPL | | GKYHQVKTVQ | | QEEIVRGDVR | | SCRWLFETRP |
IDQFDESIHK | | FQIIRGISAQ | | EIQTGNVKSA | | KWLFETQPLD | | SIKYFSDVEE |
TESKTEQTRD | | IVKGDVKTCK | | WLFETQPMES | | LYEKVSLMTS | | SEEIHKGDVK |
TCTWLFETQP | | LDTIKDDSET | | AVKLQTVKQE | | EIQGGDVRTA | | CFLFETENLD |
SIQGEEVKEI | | KPVEMDIQAG | | DVSSMRYKFE | | NQSLDSISSS | | SEEVLKKIKT |
LKTEDIQKGN | | VLNCRWLFEN | | QPIDKIKESQ | | EGDECVKTVT | | DIQGGDVRKG |
CFIFETFSLD | | EIKEESDYIS | | TKKTITEEVI | | QGDVKSYRML | | FETQPLYAIQ |
DREGSYHEVT | | TVKKEEVIHG | | DVRGTRWLFE | | TKPLDSINKS | | ETVYVIKSVT |
QEDIQKGDVS | | SVRYRFETQP | | LDQISEESHN | | IMPSIDHIQG | | GNVKTSRQFF |
ESENFDKNNY | | IRTVSVNEIQ | | KGNVKTSTWL | | FETHTMDELR | | GEGLEYENIK |
TVTQEDVQKG | | DVKQAVWLFE | | NRTFDSIMEA | | HKGITKMTKE | | EIPPSDVKTT |
TWLFETTPLH | | EFNETRVEKI | | EIIGKSIKET | | LEDLYSQKVI | | QAPGIIIEAD |
EIGDVRMAKY | | KLMNQASPEI | | QKEEIIRADL | | RNIMVNLLSK | | RDCTEREILI |
SEEEKGNVNL | | TKTQLLNRST | | EFHAEKEEIV | | KGDVQQAIKN | | LFSEERSVKK |
GILIQEDEKG | | DINMTIYCLL | | HENDGDTIER | | EEVIGGDVKR | | TIHNLLSSTS |
NNKISERAKI | | DASERGNVQF | | FTTCIEAGAL | | DYLKQLHTES | | NETLTAKKQE |
GEKEIIGGDV | | EGTKLLLKKR | | QSLVERTVSE | | TDIIPGDVHN | | TVKVFMTEPQ |
STFGKIPKEE | | IIKGDLTSTL | | NSLSQAVNQK | | TVTKTEEIIK | | GNMLATLKSL |
KESSHRWKES | | KQPDAIPGDI | | EKAIECLEKA | | TNTKTEILKK | | ELLKDDLETS |
LRSLKEAQRS | | FKEVHKEGVI | | KKDAKAVMAG | | SSGEQKTDIH | | QVAVQRNKNS |
LLQPKPGPFE | | PAAKWQGGAD | | TLSQTMGKSC | | HGNLVEERTE | | VNLPKAPKGT |
VKIVIDREQN | | NDALEKSLRR | | LSNSHHKSNV | | LESGDKTGVW | | TDTTGEQHLR |
DEYMSRQLTS | | TVSVKNNLTT | | KESDRAVREL | | KKDDVFNSIQ | | SAGKTVGKQQ |
TYELRNDHQK | | MEGFHIKSPK | | KTKNIKILTD | | TQSSKPSPTQ | | HPVSMPVGGT |
YDLSGDFQKQ | | TLLKQETKYS | | NKDIKKKNIN | | LQPMWQLLPV | | EQDTSNVTEM |
KVSEKSHNTF | | KATNKKRETD | | VHLKSQDFLM | | KTNTSTGLKM | | AMERSLNPIN |
FNPENNVKES | | ECPLPPPSPP | | PPPPSNASSE | | IEFPLPPPPP | | LMMFPEKNGF |
LPSLSTEKIK | | AEFESFPGLP | | LPPPPVDEKS | | ERESSSMFLP | | PPPPPTPSQK |
PAHLLSSSAP | | EKHSGDFMQQ | | YSQKEASNSQ | | NSQAKIITGK | | TGVLPPPTLP |
KPKLPKHIKD | | NKNDFSPKVE | | LATSLSDMEC | | KITTSKDQKK | | VMVMTSSEHT |
ETKQNVISKS | | LDERKQLSID | | SANCLSHTVP | | GTSAPRKKQI | | APLIKSHSFP |
ESSGQQNPKP | | YMRKFKTPLM | | IAEEKYRQQK | | EEIEKQKQES | | SYYNIVKTQS |
QNQHITEVEK | | EMPLQKTNEE | | VSLSGIDSEC | | TVVQPSPGSQ | | SNARILGVCS |
DNQLSTTSPE | | TVAAKRLHHV | | LAASEDKDKM | | KKEVLQSSRD | | IMQSKSACEI |
KQSHQECSTQ | | QTQQKKYLEQ | | LHLPQSKPIS | | PNFKVKTIKL | | PTLDHTLNET |
DHSYESHKQQ | | SEIDVQTFTK | | KQYLKTKKTE | | ASTECSHKQS | | LAERHYQLPK |
KEKRVTVQLP | | TESIQKNQED | | KLKMVPRKQR | | EFSGSDRGKL | | PGSEEKNQGP |
SMIGRKEERL | | ITERKHEHLK | | NKSAPKVVKQ | | KVIDAHLDSQ | | TQNFQQTQIQ |
TAESKAEHKK | | LPQPYNSLQE | | EKCLEVKGIQ | | EKQVFSNTKD | | SKQEITQNKS |
FFSSVKESQR | | DDGKGALNIV | | EFLRKREELQ | | QILSRVKQFE | | AEPNKSGLKT |
FQTLLNTIPG | | WLISEDKREY | | AVHIAMENNL | | EKVKEEITHI | | KTQAEDMLVS |
YENIIQTAMM | | SSKTGKPGNK | | PTSLDETSSK | | VSNVHVSNNK | | NSEQKENKIA |
KEKTVQHQVA | | AHHEATVRSH | | VKTHQEIKLD | | DSNIPPPSLK | | TRPPSPTFIT |
IESTARRTEN | | PTKNELSQSP | | KKDSYVEPPP | | RRPMSQKSEI | | HRANTSPSPP |
RSRSEQLVRL | | KDTTAKLSKG | | AIPCPAATPV | | PIVEKRSEII | | MSPATLRRQI |
KIETRGRDSP | | PTITIPVNIN | | HAASGSFRES | | VDAQEEIRKV | | EKRATYVHKD |
GLNSTDHMVP | | DTESYDAVEI | | IRKVAVPPRL | | SEHTQRYEAA | | NRTVQMAENF |
VNDPENEINR | | WFREFEHGPV | | SEAKSNRRVY | | AKGETNHNIQ | | QESRTFCKEE |
FGLTSLGNTS | | FTDFSCKHPR | | ELREKIPVKQ | | PRICSETRSL | | SEHFSGMDAF |
ESQIVESKMK | | TSSSHSSEAG | | KSGCDFKHAP | | PTYEDVIAGH | | ILDISDSPKE |
VRKNFQKTWQ | | ESGRVFKGLG | | YATADASATE | | MRTTFQEESA | | FISEAAAPRQ |
GNMYTLSKDS | | LSNGVPSGRQ | | AEFS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинних контактах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14303 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
- ↑ UniProt, A4UGR9 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |