VARS2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | VARS2, COXPD20, VALRS, VARS2L, VARSL, valyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 612802 MGI: 1916165 HomoloGene: 57502 GeneCards: VARS2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • aminoacyl-tRNA ligase activity • nucleotide binding • valine-tRNA ligase activity • ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • aminoacyl-tRNA editing activity |
---|
Клітинна компонента | • мітохондрія • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • Біосинтез білків • tRNA aminoacylation for protein translation • valyl-tRNA aminoacylation • aminoacyl-tRNA metabolism involved in translational fidelity |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | ENSG00000137411 ENSG00000206476 ENSG00000234032 ENSG00000230985 ENSG00000236178
| ENSG00000223494 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_020442 NM_001167733 NM_001167734 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001161205 NP_001161206 NP_065175 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 30.91 – 30.93 Mb | Хр. 17: 35.97 – 35.98 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
VARS2 (англ. Valyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 063 амінокислот, а молекулярна маса — 118 490[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPHLPLASFR | | PPFWGLRHSR | | GLPRFHSVST | | QSEPHGSPIS | | RRNREAKQKR |
LREKQATLEA | | EIAGESKSPA | | ESIKAWRPKE | | LVLYEIPTKP | | GEKKDVSGPL |
PPAYSPRYVE | | AAWYPWWVRE | | GFFKPEYQAR | | LPQATGETFS | | MCIPPPNVTG |
SLHIGHALTV | | AIQDALVRWH | | RMRGDQVLWV | | PGSDHAGIAT | | QAVVEKQLWK |
ERGVRRHELS | | REAFLREVWQ | | WKEAKGGEIC | | EQLRALGASL | | DWDRECFTMD |
VGSSVAVTEA | | FVRLYKAGLL | | YRNHQLVNWS | | CALRSAISDI | | EVENRPLPGH |
TQLRLPGCPT | | PVSFGLLFSV | | AFPVDGEPDA | | EVVVGTTRPE | | TLPGDVAVAV |
HPDDSRYTHL | | HGRQLRHPLM | | GQPLPLITDY | | AVQPHVGTGA | | VKVTPAHSPA |
DAEMGARHGL | | SPLNVIAEDG | | TMTSLCGDWL | | QGLHRFVARE | | KIMSVLSEWG |
LFRGLQNHPM | | VLPICSRSGD | | VIEYLLKNQW | | FVRCQEMGAR | | AAKAVESGAL |
ELSPSFHQKN | | WQHWFSHIGD | | WCVSRQLWWG | | HQIPAYLVVE | | DHAQGEEDCW |
VVGRSEAEAR | | EVAAELTGRP | | GAELTLERDP | | DVLDTWFSSA | | LFPFSALGWP |
QETPDLARFY | | PLSLLETGSD | | LLLFWVGRMV | | MLGTQLTGQL | | PFSKVLLHPM |
VRDRQGRKMS | | KSLGNVLDPR | | DIISGVEMQV | | LQEKLRSGNL | | DPAELAIVAA |
AQKKDFPHGI | | PECGTDALRF | | TLCSHGVQAG | | DLHLSVSEVQ | | SCRHFCNKIW |
NALRFILNAL | | GEKFVPQPAE | | ELSPSSPMDA | | WILSRLALAA | | QECERGFLTR |
ELSLVTHALH | | HFWLHNLCDV | | YLEAVKPVLW | | HSPRPLGPPQ | | VLFSCADLGL |
RLLAPLMPFL | | AEELWQRLPP | | RPGCPPAPSI | | SVAPYPSACS | | LEHWRQPELE |
RRFSRVQEVV | | QVLRALRATY | | QLTKARPRVL | | LQSSEPGDQG | | LFEAFLEPLG |
TLGYCGAVGL | | LPPGAAAPSG | | WAQAPLSDTA | | QVYMELQGLV | | DPQIQLPLLA |
ARRYKLQKQL | | DSLTARTPSE | | GEAGTQRQQK | | LSSLQLELSK | | LDKAASHLRQ |
LMDEPPAPGS | | PEL |
Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, аміноацил-трнк-синтетаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мітохондрії.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21642 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q5ST30 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2018. Процитовано 19 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |