SPINK5 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1H0Z, 1HDL, 1UUC, 1UVF, 1UVG | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SPINK5, LEKTI, LETKI, NETS, NS, VAKTI, serine peptidase inhibitor, Kazal type 5, serine peptidase inhibitor Kazal type 5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605010 MGI: 1919682 HomoloGene: 4987 GeneCards: SPINK5 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Netherton syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • peptidase inhibitor activity • serine-type endopeptidase inhibitor activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • endoplasmic reticulum membrane • cell cortex • ендоплазматичний ретикулум • perinuclear region of cytoplasm • epidermal lamellar body • extracellular region • внутрішньоклітинна мембранна органела |
---|
Біологічний процес | • epidermal cell differentiation • negative regulation of proteolysis • negative regulation of serine-type peptidase activity • negative regulation of peptidase activity • epithelial cell differentiation • hair cell differentiation • extracellular matrix organization • negative regulation of antibacterial peptide production • negative regulation of immune response • regulation of cell adhesion • negative regulation of angiogenesis • negative regulation of serine-type endopeptidase activity • regulation of T cell differentiation • cornification • regulation of timing of anagen |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001127698 NM_001127699 NM_006846 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001121170 NP_001121171 NP_006837 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 148.03 – 148.14 Mb | Хр. 18: 44.1 – 44.16 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SPINK5 (англ. Serine peptidase inhibitor, Kazal type 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 064 амінокислот, а молекулярна маса — 120 714[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKIATVSVLL | | PLALCLIQDA | | ASKNEDQEMC | | HEFQAFMKNG | | KLFCPQDKKF |
FQSLDGIMFI | | NKCATCKMIL | | EKEAKSQKRA | | RHLARAPKAT | | APTELNCDDF |
KKGERDGDFI | | CPDYYEAVCG | | TDGKTYDNRC | | ALCAENAKTG | | SQIGVKSEGE |
CKSSNPEQDV | | CSAFRPFVRD | | GRLGCTREND | | PVLGPDGKTH | | GNKCAMCAEL |
FLKEAENAKR | | EGETRIRRNA | | EKDFCKEYEK | | QVRNGRLFCT | | RESDPVRGPD |
GRMHGNKCAL | | CAEIFKQRFS | | EENSKTDQNL | | GKAEEKTKVK | | REIVKLCSQY |
QNQAKNGILF | | CTRENDPIRG | | PDGKMHGNLC | | SMCQAYFQAE | | NEEKKKAEAR |
ARNKRESGKA | | TSYAELCSEY | | RKLVRNGKLA | | CTRENDPIQG | | PDGKVHGNTC |
SMCEVFFQAE | | EEEKKKKEGK | | SRNKRQSKST | | ASFEELCSEY | | RKSRKNGRLF |
CTRENDPIQG | | PDGKMHGNTC | | SMCEAFFQQE | | ERARAKAKRE | | AAKEICSEFR |
DQVRNGTLIC | | TREHNPVRGP | | DGKMHGNKCA | | MCASVFKLEE | | EEKKNDKEEK |
GKVEAEKVKR | | EAVQELCSEY | | RHYVRNGRLP | | CTRENDPIEG | | LDGKIHGNTC |
SMCEAFFQQE | | AKEKERAEPR | | AKVKREAEKE | | TCDEFRRLLQ | | NGKLFCTREN |
DPVRGPDGKT | | HGNKCAMCKA | | VFQKENEERK | | RKEEEDQRNA | | AGHGSSGGGG |
GNTQDECAEY | | REQMKNGRLS | | CTRESDPVRD | | ADGKSYNNQC | | TMCKAKLERE |
AERKNEYSRS | | RSNGTGSESG | | KDTCDEFRSQ | | MKNGKLICTR | | ESDPVRGPDG |
KTHGNKCTMC | | KEKLEREAAE | | KKKKEDEDRS | | NTGERSNTGE | | RSNDKEDLCR |
EFRSMQRNGK | | LICTRENNPV | | RGPYGKMHIN | | KCAMCQSIFD | | REANERKKKD |
EEKSSSKPSN | | NAKDECSEFR | | NYIRNNELIC | | PRENDPVHGA | | DGKFYTNKCY |
MCRAVFLTEA | | LERAKLQEKP | | SHVRASQEED | | SPDSFSSLDS | | EMCKDYRVLP |
RIGYLCPKDL | | KPVCGDDGQT | | YNNPCMLCHE | | NLIRQTNTHI | | RSTGKCEESS |
TPGTTAASMP | | PSDE |
Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Секретований назовні.
Література
- Ahmed A., Kandola P., Ziada G., Parenteau N. (2001). Purification and partial amino acid sequence of proteins from human epidermal keratinocyte conditioned medium. J. Protein Chem. 20: 273—278. PMID 11594460 DOI:10.1023/A:1010902815953
- Lauber T., Schulz A., Schweimer K., Adermann K., Marx U.C. (2003). Homologous proteins with different folds: the three-dimensional structures of domains 1 and 6 of the multiple Kazal-type inhibitor LEKTI. J. Mol. Biol. 328: 205—219. PMID 12684009 DOI:10.1016/S0022-2836(03)00245-6
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SPINK5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15464 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NQ38 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |