SNX17

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3FOG, 3LUI, 4GXB, 4TKN

Ідентифікатори

Символи

SNX17, sorting nexin 17

Зовнішні ІД

OMIM: 605963 MGI: 2387801 HomoloGene: 8838 GeneCards: SNX17

Онтологія гена
Молекулярна функція	• low-density lipoprotein particle receptor binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • signaling receptor binding • lipid binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • ендосома • комплекс Ґольджі • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • early endosome • endosome membrane • cytoplasmic vesicle membrane • цитоплазма • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• regulation of endocytosis • cardiac septum development • cholesterol catabolic process • рецептор-опосередкований ендоцитоз • coronary vasculature development • endosomal transport • aorta development • protein transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • intracellular protein transport • endocytic recycling
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9784


266781

Ensembl


ENSG00000115234


ENSMUSG00000029146

UniProt


Q15036


Q8BVL3

RefSeq (мРНК)


NM_001267059 NM_001267060 NM_001267061 NM_014748


NM_153680

RefSeq (білок)


NP_001253988 NP_001253989 NP_001253990 NP_055563


NP_710147

Локус (UCSC)

Хр. 2: 27.37 – 27.38 Mb

Хр. 5: 31.35 – 31.36 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNX17 (англ. Sorting nexin 17) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 470 амінокислот, а молекулярна маса — 52 901^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MHFSIPETES	RSGDSGGSAY	VAYNIHVNGV	LHCRVRYSQL	LGLHEQLRKE
YGANVLPAFP	PKKLFSLTPA	EVEQRREQLE	KYMQAVRQDP	LLGSSETFNS
FLRRAQQETQ	QVPTEEVSLE	VLLSNGQKVL	VNVLTSDQTE	DVLEAVAAKL
DLPDDLIGYF	SLFLVREKED	GAFSFVRKLQ	EFELPYVSVT	SLRSQEYKIV
LRKSYWDSAY	DDDVMENRVG	LNLLYAQTVS	DIERGWILVT	KEQHRQLKSL
QEKVSKKEFL	RLAQTLRHYG	YLRFDACVAD	FPEKDCPVVV	SAGNSELSLQ
LRLPGQQLRE	GSFRVTRMRC	WRVTSSVPLP	SGSTSSPGRG	RGEVRLELAF
EYLMSKDRLQ	WVTITSPQAI	MMSICLQSMV	DELMVKKSGG	SIRKMLRRRV
GGTLRRSDSQ	QAVKSPPLLE	SPDATRESMV	KLSSKLSAVS	LRGIGSPSTD
ASASDVHGNF	AFEGIGDEDL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, цитоплазматичних везикулах, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Florian V., Schlueter T., Bohnensack R. (2001). A new member of the sorting nexin family interacts with the C-terminus of P-selectin. Biochem. Biophys. Res. Commun. 281: 1045—1050. PMID 11237770 DOI:10.1006/bbrc.2001.4467
Burden J.J., Sun X.-M., Garcia Garcia A.B., Soutar A.K. (2004). Sorting motifs in the intracellular domain of the low density lipoprotein receptor interact with a novel domain of sorting nexin-17. J. Biol. Chem. 279: 16237—16245. PMID 14739284 DOI:10.1074/jbc.M313689200
Czubayko M., Knauth P., Schluter T., Florian V., Bohnensack R. (2006). Sorting nexin 17, a non-self-assembling and a PtdIns(3)P high class affinity protein, interacts with the cerebral cavernous malformation related protein KRIT1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 345: 1264—1272. PMID 16712798 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.04.129
Steinberg F., Heesom K.J., Bass M.D., Cullen P.J. (2012). SNX17 protects integrins from degradation by sorting between lysosomal and recycling pathways. J. Cell Biol. 197: 219—230. PMID 22492727 DOI:10.1083/jcb.201111121

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14979 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q15036 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 28 серпня 2017.