USP39 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | USP39, 65K, HSPC332, SAD1, SNRNP65, CGI-21, ubiquitin specific peptidase 39 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 611594 MGI: 107622 HomoloGene: 13183 GeneCards: USP39 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • thiol-dependent deubiquitinase • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex |
---|
Біологічний процес | • protein deubiquitination • mRNA splicing, via spliceosome • клітинний цикл • mRNA processing • Сплайсинг РНК • поділ клітини • spliceosomal complex assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/23/PBB_GE_USP39_217829_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_USP39_217829_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001256725 NM_001256726 NM_001256727 NM_001256728 NM_006590 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001243654 NP_001243655 NP_001243656 NP_001243657 NP_006581 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 85.6 – 85.65 Mb | Хр. 6: 72.3 – 72.32 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
USP39 (англ. Ubiquitin specific peptidase 39) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 565 амінокислот, а молекулярна маса — 65 381[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSGRSKRESR | | GSTRGKRESE | | SRGSSGRVKR | | ERDREREPEA | | ASSRGSPVRV |
KREFEPASAR | | EAPASVVPFV | | RVKREREVDE | | DSEPEREVRA | | KNGRVDSEDR |
RSRHCPYLDT | | INRSVLDFDF | | EKLCSISLSH | | INAYACLVCG | | KYFQGRGLKS |
HAYIHSVQFS | | HHVFLNLHTL | | KFYCLPDNYE | | IIDSSLEDIT | | YVLKPTFTKQ |
QIANLDKQAK | | LSRAYDGTTY | | LPGIVGLNNI | | KANDYANAVL | | QALSNVPPLR |
NYFLEEDNYK | | NIKRPPGDIM | | FLLVQRFGEL | | MRKLWNPRNF | | KAHVSPHEML |
QAVVLCSKKT | | FQITKQGDGV | | DFLSWFLNAL | | HSALGGTKKK | | KKTIVTDVFQ |
GSMRIFTKKL | | PHPDLPAEEK | | EQLLHNDEYQ | | ETMVESTFMY | | LTLDLPTAPL |
YKDEKEQLII | | PQVPLFNILA | | KFNGITEKEY | | KTYKENFLKR | | FQLTKLPPYL |
IFCIKRFTKN | | NFFVEKNPTI | | VNFPITNVDL | | REYLSEEVQA | | VHKNTTYDLI |
ANIVHDGKPS | | EGSYRIHVLH | | HGTGKWYELQ | | DLQVTDILPQ | | MITLSEAYIQ |
IWKRRDNDET | | NQQGA |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, клітинний цикл, поділ клітини, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.
Література
- Makarova O.V., Makarov E.M., Luehrmann R. (2001). The 65 and 110 kDa SR-related proteins of the U4/U6*U5 tri-snRNP are essential for the assembly of mature spliceosomes. EMBO J. 20: 2553—2563. PMID 11350945 DOI:10.1093/emboj/20.10.2553
- Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP. RNA. 12: 1418—1430. PMID 16723661 DOI:10.1261/rna.55406
- van Leuken R.J., Luna-Vargas M.P., Sixma T.K., Wolthuis R.M., Medema R.H. (2008). Usp39 is essential for mitotic spindle checkpoint integrity and controls mRNA-levels of aurora B. Cell Cycle. 7: 2710—2719. PMID 18728397
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20071 (англ.) . Архів оригіналу за 15 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q53GS9 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |