VTA1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

VTA1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2LXL, 2LXM, 4TXP, 4TXQ, 4TXR, 4U7E

Ідентифікатори

Символи

VTA1, C6orf55, DRG-1, DRG1, LIP5, My012, SBP1, HSPC228, vesicle trafficking 1, 6orf55

Зовнішні ІД

OMIM: 610902 MGI: 1913451 HomoloGene: 6473 GeneCards: VTA1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • ендосома • endosome membrane • екзосома • мембрана • нуклеоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела
Біологічний процес	• protein transport • endosomal transport • multivesicular body assembly • GO:0019067 viral life cycle • multivesicular body sorting pathway • ESCRT III complex disassembly • macroautophagy • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51534


66201

Ensembl


ENSG00000009844


ENSMUSG00000019868

UniProt


Q9NP79


Q9CR26

RefSeq (мРНК)


NM_016485 NM_001286371 NM_001286372


NM_025418

RefSeq (білок)


NP_001273300 NP_001273301 NP_057569


NP_079694

Локус (UCSC)

Хр. 6: 142.15 – 142.22 Mb

Хр. 10: 14.53 – 14.58 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

VTA1 (англ. Vesicle trafficking 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 307 амінокислот, а молекулярна маса — 33 879^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAALAPLPPL	PAQFKSIQHH	LRTAQEHDKR	DPVVAYYCRL	YAMQTGMKID
SKTPECRKFL	SKLMDQLEAL	KKQLGDNEAI	TQEIVGCAHL	ENYALKMFLY
ADNEDRAGRF	HKNMIKSFYT	ASLLIDVITV	FGELTDENVK	HRKYARWKAT
YIHNCLKNGE	TPQAGPVGIE	EDNDIEENED	AGAASLPTQP	TQPSSSSTYD
PSNMPSGNYT	GIQIPPGAHA	PANTPAEVPH	STGVASNTIQ	PTPQTIPAID
PALFNTISQG	DVRLTPEDFA	RAQKYCKYAG	SALQYEDVST	AVQNLQKALK
LLTTGRE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Shim S., Merrill S.A., Hanson P.I. (2008). Novel interactions of ESCRT-III with LIP5 and VPS4 and their implications for ESCRT-III disassembly. Mol. Biol. Cell. 19: 2661—2672. PMID 18385515 DOI:10.1091/mbc.E07-12-1263
Kuang Z., Seo E.J., Leis J. (2011). Mechanism of inhibition of retrovirus release from cells by interferon-induced gene ISG15. J. Virol. 85: 7153—7161. PMID 21543490 DOI:10.1128/JVI.02610-10

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20954 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NP79 (англ.) . Архів оригіналу за 27 березня 2018. Процитовано 6 вересня 2017.