TRIM55 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

TRIM55

Ідентифікатори

Символи

TRIM55, MURF-2, RNF29, muRF2, tripartite motif containing 55

Зовнішні ІД

OMIM: 606469 MGI: 3036269 HomoloGene: 13205 GeneCards: TRIM55

Онтологія гена
Молекулярна функція	• zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signal transducer activity • зв'язування з іоном металу • identical protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • мікротрубочка • внутрішньоклітинний • клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0072468 сигнальна трансдукція
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84675


381485

Ensembl


ENSG00000147573


ENSMUSG00000060913

UniProt


Q9BYV6


G3X8Y1

RefSeq (мРНК)


NM_033058 NM_184085 NM_184086 NM_184087


NM_001081281

RefSeq (білок)


NP_149047 NP_908973 NP_908974 NP_908975


NP_001074750

Локус (UCSC)

Хр. 8: 66.13 – 66.18 Mb

Хр. 3: 19.7 – 19.75 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRIM55 (англ. Tripartite motif containing 55) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 548 амінокислот, а молекулярна маса — 60 466^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSASLNYKSF	SKEQQTMDNL	EKQLICPICL	EMFTKPVVIL	PCQHNLCRKC
ASDIFQASNP	YLPTRGGTTM	ASGGRFRCPS	CRHEVVLDRH	GVYGLQRNLL
VENIIDIYKQ	ESTRPEKKSD	QPMCEEHEEE	RINIYCLNCE	VPTCSLCKVF
GAHKDCQVAP	LTHVFQRQKS	ELSDGIAILV	GSNDRVQGVI	SQLEDTCKTI
EECCRKQKQE	LCEKFDYLYG	ILEERKNEMT	QVITRTQEEK	LEHVRALIKK
YSDHLENVSK	LVESGIQFMD	EPEMAVFLQN	AKTLLKKISE	ASKAFQMEKI
EHGYENMNHF	TVNLNREEKI	IREIDFYRED	EDEEEEEGGE	GEKEGEGEVG
GEAVEVEEVE	NVQTEFPGED	ENPEKASELS	QVELQAAPGA	LPVSSPEPPP
ALPPAADAPV	TQGEVVPTGS	EQTTESETPV	PAAAETADPL	FYPSWYKGQT
RKATTNPPCT	PGSEGLGQIG	PPGSEDSNVR	KAEVAAAAAS	ERAAVSGKET
SAPAATSQIG	FEAPPLQGQA	AAPASGSGAD	SEPARHIFSF	SWLNSLNE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до м'язових білків. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14215 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BYV6 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.