SVIL |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2K6M, 2K6N | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SVIL, supervillin, MFM10 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604126 MGI: 2147319 HomoloGene: 25090 GeneCards: SVIL |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • actin filament binding • actin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • microtubule minus-end • podosome • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • cell projection • midbody • Борозна розщеплення • costamere • цитоскелет • мембрана • клітинне ядро • focal adhesion • actin cytoskeleton • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of cytokinesis • skeletal muscle tissue development • cytoskeleton organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_003174 NM_021738 NM_001323599 NM_001323600 |
| | NM_153153 NM_178046 NM_001347449 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001310528 NP_001310529 NP_003165 NP_068506 |
| NP_001334378 NP_694793 NP_001392206 NP_001392207 NP_001392209
| NP_001392210 NP_001392211 NP_001392219 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 29.46 – 29.74 Mb | Хр. 18: 4.92 – 5.12 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SVIL (англ. Supervillin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 214 амінокислот, а молекулярна маса — 247 746[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKRKERIARR | | LEGIENDTQP | | ILLQSCTGLV | | THRLLEEDTP | | RYMRASDPAS |
PHIGRSNEEE | | ETSDSSLEKQ | | TRSKYCTETS | | GVHGDSPYGS | | GTMDTHSLES |
KAERIARYKA | | ERRRQLAEKY | | GLTLDPEADS | | EYLSRYTKSR | | KEPDAVEKRG |
GKSDKQEESS | | RDASSLYPGT | | ETMGLRTCAG | | ESKDYALHVG | | DGSSDPEVLL |
NIENQRRGQE | | LSATRQAHDL | | SPAAESSSTF | | SFSGRDSSFT | | EVPRSPKHAH |
SSSLQQAASR | | SPSFGDPQLS | | PEARPSTGKP | | KHEWFLQKDS | | EGDTPSLINW |
PSRVKVREKL | | VKEESARNSP | | ELASESVTQR | | RHQPAPVHYV | | SFQSEHSAFD |
RVPSKAAGST | | RQPIRGYVQP | | ADTGHTAKLV | | TPETPENASE | | CSWVASATQN |
VPKPPSLTVL | | EGDGRDSPVL | | HVCESKAEEE | | EGEGEGEEKE | | EDVCFTEALE |
QSKKTLLALE | | GDGLVRSPED | | PSRNEDFGKP | | AVSTVTLEHQ | | KELENVAQPP |
QAPHQPTERT | | GRSEMVLYIQ | | SEPVSQDAKP | | TGHNREASKK | | RKVRTRSLSD |
FTGPPQLQAL | | KYKDPASRRE | | LELPSSKTEG | | PYGEISMLDT | | KVSVAQLRSA |
FLASANACRR | | PELKSRVERS | | AEGPGLPTGV | | ERERGSRKPR | | RYFSPGESRK |
TSERFRTQPI | | TSAERKESDR | | CTSHSETPTV | | DDEEKVDERA | | KLSVAAKRLL |
FREMEKSFDE | | QNVPKRRSRN | | TAVEQRLRRL | | QDRSLTQPIT | | TEEVVIAATE |
PIPASCSGGT | | HPVMARLPSP | | TVARSAVQPA | | RLQASAHQKA | | LAKDQTNEGK |
ELAEQGEPDS | | STLSLAEKLA | | LFNKLSQPVS | | KAISTRNRID | | TRQRRMNARY |
QTQPVTLGEV | | EQVQSGKLIP | | FSPAVNTSVS | | TVASTVAPMY | | AGDLRTKPPL |
