SREK1

Ідентифікатори

Символи

SREK1, SFRS12, SRrp508, SRrp86, splicing regulatory glutamic acid/lysine-rich protein 1, splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 609268 MGI: 2145245 HomoloGene: 10581 GeneCards: SREK1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding
Клітинна компонента	• spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear speck
Біологічний процес	• mRNA processing • Сплайсинг РНК • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


140890


218543

Ensembl


ENSG00000153914


ENSMUSG00000032621

UniProt


Q8WXA9


Q8BZX4

RefSeq (мРНК)

NM_001077199 NM_001270492 NM_001270493 NM_139168 NM_001323527
NM_001323529 NM_001323533 NM_001323534 NM_001323535


NM_172592 NM_001361085

RefSeq (білок)

NP_001070667 NP_001257421 NP_001310456 NP_001310458 NP_001310462
NP_001310463 NP_001310464 NP_631907


NP_766180 NP_001348014

Локус (UCSC)

Хр. 5: 66.14 – 66.18 Mb

Хр. 13: 103.88 – 103.91 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SREK1 (англ. Splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 508 амінокислот, а молекулярна маса — 59 380^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTSLMPGAGL	LPIPTPNPLT	TLGVSLSSLG	AIPAAALDPN	IATLGEIPQP
PLMGNVDPSK	IDEIRRTVYV	GNLNSQTTTA	DQLLEFFKQV	GEVKFVRMAG
DETQPTRFAF	VEFADQNSVP	RALAFNGVMF	GDRPLKINHS	NNAIVKPPEM
TPQAAAKELE	EVMKRVREAQ	SFISAAIEPE	SGKSNERKGG	RSRSHTRSKS
RSSSKSHSRR	KRSQSKHRSR	SHNRSRSRQK	DRRRSKSPHK	KRSKSRERRK
SRSRSHSRDK	RKDTREKIKE	KERVKEKDRE	KEREREKERE	KEKERGKNKD
RDKEREKDRE	KDKEKDRERE	REKEHEKDRD	KEKEKEQDKE	KEREKDRSKE
IDEKRKKDKK	SRTPPRSYNA	SRRSRSSSRE	RRRRRSRSSS	RSPRTSKTIK
RKSSRSPSPR	SRNKKDKKRE	KERDHISERR	ERERSTSMRK	SSNDRDGKEK
LEKNSTSLKE	KEHNKEPDSS	VSKEVDDKDA	PRTEENKIQH	NGNCQLNEEN
LSTKTEAV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Rappsilber J., Ryder U., Lamond A.I., Mann M. (2002). Large-scale proteomic analysis of the human spliceosome. Genome Res. 12: 1231—1245. PMID 12176931 DOI:10.1101/gr.473902
Zhang D.L., Sun X.J., Ling L.J., Chen R.S., Ma D.L. (2002). Molecular cloning, characterization, chromosomal assignment, genomic organization and verification of SFRS12(SRrp508), a novel member of human SR protein superfamily and a human homolog of rat SRrp86. Yi Chuan Xue Bao. 29: 377—383. PMID 12043562

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17882 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8WXA9 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.