STIM1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2K60, 3TEQ, 2MAJ, 2MAK, 4O9B

Ідентифікатори

Символи

STIM1, D11S4896E, GOK, IMD10, STRMK, TAM, TAM1, stromal interaction molecule 1

Зовнішні ІД

OMIM: 605921 MGI: 107476 HomoloGene: 20681 GeneCards: STIM1

Пов'язані генетичні захворювання

Stormorken syndrome, tubular aggregate myopathy, combined immunodeficiency due to STIM1 deficiency^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • calcium channel regulator activity • microtubule plus-end binding • зв'язування з іоном металу • protease binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • integral component of plasma membrane • cortical endoplasmic reticulum • sarcoplasmic reticulum • integral component of endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • sarcoplasmic reticulum membrane • мікротрубочка • цитоскелет • клітинна мембрана
Біологічний процес	• regulation of cardiac conduction • regulation of calcium ion transport • ion transport • detection of calcium ion • enamel mineralization • activation of store-operated calcium channel activity • calcium ion transport • cellular calcium ion homeostasis • regulation of store-operated calcium entry • store-operated calcium entry • positive regulation of angiogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6786


20866

Ensembl


ENSG00000167323


ENSMUSG00000030987

UniProt


Q13586


P70302

RefSeq (мРНК)


NM_003156 NM_001277961 NM_001277962


NM_009287 NM_001374058 NM_001374060 NM_001400557

RefSeq (білок)

NP_001264890 NP_001264891 NP_003147 NP_001369495 NP_001369496
NP_001369497 NP_001369498 NP_001369499 NP_001369500 NP_001369501 NP_001369502 NP_001369503 NP_001369504 NP_001369505 NP_001369506 NP_001369507 NP_001369508 NP_001369509 NP_001369510


NP_033313 NP_001360987 NP_001360989 NP_001387486

Локус (UCSC)

Хр. 11: 3.85 – 4.09 Mb

Хр. 7: 101.92 – 102.09 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

STIM1 (англ. Stromal interaction molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 685 амінокислот, а молекулярна маса — 77 423^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDVCVRLALW	LLWGLLLHQG	QSLSHSHSEK	ATGTSSGANS	EESTAAEFCR
IDKPLCHSED	EKLSFEAVRN	IHKLMDDDAN	GDVDVEESDE	FLREDLNYHD
PTVKHSTFHG	EDKLISVEDL	WKAWKSSEVY	NWTVDEVVQW	LITYVELPQY
EETFRKLQLS	GHAMPRLAVT	NTTMTGTVLK	MTDRSHRQKL	QLKALDTVLF
GPPLLTRHNH	LKDFMLVVSI	VIGVGGCWFA	YIQNRYSKEH	MKKMMKDLEG
LHRAEQSLHD	LQERLHKAQE	EHRTVEVEKV	HLEKKLRDEI	NLAKQEAQRL
KELREGTENE	RSRQKYAEEE	LEQVREALRK	AEKELESHSS	WYAPEALQKW
LQLTHEVEVQ	YYNIKKQNAE	KQLLVAKEGA	EKIKKKRNTL	FGTFHVAHSS
SLDDVDHKIL	TAKQALSEVT	AALRERLHRW	QQIEILCGFQ	IVNNPGIHSL
VAALNIDPSW	MGSTRPNPAH	FIMTDDVDDM	DEEIVSPLSM	QSPSLQSSVR
QRLTEPQHGL	GSQRDLTHSD	SESSLHMSDR	QRVAPKPPQM	SRAADEALNA
MTSNGSHRLI	EGVHPGSLVE	KLPDSPALAK	KALLALNHGL	DKAHSLMELS
PSAPPGGSPH	LDSSRSHSPS	SPDPDTPSPV	GDSRALQASR	NTRIPHLAGK
KAVAEEDNGS	IGEETDSSPG	RKKFPLKIFK	KPLKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, саркоплазматичному ретикулумі.

Література

Parker N.J., Begley C.G., Smith P.J., Fox R.M. (1996). Molecular cloning of a novel human gene (D11S4896E) at chromosomal region 11p15.5. Genomics. 37: 253—256. PMID 8921403 DOI:10.1006/geno.1996.0553
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827
Lewandrowski U., Moebius J., Walter U., Sickmann A. (2006). Elucidation of N-glycosylation sites on human platelet proteins: a glycoproteomic approach. Mol. Cell. Proteomics. 5: 226—233. PMID 16263699 DOI:10.1074/mcp.M500324-MCP200
Krapivinsky G., Krapivinsky L., Stotz S.C., Manasian Y., Clapham D.E. (2011). POST, partner of stromal interaction molecule 1 (STIM1), targets STIM1 to multiple transporters. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 19234—19239. PMID 22084111 DOI:10.1073/pnas.1117231108

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з STIM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11386 (англ.) . Архів оригіналу за 23 травня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
↑ UniProt, Q13586 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.