TRIM38 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRIM38, RNF15, RORET, tripartite motif containing 38 |
---|
Зовнішні ІД | MGI: 2684869 HomoloGene: 48427 GeneCards: TRIM38 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • zinc ion binding • signal transducer activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transferase activity |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • внутрішньоклітинний |
---|
Біологічний процес | • процес імунної системи • interferon-gamma-mediated signaling pathway • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • вроджений імунітет |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 25.96 – 25.99 Mb | Хр. 13: 23.95 – 23.98 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRIM38 (англ. Tripartite motif containing 38) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465 амінокислот, а молекулярна маса — 53 416[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASTTSTKKM | | MEEATCSICL | | SLMTNPVSIN | | CGHSYCHLCI | | TDFFKNPSQK |
QLRQETFCCP | | QCRAPFHMDS | | LRPNKQLGSL | | IEALKETDQE | | MSCEEHGEQF |
HLFCEDEGQL | | ICWRCERAPQ | | HKGHTTALVE | | DVCQGYKEKL | | QKAVTKLKQL |
EDRCTEQKLS | | TAMRITKWKE | | KVQIQRQKIR | | SDFKNLQCFL | | HEEEKSYLWR |
LEKEEQQTLS | | RLRDYEAGLG | | LKSNELKSHI | | LELEEKCQGS | | AQKLLQNVND |
TLSRSWAVKL | | ETSEAVSLEL | | HTMCNVSKLY | | FDVKKMLRSH | | QVSVTLDPDT |
AHHELILSED | | RRQVTRGYTQ | | ENQDTSSRRF | | TAFPCVLGCE | | GFTSGRRYFE |
VDVGEGTGWD | | LGVCMENVQR | | GTGMKQEPQS | | GFWTLRLCKK | | KGYVALTSPP |
TSLHLHEQPL | | LVGIFLDYEA | | GVVSFYNGNT | | GCHIFTFPKA | | SFSDTLRPYF |
QVYQYSPLFL | | PPPGD |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10059 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O00635 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |