SNTG2 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SNTG2

Ідентифікатори

Символи

SNTG2, G2SYN, SYN5, syntrophin gamma 2

Зовнішні ІД

OMIM: 608715 MGI: 1919541 HomoloGene: 41298 GeneCards: SNTG2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• actin binding • PDZ domain binding • neuroligin family protein binding • structural molecule activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • Сарколема • клітинна мембрана • syntrophin complex • цитоскелет • мембрана • внутрішньоклітинний • dystrophin-associated glycoprotein complex
Біологічний процес	• central nervous system development
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54221


268534

Ensembl


ENSG00000281486 ENSG00000281020 ENSG00000172554


ENSMUSG00000020672

UniProt


Q9NY99


Q925E0

RefSeq (мРНК)


NM_018968


NM_172951 NM_001324519 NM_001324520 NM_001324521

RefSeq (білок)


NP_061841


NP_001311448 NP_001311449 NP_001311450 NP_766539

Локус (UCSC)

Хр. 2: 0.95 – 1.37 Mb

Хр. 12: 30.22 – 30.42 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNTG2 (англ. Syntrophin gamma 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 539 амінокислот, а молекулярна маса — 60 217^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGTEGPPPPA	ASRGRQGCLL	VPARTKTTIA	LLYDEESENA	YDIRLKLTKE
VLTIQKQDVV	CVGGSHQGRN	RRTVTLRRQP	VGGLGLSIKG	GSEHNVPVVI
SKIFEDQAAD	QTGMLFVGDA	VLQVNGIHVE	NATHEEVVHL	LRNAGDEVTI
TVEYLREAPA	FLKLPLGSPG	PSSDHSSGAS	SPLFDSGLHL	NGNSSTTAPS
SPSSPIAKDP	RYEKRWLDTL	SVPLSMARIS	RYKAGTEKLR	WNAFEVLALD
GVSSGILRFY	TAQDGTDWLR	AVSANIRELT	LQNMKMANKC	CSPSDQVVHM
GWVNEKLQGA	DSSQTFRPKF	LALKGPSFYV	FSTPPVSTFD	WVRAERTYHL
CEVLFKVHKF	WLTEDCWLQA	NLYLGLQDFD	FEDQRPYCFS	IVAGHGKSHV
FNVELGSELA	MWEKSFQRAT	FMEVQRTGSR	TYMCSWQGEM	LCFTVDFALG
FTCFESKTKN	VLWRFKFSQL	KGSSDDGKTR	VKLLFQNLDT	KQIETKELEF
QDLRAVLHCI	HSFIAAKVAS	VDPGFMDSQS	LARKYMYSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13741 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NY99 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.