TRAIP |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRAIP, RNF206, TRIP, SCKL9, TRAF interacting protein |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605958 MGI: 1096377 HomoloGene: 31343 GeneCards: TRAIP |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Seckel syndrome 9[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • transferase activity • zinc ion binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • ядерце • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • проліферація • Убіквітин-залежний протеоліз • negative regulation of interferon-beta production • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • GO:0097285 апоптоз • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 49.83 – 49.86 Mb | Хр. 9: 107.83 – 107.85 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRAIP (англ. TRAF interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 469 амінокислот, а молекулярна маса — 53 294[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPIRALCTIC | | SDFFDHSRDV | | AAIHCGHTFH | | LQCLIQWFET | | APSRTCPQCR |
IQVGKRTIIN | | KLFFDLAQEE | | ENVLDAEFLK | | NELDNVRAQL | | SQKDKEKRDS |
QVIIDTLRDT | | LEERNATVVS | | LQQALGKAEM | | LCSTLKKQMK | | YLEQQQDETK |
QAQEEARRLR | | SKMKTMEQIE | | LLLQSQRPEV | | EEMIRDMGVG | | QSAVEQLAVY |
CVSLKKEYEN | | LKEARKASGE | | VADKLRKDLF | | SSRSKLQTVY | | SELDQAKLEL |
KSAQKDLQSA | | DKEIMSLKKK | | LTMLQETLNL | | PPVASETVDR | | LVLESPAPVE |
VNLKLRRPSF | | RDDIDLNATF | | DVDTPPARPS | | SSQHGYYEKL | | CLEKSHSPIQ |
DVPKKICKGP | | RKESQLSLGG | | QSCAGEPDEE | | LVGAFPIFVR | | NAILGQKQPK |
RPRSESSCSK | | DVVRTGFDGL | | GGRTKFIQPT | | DTVMIRPLPV | | KPKTKVKQRV |
RVKTVPSLFQ | | AKLDTFLWS |
Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі як убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Lee S.Y., Lee S.Y., Choi Y. (1997). TRAF-interacting protein (TRIP): a novel component of the tumor necrosis factor receptor (TNFR)- and CD30-TRAF signaling complexes that inhibits TRAF2-mediated NF-kappaB activation. J. Exp. Med. 185: 1275—1285. PMID 9104814 DOI:10.1084/jem.185.7.1275
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRAIP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30764 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9BWF2 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |