VTA1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2LXL, 2LXM, 4TXP, 4TXQ, 4TXR, 4U7E | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | VTA1, C6orf55, DRG-1, DRG1, LIP5, My012, SBP1, HSPC228, vesicle trafficking 1, 6orf55 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610902 MGI: 1913451 HomoloGene: 6473 GeneCards: VTA1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • ендосома • endosome membrane • екзосома • мембрана • нуклеоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела |
---|
Біологічний процес | • protein transport • endosomal transport • multivesicular body assembly • GO:0019067 viral life cycle • multivesicular body sorting pathway • ESCRT III complex disassembly • macroautophagy • GO:0015915 транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_016485 NM_001286371 NM_001286372 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001273300 NP_001273301 NP_057569 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 142.15 – 142.22 Mb | Хр. 10: 14.53 – 14.58 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
VTA1 (англ. Vesicle trafficking 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 307 амінокислот, а молекулярна маса — 33 879[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAALAPLPPL | | PAQFKSIQHH | | LRTAQEHDKR | | DPVVAYYCRL | | YAMQTGMKID |
SKTPECRKFL | | SKLMDQLEAL | | KKQLGDNEAI | | TQEIVGCAHL | | ENYALKMFLY |
ADNEDRAGRF | | HKNMIKSFYT | | ASLLIDVITV | | FGELTDENVK | | HRKYARWKAT |
YIHNCLKNGE | | TPQAGPVGIE | | EDNDIEENED | | AGAASLPTQP | | TQPSSSSTYD |
PSNMPSGNYT | | GIQIPPGAHA | | PANTPAEVPH | | STGVASNTIQ | | PTPQTIPAID |
PALFNTISQG | | DVRLTPEDFA | | RAQKYCKYAG | | SALQYEDVST | | AVQNLQKALK |
LLTTGRE |
Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Shim S., Merrill S.A., Hanson P.I. (2008). Novel interactions of ESCRT-III with LIP5 and VPS4 and their implications for ESCRT-III disassembly. Mol. Biol. Cell. 19: 2661—2672. PMID 18385515 DOI:10.1091/mbc.E07-12-1263
- Kuang Z., Seo E.J., Leis J. (2011). Mechanism of inhibition of retrovirus release from cells by interferon-induced gene ISG15. J. Virol. 85: 7153—7161. PMID 21543490 DOI:10.1128/JVI.02610-10
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20954 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NP79 (англ.) . Архів оригіналу за 27 березня 2018. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |