STIM1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2K60, 3TEQ, 2MAJ, 2MAK, 4O9B | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | STIM1, D11S4896E, GOK, IMD10, STRMK, TAM, TAM1, stromal interaction molecule 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605921 MGI: 107476 HomoloGene: 20681 GeneCards: STIM1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Stormorken syndrome, tubular aggregate myopathy, combined immunodeficiency due to STIM1 deficiency[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • calcium channel regulator activity • microtubule plus-end binding • зв'язування з іоном металу • protease binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • integral component of plasma membrane • cortical endoplasmic reticulum • sarcoplasmic reticulum • integral component of endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • sarcoplasmic reticulum membrane • мікротрубочка • цитоскелет • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • regulation of cardiac conduction • regulation of calcium ion transport • ion transport • detection of calcium ion • enamel mineralization • activation of store-operated calcium channel activity • calcium ion transport • cellular calcium ion homeostasis • regulation of store-operated calcium entry • store-operated calcium entry • positive regulation of angiogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/fe/PBB_GE_STIM1_202764_at_fs.png/250px-PBB_GE_STIM1_202764_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_003156 NM_001277961 NM_001277962 |
| | NM_009287 NM_001374058 NM_001374060 NM_001400557 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001264890 NP_001264891 NP_003147 NP_001369495 NP_001369496
| NP_001369497 NP_001369498 NP_001369499 NP_001369500 NP_001369501 NP_001369502 NP_001369503 NP_001369504 NP_001369505 NP_001369506 NP_001369507 NP_001369508 NP_001369509 NP_001369510 |
| | NP_033313 NP_001360987 NP_001360989 NP_001387486 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 3.85 – 4.09 Mb | Хр. 7: 101.92 – 102.09 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
STIM1 (англ. Stromal interaction molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 685 амінокислот, а молекулярна маса — 77 423[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDVCVRLALW | | LLWGLLLHQG | | QSLSHSHSEK | | ATGTSSGANS | | EESTAAEFCR |
IDKPLCHSED | | EKLSFEAVRN | | IHKLMDDDAN | | GDVDVEESDE | | FLREDLNYHD |
PTVKHSTFHG | | EDKLISVEDL | | WKAWKSSEVY | | NWTVDEVVQW | | LITYVELPQY |
EETFRKLQLS | | GHAMPRLAVT | | NTTMTGTVLK | | MTDRSHRQKL | | QLKALDTVLF |
GPPLLTRHNH | | LKDFMLVVSI | | VIGVGGCWFA | | YIQNRYSKEH | | MKKMMKDLEG |
LHRAEQSLHD | | LQERLHKAQE | | EHRTVEVEKV | | HLEKKLRDEI | | NLAKQEAQRL |
KELREGTENE | | RSRQKYAEEE | | LEQVREALRK | | AEKELESHSS | | WYAPEALQKW |
LQLTHEVEVQ | | YYNIKKQNAE | | KQLLVAKEGA | | EKIKKKRNTL | | FGTFHVAHSS |
SLDDVDHKIL | | TAKQALSEVT | | AALRERLHRW | | QQIEILCGFQ | | IVNNPGIHSL |
VAALNIDPSW | | MGSTRPNPAH | | FIMTDDVDDM | | DEEIVSPLSM | | QSPSLQSSVR |
QRLTEPQHGL | | GSQRDLTHSD | | SESSLHMSDR | | QRVAPKPPQM | | SRAADEALNA |
MTSNGSHRLI | | EGVHPGSLVE | | KLPDSPALAK | | KALLALNHGL | | DKAHSLMELS |
PSAPPGGSPH | | LDSSRSHSPS | | SPDPDTPSPV | | GDSRALQASR | | NTRIPHLAGK |
KAVAEEDNGS | | IGEETDSSPG | | RKKFPLKIFK | | KPLKK |
Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, саркоплазматичному ретикулумі.
Література
- Parker N.J., Begley C.G., Smith P.J., Fox R.M. (1996). Molecular cloning of a novel human gene (D11S4896E) at chromosomal region 11p15.5. Genomics. 37: 253—256. PMID 8921403 DOI:10.1006/geno.1996.0553
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
- Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827
- Lewandrowski U., Moebius J., Walter U., Sickmann A. (2006). Elucidation of N-glycosylation sites on human platelet proteins: a glycoproteomic approach. Mol. Cell. Proteomics. 5: 226—233. PMID 16263699 DOI:10.1074/mcp.M500324-MCP200
- Krapivinsky G., Krapivinsky L., Stotz S.C., Manasian Y., Clapham D.E. (2011). POST, partner of stromal interaction molecule 1 (STIM1), targets STIM1 to multiple transporters. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 19234—19239. PMID 22084111 DOI:10.1073/pnas.1117231108
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з STIM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11386 (англ.) . Архів оригіналу за 23 травня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q13586 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |