TMEFF2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2FMW

Ідентифікатори

Символи

TMEFF2, CT120.2, HPP1, TENB2, TPEF, TR, TR-2, transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2

Зовнішні ІД

OMIM: 605734 MGI: 1861735 HomoloGene: 9417 GeneCards: TMEFF2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• молекулярна функція
Клітинна компонента	• integral component of membrane • extracellular region • мембрана • клітинна мембрана
Біологічний процес	• negative regulation of integrin biosynthetic process • negative regulation of cell migration • negative regulation of stress fiber assembly • wound healing, spreading of cells • animal organ morphogenesis • гістогенез
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23671


56363

Ensembl


ENSG00000144339


ENSMUSG00000026109

UniProt


Q9UIK5


Q9QYM9

RefSeq (мРНК)


NM_001305134 NM_001305145 NM_016192


NM_019790

RefSeq (білок)


NP_001292063 NP_001292074 NP_057276


NP_062764

Локус (UCSC)

Хр. 2: 191.95 – 192.19 Mb

Хр. 1: 50.94 – 51.23 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TMEFF2 (англ. Transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 374 амінокислот, а молекулярна маса — 41 428^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVLWESPRQC	SSWTLCEGFC	WLLLLPVMLL	IVARPVKLAA	FPTSLSDCQT
PTGWNCSGYD	DRENDLFLCD	TNTCKFDGEC	LRIGDTVTCV	CQFKCNNDYV
PVCGSNGESY	QNECYLRQAA	CKQQSEILVV	SEGSCATDAG	SGSGDGVHEG
SGETSQKETS	TCDICQFGAE	CDEDAEDVWC	VCNIDCSQTN	FNPLCASDGK
SYDNACQIKE	ASCQKQEKIE	VMSLGRCQDN	TTTTTKSEDG	HYARTDYAEN
ANKLEESARE	HHIPCPEHYN	GFCMHGKCEH	SINMQEPSCR	CDAGYTGQHC
EKKDYSVLYV	VPGPVRFQYV	LIAAVIGTIQ	IAVICVVVLC	ITRKCPRSNR
IHRQKQNTGH	YSSDNTTRAS	TRLI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

Quayle S.N., Sadar M.D. (2006). A truncated isoform of TMEFF2 encodes a secreted protein in prostate cancer cells. Genomics. 87: 633—637. PMID 16439095 DOI:10.1016/j.ygeno.2005.12.004
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
Siegel D.A., Davies P., Dobrenis K., Huang M. (2006). Tomoregulin-2 is found extensively in plaques in Alzheimer's disease brain. J. Neurochem. 98: 34—44. PMID 16805794 DOI:10.1111/j.1471-4159.2006.03801.x
Ali N., Knaeuper V. (2007). Phorbol ester-induced shedding of the prostate cancer marker transmembrane protein with epidermal growth factor and two follistatin motifs 2 is mediated by the disintegrin and metalloproteinase-17. J. Biol. Chem. 282: 37378—37388. PMID 17942404 DOI:10.1074/jbc.M702170200
Liang G., Robertson K.D., Talmadge C., Sumegi J., Jones P.A. (2000). The gene for a novel transmembrane protein containing epidermal growth factor and follistatin domains is frequently hypermethylated in human tumor cells. Cancer Res. 60: 4907—4912. PMID 10987305

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11867 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9UIK5 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.