TRAF1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRAF1, EBI6, MGC:10353, TNF receptor associated factor 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601711 HomoloGene: 4138 GeneCards: TRAF1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • thioesterase binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • identical protein binding • tumor necrosis factor receptor binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • regulation of apoptotic process • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0097285 апоптоз • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • GO:0034622 protein-containing complex assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_005658 NM_001190945 NM_001190947 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001177874 NP_001177876 NP_005649 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 120.9 – 120.93 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRAF1 (англ. TNF receptor associated factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 416 амінокислот, а молекулярна маса — 46 164[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASSSGSSPR | | PAPDENEFPF | | GCPPTVCQDP | | KEPRALCCAG | | CLSENPRNGE |
DQICPKCRGE | | DLQSISPGSR | | LRTQEKAHPE | | VAEAGIGCPF | | AGVGCSFKGS |
PQSVQEHEVT | | SQTSHLNLLL | | GFMKQWKARL | | GCGLESGPMA | | LEQNLSDLQL |
QAAVEVAGDL | | EVDCYRAPCS | | ESQEELALQH | | FMKEKLLAEL | | EGKLRVFENI |
VAVLNKEVEA | | SHLALATSIH | | QSQLDRERIL | | SLEQRVVELQ | | QTLAQKDQAL |
GKLEQSLRLM | | EEASFDGTFL | | WKITNVTRRC | | HESACGRTVS | | LFSPAFYTAK |
YGYKLCLRLY | | LNGDGTGKRT | | HLSLFIVIMR | | GEYDALLPWP | | FRNKVTFMLL |
DQNNREHAID | | AFRPDLSSAS | | FQRPQSETNV | | ASGCPLFFPL | | SKLQSPKHAY |
VKDDTMFLKC | | IVETST |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Rothe M., Wong S.C., Henzel W.J., Goeddel D.V. (1994). A novel family of putative signal transducers associated with the cytoplasmic domain of the 75 kDa tumor necrosis factor receptor. Cell. 78: 681—692. PMID 8069916 DOI:10.1016/0092-8674(94)90532-0
- Lee S.Y., Park C.G., Choi Y. (1996). T cell receptor-dependent cell death of T cell hybridomas mediated by the CD30 cytoplasmic domain in association with tumor necrosis factor receptor-associated factors. J. Exp. Med. 183: 669—674. PMID 8627180 DOI:10.1084/jem.183.2.669
- McCarthy J.V., Ni J., Dixit V.M. (1998). RIP2 is a novel NF-kappaB-activating and cell death-inducing kinase. J. Biol. Chem. 273: 16968—16975. PMID 9642260 DOI:10.1074/jbc.273.27.16968
- Arch R.H., Thompson C.B. (1998). 4-1BB and Ox40 are members of a tumor necrosis factor (TNF)-nerve growth factor receptor subfamily that bind TNF receptor-associated factors and activate nuclear factor kappaB. Mol. Cell. Biol. 18: 558—565. PMID 9418902 DOI:10.1128/MCB.18.1.558
- Irmler M., Steiner V., Ruegg C., Wajant H., Tschopp J. (2000). Caspase-induced inactivation of the anti-apoptotic TRAF1 during Fas ligand-mediated apoptosis. FEBS Lett. 468: 129—133. PMID 10692572 DOI:10.1016/S0014-5793(00)01206-0
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12031 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q13077 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |