SYNJ2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1UFW

Ідентифікатори

Символи

SYNJ2, INPP5H, synaptojanin 2

Зовнішні ІД

OMIM: 609410 MGI: 1201671 HomoloGene: 117703 GeneCards: SYNJ2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphoric ester hydrolase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • RNA binding • nucleic acid binding • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate 5-phosphatase activity • phosphatidylinositol phosphate 4-phosphatase activity • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 5-phosphatase activity • phosphatidylinositol-3-phosphatase activity • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate 3-phosphatase activity • phosphatidylinositol phosphate 5-phosphatase activity • inositol-polyphosphate 5-phosphatase activity • SH3 domain binding • PDZ domain binding • phosphatidylinositol-4-phosphate phosphatase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • membrane raft • аксон • гіалоплазма • клітинна мембрана • cell projection • цитоскелет • мембрана • cytoplasmic microtubule • extrinsic component of mitochondrial outer membrane • ruffle membrane • axon terminus • perinuclear region of cytoplasm • presynapse
Біологічний процес	• phosphatidylinositol biosynthetic process • phosphatidylinositol dephosphorylation • phosphatidylinositol-3-phosphate biosynthetic process • membrane organization • brain development • inositol phosphate dephosphorylation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8871


20975

Ensembl


ENSG00000078269


ENSMUSG00000023805

UniProt


O15056


Q9D2G5

RefSeq (мРНК)


NM_001178088 NM_003898

NM_001113351 NM_001113352 NM_001113353 NM_001290698 NM_011523
NM_001357665 NM_001357667

RefSeq (білок)


NP_001171559 NP_003889

NP_001106822 NP_001106823 NP_001106824 NP_001277627 NP_035653
NP_001344594 NP_001344596

Локус (UCSC)

Хр. 6: 157.98 – 158.1 Mb

Хр. 17: 5.99 – 6.09 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SYNJ2 (англ. Synaptojanin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 496 амінокислот, а молекулярна маса — 165 538^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALSKGLRLL	GRLGAEGDCS	VLLEARGRDD	CLLFEAGTVA	TLAPEEKEVI
KGQYGKLTDA	YGCLGELRLK	SGGTSLSFLV	LVTGCTSVGR	IPDAEIYKIT
ATDFYPLQEE	AKEEERLIAL	KKILSSGVFY	FSWPNDGSRF	DLTVRTQKQG
DDSSEWGNSF	FWNQLLHVPL	RQHQVSCCDW	LLKIICGVVT	IRTVYASHKQ
AKACLVSRVS	CERTGTRFHT	RGVNDDGHVS	NFVETEQMIY	MDDGVSSFVQ
IRGSVPLFWE	QPGLQVGSHH	LRLHRGLEAN	APAFDRHMVL	LKEQYGQQVV
VNLLGSRGGE	EVLNRAFKKL	LWASCHAGDT	PMINFDFHQF	AKGGKLEKLE
TLLRPQLKLH	WEDFDVFTKG	ENVSPRFQKG	TLRMNCLDCL	DRTNTVQSFI
ALEVLHLQLK	TLGLSSKPIV	DRFVESFKAM	WSLNGHSLSK	VFTGSRALEG
KAKVGKLKDG	ARSMSRTIQS	NFFDGVKQEA	IKLLLVGDVY	GEEVADKGGM
LLDSTALLVT	PRILKAMTER	QSEFTNFKRI	RIAMGTWNVN	GGKQFRSNVL
RTAELTDWLL	DSPQLSGATD	SQDDSSPADI	FAVGFEEMVE	LSAGNIVNAS
TTNKKMWGEQ	LQKAISRSHR	YILLTSAQLV	GVCLYIFVRP	YHVPFIRDVA
IDTVKTGMGG	KAGNKGAVGI	RFQFHSTSFC	FICSHLTAGQ	SQVKERNEDY
KEITQKLCFP	MGRNVFSHDY	VFWCGDFNYR	IDLTYEEVFY	FVKRQDWKKL
LEFDQLQLQK	SSGKIFKDFH	EGAINFGPTY	KYDVGSAAYD	TSDKCRTPAW
TDRVLWWRKK	HPFDKTAGEL	NLLDSDLDVD	TKVRHTWSPG	ALQYYGRAEL
QASDHRPVLA	IVEVEVQEVD	VGARERVFQE	VSSFQGPLDA	TVVVNLQSPT
LEEKNEFPED	LRTELMQTLG	SYGTIVLVRI	NQGQMLVTFA	DSHSALSVLD
VDGMKVKGRA	VKIRPKTKDW	LKGLREEIIR	KRDSMAPVSP	TANSCLLEEN
FDFTSLDYES	EGDILEDDED	YLVDEFNQPG	VSDSELGGDD	LSDVPGPTAL
APPSKSPALT	KKKQHPTYKD	DADLVELKRE	LEAVGEFRHR	SPSRSLSVPN
RPRPPQPPQR	PPPPTGLMVK	KSASDASISS	GTHGQYSILQ	TARLLPGAPQ
QPPKARTGIS	KPYNVKQIKT	TNAQEAEAAI	RCLLEARGGA	SEEALSAVAP
RDLEASSEPE	PTPGAAKPET	PQAPPLLPRR	PPPRVPAIKK	PTLRRTGKPL
SPEEQFEQQT	VHFTIGPPET	SVEAPPVVTA	PRVPPVPKPR	TFQPGKAAER
PSHRKPASDE	APPGAGASVP	PPLEAPPLVP	KVPPRRKKSA	PAAFHLQVLQ
SNSQLLQGLT	YNSSDSPSGH	PPAAGTVFPQ	GDFLSTSSAT	SPDSDGTKAM
KPEAAPLLGD	YQDPFWNLLH	HPKLLNNTWL	SKSSDPLDSG	TRSPKRDPID
PVSAGASAAK	AELPPDHEHK	TLGHWVTISD	QEKRTALQVF	DPLAKT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11504 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O15056 (англ.) . Архів оригіналу за 13 квітня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.