USO1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2W3C

Ідентифікатори

Символи

USO1, P115, TAP, VDP, USO1 vesicle transport factor

Зовнішні ІД

OMIM: 603344 MGI: 1929095 HomoloGene: 2754 GeneCards: USO1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • cadherin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • мембрана • Golgi membrane • transport vesicle • ендоплазматичний ретикулум • perinuclear region of cytoplasm • ER to Golgi transport vesicle membrane • Golgi stack • fibrillar center
Біологічний процес	• vesicle fusion with Golgi apparatus • membrane fusion • Цитопемпсис • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • COPII vesicle coating • Golgi vesicle docking • protein transport • intracellular protein transport • vesicle-mediated transport • Golgi organization • GO:0015915 транспорт • small GTPase mediated signal transduction • secretory granule localization • regulation of cellular response to insulin stimulus
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8615


56041

Ensembl


ENSG00000138768


ENSMUSG00000029407

UniProt


O60763


Q9Z1Z0

RefSeq (мРНК)


NM_001290049 NM_003715


NM_019490

RefSeq (білок)


NP_001276978 NP_003706


NP_062363

Локус (UCSC)

Хр. 4: 75.72 – 75.81 Mb

Хр. 5: 92.29 – 92.35 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

USO1 (англ. USO1 vesicle transport factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 962 амінокислот, а молекулярна маса — 107 895^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNFLRGVMGG	QSAGPQHTEA	ETIQKLCDRV	ASSTLLDDRR	NAVRALKSLS
KKYRLEVGIQ	AMEHLIHVLQ	TDRSDSEIIG	YALDTLYNII	SNEEEEEVEE
NSTRQSEDLG	SQFTEIFIKQ	QENVTLLLSL	LEEFDFHVRW	PGVKLLTSLL
KQLGPQVQQI	ILVSPMGVSR	LMDLLADSRE	VIRNDGVLLL	QALTRSNGAI
QKIVAFENAF	ERLLDIISEE	GNSDGGIVVE	DCLILLQNLL	KNNNSNQNFF
KEGSYIQRMK	PWFEVGDENS	GWSAQKVTNL	HLMLQLVRVL	VSPTNPPGAT
SSCQKAMFQC	GLLQQLCTIL	MATGVPADIL	TETINTVSEV	IRGCQVNQDY
FASVNAPSNP	PRPAIVVLLM	SMVNERQPFV	LRCAVLYCFQ	CFLYKNQKGQ
GEIVSTLLPS	TIDATGNSVS	AGQLLCGGLF	STDSLSNWCA	AVALAHALQE
NATQKEQLLR	VQLATSIGNP	PVSLLQQCTN	ILSQGSKIQT	RVGLLMLLCT
WLSNCPIAVT	HFLHNSANVP	FLTGQIAENL	GEEEQLVQGL	CALLLGISIY
FNDNSLESYM	KEKLKQLIEK	RIGKENFIEK	LGFISKHELY	SRASQKPQPN
FPSPEYMIFD	HEFTKLVKEL	EGVITKAIYK	SSEEDKKEEE	VKKTLEQHDN
IVTHYKNMIR	EQDLQLEELR	QQVSTLKCQN	EQLQTAVTQQ	VSQIQQHKDQ
YNLLKIQLGK	DNQHQGSYSE	GAQMNGIQPE	EIGRLREEIE	ELKRNQELLQ
SQLTEKDSMI	ENMKSSQTSG	TNEQSSAIVS	ARDSEQVAEL	KQELATLKSQ
LNSQSVEITK	LQTEKQELLQ	KTEAFAKSVE	VQGETETIIA	TKTTDVEGRL
SALLQETKEL	KNEIKALSEE	RTAIKEQLDS	SNSTIAILQT	EKDKLELEIT
DSKKEQDDLL	VLLADQDQKI	LSLKNKLKDL	GHPVEEEDEL	ESGDQEDEDD
ESEDPGKDLD	HI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі.

Література

Sohda M., Misumi Y., Yano A., Takami N., Ikehara Y. (1998). Phosphorylation of the vesicle docking protein p115 regulates its association with the Golgi membrane. J. Biol. Chem. 273: 5385—5388. PMID 9478999 DOI:10.1074/jbc.273.9.5385
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Striegl H., Roske Y., Kuemmel D., Heinemann U. (2009). Unusual armadillo fold in the human general vesicular transport factor p115. PLoS ONE. 4: E4656—E4656. PMID 19247479 DOI:10.1371/journal.pone.0004656

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30904 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, O60763 (англ.) . Архів оригіналу за 2 грудня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.