DHNASATDYK | | FSSSIENSDS | | PVRSILKSQA | | WQPLVEGSEN | | KGMLREYGET |
ESKRALTGRD | | SGMEKYGSFE | | EAEASYPILN | | RAREGDSHKE | | SKYAVPRRGS |
LERANPPITH | | LGDEPKEFSM | | AKMNAQGNLD | | LRDRLPFEEK | | VEVENVMKRK |
FSLRAAEFGE | | PTSEQTGTAA | | GKTIAQTTAP | | VSWKPQDSSE | | QPQEKLCKNP |
CAMFAAGEIK | | TPTGEGLLDS | | PSKTMSIKER | | LALLKKSGEE | | DWRNRLSRRQ |
EGGKAPASSL | | HTQEAGRSLI | | KKRVTESRES | | QMTIEERKQL | | ITVREEAWKT |
RGRGAANDST | | QFTVAGRMVK | | KGLASPTAIT | | PVASPICGKT | | RGTTPVSKPL |
EDIEARPDMQ | | LESDLKLDRL | | ETFLRRLNNK | | VGGMHETVLT | | VTGKSVKEVM |
KPDDDETFAK | | FYRSVDYNMP | | RSPVEMDEDF | | DVIFDPYAPK | | LTSSVAEHKR |
AVRPKRRVQA | | SKNPLKMLAA | | REDLLQEYTE | | QRLNVAFMES | | KRMKVEKMSS |
NSNFSEVTLA | | GLASKENFSN | | VSLRSVNLTE | | QNSNNSAVPY | | KRLMLLQIKG |
RRHVQTRLVE | | PRASALNSGD | | CFLLLSPHCC | | FLWVGEFANV | | IEKAKASELA |
TLIQTKRELG | | CRATYIQTIE | | EGINTHTHAA | | KDFWKLLGGQ | | TSYQSAGDPK |
EDELYEAAII | | ETNCIYRLMD | | DKLVPDDDYW | | GKIPKCSLLQ | | PKEVLVFDFG |
SEVYVWHGKE | | VTLAQRKIAF | | QLAKHLWNGT | | FDYENCDINP | | LDPGECNPLI |
PRKGQGRPDW | | AIFGRLTEHN | | ETILFKEKFL | | DWTELKRSNE | | KNPGELAQHK |
EDPRTDVKAY | | DVTRMVSMPQ | | TTAGTILDGV | | NVGRGYGLVE | | GHDRRQFEIT |
SVSVDVWHIL | | EFDYSRLPKQ | | SIGQFHEGDA | | YVVKWKFMVS | | TAVGSRQKGE |
HSVRAAGKEK | | CVYFFWQGRH | | STVSEKGTSA | | LMTVELDEER | | GAQVQVLQGK |
EPPCFLQCFQ | | GGMVVHSGRR | | EEEEENVQSE | | WRLYCVRGEV | | PVEGNLLEVA |
CHCSSLRSRT | | SMVVLNVNKA | | LIYLWHGCKA | | QAHTKEVGRT | | AANKIKEQCP |
LEAGLHSSSK | | VTIHECDEGS | | EPLGFWDALG | | RRDRKAYDCM | | LQDPGSFNFA |
PRLFILSSSS | | GDFAATEFVY | | PARAPSVVSS | | MPFLQEDLYS | | APQPALFLVD |
NHHEVYLWQG | | WWPIENKITG | | SARIRWASDR | | KSAMETVLQY | | CKGKNLKKPA |
PKSYLIHAGL | | EPLTFTNMFP | | SWEHREDIAE | | ITEMDTEVSN | | QITLVEDVLA |
KLCKTIYPLA | | DLLARPLPEG | | VDPLKLEIYL | | TDEDFEFALD | | MTRDEYNALP |
AWKQVNLKKA | | KGLF |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках.
Література
- Fang Z., Luna E.J. (2013). Supervillin-mediated suppression of p53 protein enhances cell survival. J. Biol. Chem. 288: 7918—7929. PMID 23382381 DOI:10.1074/jbc.M112.416842
- Crowley J.L., Smith T.C., Fang Z., Takizawa N., Luna E.J. (2009). Supervillin reorganizes the actin cytoskeleton and increases invadopodial efficiency. Mol. Biol. Cell. 20: 948—962. PMID 19109420 DOI:10.1091/mbc.E08-08-0867
- Brown J.W., Vardar-Ulu D., McKnight C.J. (2009). How to arm a supervillin: designing F-actin binding activity into supervillin headpiece. J. Mol. Biol. 393: 608—618. PMID 19683541 DOI:10.1016/j.jmb.2009.08.018
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11480 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O95425 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |