THAP2 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

THAP2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2D8R

Ідентифікатори

Символи

THAP2, THAP domain containing 2

Зовнішні ІД

OMIM: 612531 MGI: 1914066 HomoloGene: 12039 GeneCards: THAP2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • DNA binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• ядерце
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


83591


66816

Ensembl


ENSG00000173451


ENSMUSG00000020137

UniProt


Q9H0W7


Q9D305

RefSeq (мРНК)


NM_031435


NM_025780

RefSeq (білок)


NP_113623


NP_080056

Локус (UCSC)

Хр. 12: 71.66 – 71.68 Mb

Хр. 10: 115.2 – 115.22 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

THAP2 (англ. THAP domain containing 2) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 228 амінокислот, а молекулярна маса — 26 260^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPTNCAAAGC	ATTYNKHINI	SFHRFPLDPK	RRKEWVRLVR	RKNFVPGKHT
FLCSKHFEAS	CFDLTGQTRR	LKMDAVPTIF	DFCTHIKSMK	LKSRNLLKKN
NSCSPAGPSN	LKSNISSQQV	LLEHSYAFRN	PMEAKKRIIK	LEKEIASLRR
KMKTCLQKER	RATRRWIKAT	CLVKNLEANS	VLPKGTSEHM	LPTALSSLPL
EDFKILEQDQ	QDKTLLSLNL	KQTKSTFI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20854 (англ.) . Архів оригіналу за 6 травня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H0W7 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.