TRIM41

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2EGM

Ідентифікатори

Символи

TRIM41, RINCK, tripartite motif containing 41

Зовнішні ІД

OMIM: 610530 MGI: 2384814 HomoloGene: 14140 GeneCards: TRIM41

Онтологія гена
Молекулярна функція	• zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • identical protein binding • transferase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • ядерце • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • ядерні тільця
Біологічний процес	• Убіквітин-залежний протеоліз • cellular response to lipopolysaccharide • cellular response to muramyl dipeptide
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


90933


211007

Ensembl


ENSG00000146063


ENSMUSG00000040365

UniProt


Q8WV44


Q5NCC3

RefSeq (мРНК)


NM_033549 NM_201627


NM_145377

RefSeq (білок)


NP_291027 NP_963921


NP_663352

Локус (UCSC)

Хр. 5: 181.22 – 181.24 Mb

Хр. 11: 48.7 – 48.71 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRIM41 (англ. Tripartite motif containing 41) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 630 амінокислот, а молекулярна маса — 71 670^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAVAMTPNP	VQTLQEEAVC	AICLDYFTDP	VSIGCGHNFC	RVCVTQLWGG
EDEEDRDELD	REEEEEDGEE	EEVEAVGAGA	GWDTPMRDED	YEGDMEEEVE
EEEEGVFWTS	GMSRSSWDNM	DYVWEEEDEE	EDLDYYLGDM	EEEDLRGEDE
EDEEEVLEEV	EEEDLDPVTP	LPPPPAPRRC	FTCPQCRKSF	PRRSFRPNLQ
LANMVQVIRQ	MHPTPGRGSR	VTDQGICPKH	QEALKLFCEV	DEEAICVVCR
ESRSHKQHSV	VPLEEVVQEY	KAKLQGHVEP	LRKHLEAVQK	MKAKEERRVT
ELKSQMKSEL	AAVASEFGRL	TRFLAEEQAG	LERRLREMHE	AQLGRAGAAA
SRLAEQAAQL	SRLLAEAQER	SQQGGLRLLQ	DIKETFNRCE	EVQLQPPEVW
SPDPCQPHSH	DFLTDAIVRK	MSRMFCQAAR	VDLTLDPDTA	HPALMLSPDR
RGVRLAERRQ	EVADHPKRFS	ADCCVLGAQG	FRSGRHYWEV	EVGGRRGWAV
GAARESTHHK	EKVGPGGSSV	GSGDASSSRH	HHRRRRLHLP	QQPLLQREVW
CVGTNGKRYQ	AQSSTEQTLL	SPSEKPRRFG	VYLDYEAGRL	GFYNAETLAH
VHTFSAAFLG	ERVFPFFRVL	SKGTRIKLCP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Tanaka M., Fukuda Y., Mashima K., Hanai R. (2005). Intracellular localization and domain organization of human TRIM41 proteins. Mol. Biol. Rep. 32: 87—93. PMID 16022281 DOI:10.1007/s11033-004-6613-2
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kobayashi M., Hanai R. (2001). M phase-specific association of human topoisomerase IIIbeta with chromosomes. Biochem. Biophys. Res. Commun. 287: 282—287. PMID 11549288 DOI:10.1006/bbrc.2001.5580

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19013 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8WV44 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.