UBE2K

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1YLA, 2O25, 3E46, 3F92, 3K9O, 3K9P, 5DFL

Ідентифікатори

Символи

UBE2K, E2-25K, HIP2, HYPG, LIG, UBC1, ubiquitin conjugating enzyme E2 K

Зовнішні ІД

OMIM: 602846 MGI: 1858216 HomoloGene: 3903 GeneCards: UBE2K

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity • nucleotide binding • ubiquitin-ubiquitin ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • ubiquitin protein ligase binding • ubiquitin conjugating enzyme activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • filopodium tip • клітинне ядро • гіалоплазма
Біологічний процес	• protein K48-linked ubiquitination • positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress • free ubiquitin chain polymerization • positive regulation of peptidyl-threonine phosphorylation • ubiquitin-dependent protein catabolic process • cellular response to interferon-beta • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3093


53323

Ensembl


ENSG00000078140


ENSMUSG00000029203

UniProt


P61086


P61087

RefSeq (мРНК)

NM_005339 NM_001111112 NM_001111113 NM_001312646 NM_001312647
NM_001312648 NM_032733


NM_016786 NM_001310618 NM_001310619

RefSeq (білок)

NP_001104582 NP_001104583 NP_001299575 NP_001299576 NP_001299577
NP_005330


NP_001297547 NP_001297548 NP_058066

Локус (UCSC)

Хр. 4: 39.7 – 39.78 Mb

Хр. 5: 65.69 – 65.76 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

UBE2K (англ. Ubiquitin conjugating enzyme E2 K) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 200 амінокислот, а молекулярна маса — 22 407^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MANIAVQRIK	REFKEVLKSE	ETSKNQIKVD	LVDENFTELR	GEIAGPPDTP
YEGGRYQLEI	KIPETYPFNP	PKVRFITKIW	HPNISSVTGA	ICLDILKDQW
AAAMTLRTVL	LSLQALLAAA	EPDDPQDAVV	ANQYKQNPEM	FKQTARLWAH
VYAGAPVSSP	EYTKKIENLC	AMGFDRNAVI	VALSSKSWDV	ETATELLLSN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Flierman D., Coleman C.S., Pickart C.M., Rapoport T.A., Chau V. (2006). E2-25K mediates US11-triggered retro-translocation of MHC class I heavy chains in a permeabilized cell system. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 11589—11594. PMID 16868077 DOI:10.1073/pnas.0605215103
Christensen D.E., Brzovic P.S., Klevit R.E. (2007). E2-BRCA1 RING interactions dictate synthesis of mono- or specific polyubiquitin chain linkages. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 941—948. PMID 17873885 DOI:10.1038/nsmb1295
David Y., Ziv T., Admon A., Navon A. (2010). The E2 ubiquitin-conjugating enzymes direct polyubiquitination to preferred lysines. J. Biol. Chem. 285: 8595—8604. PMID 20061386 DOI:10.1074/jbc.M109.089003
Oh K.J., Kalinina A., Bagchi S. (2010). Destabilization of Rb by human papillomavirus E7 is cell cycle dependent: E2-25K is involved in the proteolysis. Virology. 396: 118—124. PMID 19906396 DOI:10.1016/j.virol.2009.10.018
Wenzel D.M., Lissounov A., Brzovic P.S., Klevit R.E. (2011). UBCH7 reactivity profile reveals parkin and HHARI to be RING/HECT hybrids. Nature. 474: 105—108. PMID 21532592 DOI:10.1038/nature09966

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4914 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, P61086 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.