SRGAP2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4RTT, 4RUG, 2DL8

Ідентифікатори

Символи

SRGAP2, ARHGAP34, FNBP2, SRGAP2A, SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 2

Зовнішні ІД

OMIM: 606524 MGI: 109605 HomoloGene: 52683 GeneCards: SRGAP2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • identical protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • postsynaptic membrane • cell projection • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • dendritic spine • синапс • міжклітинні контакти • dendritic spine head • phagocytic vesicle • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинне ядро • lamellipodium • клітинна мембрана • нуклеоплазма
Біологічний процес	• lamellipodium assembly involved in ameboidal cell migration • negative regulation of neuron migration • neuron projection morphogenesis • actin filament severing • filopodium assembly • negative regulation of cell death • нейробіологія розвитку • dendritic spine development • substrate adhesion-dependent cell spreading • extension of a leading process involved in cell motility in cerebral cortex radial glia guided migration • проліферація • regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • negative regulation of cell migration
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23380


14270

Ensembl


ENSG00000266028


ENSMUSG00000026425

UniProt


O75044


Q91Z67

RefSeq (мРНК)

NM_001042758 NM_001170637 NM_001300952 NM_015326 NM_001377444
NM_001377445 NM_001377446 NM_001377447


NM_001081011 NM_019520

RefSeq (білок)

NP_001164108 NP_001287881 NP_056141 NP_001364373 NP_001364374
NP_001364375 NP_001364376


NP_001074480

Локус (UCSC)

Хр. 1: 206.2 – 206.46 Mb

Хр. 1: 131.21 – 131.46 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SRGAP2 (англ. SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 071 амінокислот, а молекулярна маса — 120 881^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTSPAKFKKD	KEIIAEYDTQ	VKEIRAQLTE	QMKCLDQQCE	LRVQLLQDLQ
DFFRKKAEIE	MDYSRNLEKL	AERFLAKTRS	TKDQQFKKDQ	NVLSPVNCWN
LLLNQVKRES	RDHTTLSDIY	LNNIIPRFVQ	VSEDSGRLFK	KSKEVGQQLQ
DDLMKVLNEL	YSVMKTYHMY	NADSISAQSK	LKEAEKQEEK	QIGKSVKQED
RQTPRSPDST	ANVRIEEKHV	RRSSVKKIEK	MKEKRQAKYT	ENKLKAIKAR
NEYLLALEAT	NASVFKYYIH	DLSDLIDQCC	DLGYHASLNR	ALRTFLSAEL
NLEQSKHEGL	DAIENAVENL	DATSDKQRLM	EMYNNVFCPP	MKFEFQPHMG
DMASQLCAQQ	PVQSELVQRC	QQLQSRLSTL	KIENEEVKKT	MEATLQTIQD
IVTVEDFDVS	DCFQYSNSME	SVKSTVSETF	MSKPSIAKRR	ANQQETEQFY
FTKMKEYLEG	RNLITKLQAK	HDLLQKTLGE	SQRTDCSLAR	RSSTVRKQDS
SQAIPLVVES	CIRFISRHGL	QHEGIFRVSG	SQVEVNDIKN	AFERGEDPLA
GDQNDHDMDS	IAGVLKLYFR	GLEHPLFPKD	IFHDLMACVT	MDNLQERALH
IRKVLLVLPK	TTLIIMRYLF	AFLNHLSQFS	EENMMDPYNL	AICFGPSLMS
VPEGHDQVSC	QAHVNELIKT	IIIQHENIFP	SPRELEGPVY	SRGGSMEDYC
DSPHGETTPV	EDSTQDVTAE	HHTSDDECEP	IEAIAKFDYV	GRTARELSFK
KGASLLLYQR	ASDDWWEGRH	NGIDGLIPHQ	YIVVQDTEDG	VVERSSPKSE
IEVISEPPEE	KVTARAGASC	PSGGHVADIY	LANINKQRKR	PESGSIRKTF
RSDSHGLSSS	LTDSSSPGVG	ASCRPSSQPI	MSQSLPKEGP	DKCSISGHGS
LNSISRHSSL	KNRLDSPQIR	KTATAGRSKS	FNNHRPMDPE	VIAQDIEATM
NSALNELREL	ERQSSVKHTP	DVVLDTLEPL	KTSPVVAPTS	EPSSPLHTQL
LKDPEPAFQR	SASTAGDIAC	AFRPVKSVKM	AAPVKPPATR	PKPTVFPKTN
ATSPGVNSST	SPQSTDKSCT	V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як нейрогенез, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

Voss M., Lettau M., Janssen O. (2009). Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening. BMC Immunol. 10: 53—53. PMID 19807924 DOI:10.1186/1471-2172-10-53
Guo S., Bao S. (2010). srGAP2 arginine methylation regulates cell migration and cell spreading through promoting dimerization. J. Biol. Chem. 285: 35133—35141. PMID 20810653 DOI:10.1074/jbc.M110.153429
Mason F.M., Heimsath E.G., Higgs H.N., Soderling S.H. (2011). Bi-modal regulation of a formin by srGAP2. J. Biol. Chem. 286: 6577—6586. PMID 21148482 DOI:10.1074/jbc.M110.190397
Coutinho-Budd J., Ghukasyan V., Zylka M.J., Polleux F. (2012). The F-BAR domains from srGAP1, srGAP2, and srGAP3 differentially regulate membrane deformation. J. Cell Sci. 125: 3390—3401. PMID 22467852 DOI:10.1242/jcs.098962

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19751 (англ.) . Архів оригіналу за 31 травня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, O75044 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.