SPOCK1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SPOCK1, SPOCK, TESTICAN, TIC1, sparc/osteonectin, cwcv and kazal-like domains proteoglycan (testican) 1, SPARC/osteonectin, cwcv and kazal like domains proteoglycan 1, SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602264 MGI: 105371 HomoloGene: 80193 GeneCards: SPOCK1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • cysteine-type endopeptidase inhibitor activity • metalloendopeptidase inhibitor activity • serine-type endopeptidase inhibitor activity • collagen binding • extracellular matrix binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • neuromuscular junction • node of Ranvier • extracellular region • Саркоплазма • міжклітинний простір |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of cell-substrate adhesion • Нейрогенез • negative regulation of neuron projection development • neuron migration • нейробіологія розвитку • адгезія клітин • regulation of cell growth • central nervous system neuron differentiation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of endopeptidase activity |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001166463 NM_001166464 NM_001166465 NM_001166466 NM_009262 |
|
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 136.98 – 137.6 Mb | Хр. 13: 57.57 – 58.06 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SPOCK1 (англ. SPARC/osteonectin, cwcv and kazal like domains proteoglycan 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 439 амінокислот, а молекулярна маса — 49 124[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPAIAVLAAA | | AAAWCFLQVE | | SRHLDALAGG | | AGPNHGNFLD | | NDQWLSTVSQ |
YDRDKYWNRF | | RDDDYFRNWN | | PNKPFDQALD | | PSKDPCLKVK | | CSPHKVCVTQ |
DYQTALCVSR | | KHLLPRQKKG | | NVAQKHWVGP | | SNLVKCKPCP | | VAQSAMVCGS |
DGHSYTSKCK | | LEFHACSTGK | | SLATLCDGPC | | PCLPEPEPPK | | HKAERSACTD |
KELRNLASRL | | KDWFGALHED | | ANRVIKPTSS | | NTAQGRFDTS | | ILPICKDSLG |
WMFNKLDMNY | | DLLLDPSEIN | | AIYLDKYEPC | | IKPLFNSCDS | | FKDGKLSNNE |
WCYCFQKPGG | | LPCQNEMNRI | | QKLSKGKSLL | | GAFIPRCNEE | | GYYKATQCHG |
STGQCWCVDK | | YGNELAGSRK | | QGAVSCEEEQ | | ETSGDFGSGG | | SVVLLDDLEY |
ERELGPKDKE | | GKLRVHTRAV | | TEDDEDEDDD | | KEDEVGYIW |
Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- Alliel P.M., Perin J.-P., Jolles P., Bonnet F.J. (1993). Testican, a multidomain testicular proteoglycan resembling modulators of cell social behaviour. Eur. J. Biochem. 214: 347—350. PMID 8389704 DOI:10.1111/j.1432-1033.1993.tb17930.x
- Marr H.S., Basalamah M.A., Edgell C.J. (1997). Endothelial cell expression of testican mRNA. Endothelium. 5: 209—219. PMID 9272383 DOI:10.3109/10623329709053399
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bonnet F., Perin J.-P., Maillet P., Jolles P., Alliel P.M. (1992). Characterization of a human seminal plasma glycosaminoglycan-bearing polypeptide. Biochem. J. 288: 565—569. PMID 1463459 DOI:10.1042/bj2880565
- Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11251 (англ.) . Архів оригіналу за 19 березня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q08629 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |