UBE2B

UBE2B
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1JAS, 2Y4W, 2YB6, 2YBF

Ідентифікатори
Символи UBE2B, E2-17kDa, HHR6B, HR6B, RAD6B, UBC2, ubiquitin conjugating enzyme E2 B
Зовнішні ІД OMIM: 179095 MGI: 102944 HomoloGene: 101298 GeneCards: UBE2B
Онтологія гена
Молекулярна функція

• transferase activity
• nucleotide binding
• GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity
• GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• ATP binding
• ubiquitin conjugating enzyme activity
• ubiquitin protein ligase binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• мембрана
• клітинна мембрана
• replication fork
• HULC complex
• нуклеоплазма
• XY body
• Хроматин
• клітинне ядро

Біологічний процес

• chiasma assembly
• histone H2A ubiquitination
• negative regulation of cAMP-mediated signaling
• postreplication repair
• ubiquitin-dependent protein catabolic process
• protein K63-linked ubiquitination
• meiotic telomere clustering
• positive regulation of reciprocal meiotic recombination
• protein stabilization
• protein polyubiquitination
• negative regulation of apoptotic process
• in utero embryonic development
• protein monoubiquitination
• sperm axoneme assembly
• cellular response to DNA damage stimulus
• protein K11-linked ubiquitination
• histone lysine demethylation
• protein K48-linked ubiquitination
• GO:0033127, GO:2000281, GO:2000817 regulation of histone modification
• Сперматогенез
• canonical Wnt signaling pathway
• synaptonemal complex organization
• response to UV
• proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
• protein autoubiquitination
• GO:0100026 Репарація ДНК
• Убіквітин-залежний протеоліз
• positive regulation of canonical Wnt signaling pathway

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7320
22210
Ensembl
ENSG00000119048
ENSMUSG00000020390
UniProt
P63146
P63147
RefSeq (мРНК)
NM_003337
NM_009458
NM_001362685
NM_001362686
RefSeq (білок)
NP_003328
NP_033484
NP_001349614
NP_001349615
Локус (UCSC) Хр. 5: 134.37 – 134.39 Mb Хр. 11: 51.88 – 51.89 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

UBE2B (англ. Ubiquitin conjugating enzyme E2 B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 152 амінокислот, а молекулярна маса — 17 312[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSTPARRRLMRDFKRLQEDPPVGVSGAPSENNIMQWNAVIFGPEGTPFED
GTFKLVIEFSEEYPNKPPTVRFLSKMFHPNVYADGSICLDILQNRWSPTY
DVSSILTSIQSLLDEPNPNSPANSQAAQLYQENKREYEKRVSAIVEQSWN
DS

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані.

Література

  • Woffendin C., Chen Z.Y., Staskus K., Retzel E.F., Plagemann P.G. (1991). Mammalian mRNAs encoding protein closely related to ubiquitin-conjugating enzyme encoded by yeast DNA repair gene RAD6. Biochim. Biophys. Acta. 1090: 81—85. PMID 1883845 DOI:10.1016/0167-4781(91)90039-O
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Kim J., Hake S.B., Roeder R.G. (2005). The human homolog of yeast BRE1 functions as a transcriptional coactivator through direct activator interactions. Mol. Cell. 20: 759—770. PMID 16337599 DOI:10.1016/j.molcel.2005.11.012
  • David Y., Ziv T., Admon A., Navon A. (2010). The E2 ubiquitin-conjugating enzymes direct polyubiquitination to preferred lysines. J. Biol. Chem. 285: 8595—8604. PMID 20061386 DOI:10.1074/jbc.M109.089003
  • Zhang F., Yu X. (2011). WAC, a functional partner of RNF20/40, regulates histone H2B ubiquitination and gene transcription. Mol. Cell. 41: 384—397. PMID 21329877 DOI:10.1016/j.molcel.2011.01.024
  • Miura T., Klaus W., Ross A., Guntert P., Senn H. (2002). The NMR structure of the class I human ubiquitin-conjugating enzyme 2b. J. Biomol. NMR. 22: 89—92. PMID 11885984 DOI:10.1023/A:1013807519703

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12473 (англ.) . Архів оригіналу за 6 липня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, P63146 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 5

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.