TRIP6

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1X61, 2DLO

Ідентифікатори

Символи

TRIP6, OIP-1, OIP1, TRIP-6, TRIP6i2, ZRP-1, thyroid hormone receptor interactor 6

Зовнішні ІД

OMIM: 602933 MGI: 1343458 HomoloGene: 37757 GeneCards: TRIP6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• kinase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • interleukin-1 receptor binding • зв'язування з іоном металу • thyroid hormone receptor binding • RNA binding
Клітинна компонента	• міжклітинні контакти • клітинна мембрана • interleukin-1 receptor complex • цитоскелет • клітинне ядро • focal adhesion • цитоплазма • гіалоплазма • stress fiber
Біологічний процес	• focal adhesion assembly • адгезія клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • positive regulation of cell migration • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • GO:0072468 сигнальна трансдукція
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7205


22051

Ensembl


ENSG00000087077


ENSMUSG00000023348

UniProt


Q15654


Q9Z1Y4

RefSeq (мРНК)


NM_003302


NM_011639

RefSeq (білок)


NP_003293


NP_035769

Локус (UCSC)

Хр. 7: 100.87 – 100.87 Mb

Хр. 5: 137.31 – 137.31 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRIP6 (англ. Thyroid hormone receptor interactor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 476 амінокислот, а молекулярна маса — 50 288^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGPTWLPPK	QPEPARAPQG	RAIPRGTPGP	PPAHGAALQP	HPRVNFCPLP
SEQCYQAPGG	PEDRGPAWVG	SHGVLQHTQG	LPADRGGLRP	GSLDAEIDLL
SSTLAELNGG	RGHASRRPDR	QAYEPPPPPA	YRTGSLKPNP	ASPLPASPYG
GPTPASYTTA	STPAGPAFPV	QVKVAQPVRG	CGPPRRGASQ	ASGPLPGPHF
PLPGRGEVWG	PGYRSQREPG	PGAKEEAAGV	SGPAGRGRGG	EHGPQVPLSQ
PPEDELDRLT	KKLVHDMNHP	PSGEYFGQCG	GCGEDVVGDG	AGVVALDRVF
HVGCFVCSTC	RAQLRGQHFY	AVERRAYCEG	CYVATLEKCA	TCSQPILDRI
LRAMGKAYHP	GCFTCVVCHR	GLDGIPFTVD	ATSQIHCIED	FHRKFAPRCS
VCGGAIMPEP	GQEETVRIVA	LDRSFHIGCY	KCEECGLLLS	SEGECQGCYP
LDGHILCKAC	SAWRIQELSA	TVTTDC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних контактах.

Література

Yi J., Beckerle M.C. (1998). The human TRIP6 gene encodes a LIM domain protein and maps to chromosome 7q22, a region associated with tumorigenesis. Genomics. 49: 314—316. PMID 9598321 DOI:10.1006/geno.1998.5248
Murthy K.K., Clark K., Fortin Y., Shen S.-H., Banville D. (1999). ZRP-1, a zyxin-related protein, interacts with the second PDZ domain of the cytosolic protein tyrosine phosphatase hPTP1E. J. Biol. Chem. 274: 20679—20687. PMID 10400701 DOI:10.1074/jbc.274.29.20679
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lee J.W., Choi H.-S., Gyuris J., Brent R., Moore D.D. (1995). Two classes of proteins dependent on either the presence or absence of thyroid hormone for interaction with the thyroid hormone receptor. Mol. Endocrinol. 9: 243—254. PMID 7776974 DOI:10.1210/mend.9.2.7776974
Xu J., Lai Y.-J., Lin W.-C., Lin F.-T. (2004). TRIP6 enhances lysophosphatidic acid-induced cell migration by interacting with the lysophosphatidic acid 2 receptor. J. Biol. Chem. 279: 10459—10468. PMID 14688263 DOI:10.1074/jbc.M311891200
Petit M.M.R., Crombez K.R.M.O., Vervenne H.B.V.K., Weyns N., Van de Ven W.J.M. (2005). The tumor suppressor Scrib selectively interacts with specific members of the zyxin family of proteins. FEBS Lett. 579: 5061—5068. PMID 16137684 DOI:10.1016/j.febslet.2005.08.012

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12311 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15654 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.