TAF1D |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TAF1D, JOSD3, RAFI41, TAF(I)41, TAFI41, TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit D |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 612823 MGI: 1922566 HomoloGene: 11472 GeneCards: TAF1D |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • RNA polymerase transcription factor SL1 complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • центр організації мікротрубочок |
---|
Біологічний процес | • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • termination of RNA polymerase I transcription • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_026541 NM_027261 NM_029248 |
|
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 93.73 – 93.78 Mb | Хр. 9: 15.31 – 15.32 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TAF1D (англ. TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 278 амінокислот, а молекулярна маса — 32 058[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDKSGIDSLD | | HVTSDAVELA | | NRSDNSSDSS | | LFKTQCIPYS | | PKGEKRNPIR |
KFVRTPESVH | | ASDSSSDSSF | | EPIPLTIKAI | | FERFKNRKKR | | YKKKKKRRYQ |
PTGRPRGRPE | | GRRNPIYSLI | | DKKKQFRSRG | | SGFPFLESEN | | EKNAPWRKIL |
TFEQAVARGF | | FNYIEKLKYE | | HHLKESLKQM | | NVGEDLENED | | FDSRRYKFLD |
DDGSISPIEE | | STAEDEDATH | | LEDNECDIKL | | AGDSFIVSSE | | FPVRLSVYLE |
EEDITEEAAL | | SKKRATKAKN | | TGQRGLKM |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Wang L., Bhattacharyya N., Chelsea D.M., Escobar P.F., Banerjee S. (2004). A novel nuclear protein, MGC5306 interacts with DNA polymerase beta and has a potential role in cellular phenotype. Cancer Res. 64: 7673—7677. PMID 15520167 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-04-2801
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Friedrich J.K., Panov K.I., Cabart P., Russell J., Zomerdijk J.C.B.M. (2005). TBP-TAF complex SL1 directs RNA polymerase I pre-initiation complex formation and stabilizes upstream binding factor at the rDNA promoter. J. Biol. Chem. 280: 29551—29558. PMID 15970593 DOI:10.1074/jbc.M501595200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28759 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H5J8 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |