SMOC2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SMOC2, DTDP1, MST117, MSTP117, MSTP140, SMAP2, bA270C4A.1, bA37D8.1, dJ421D16.1, SPARC related modular calcium binding 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607223 MGI: 1929881 HomoloGene: 11150 GeneCards: SMOC2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
вітиліго[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • glycosaminoglycan binding • heparin binding • зв'язування з іоном металу |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • базальна мембрана • interstitial matrix • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix • cell periphery • GO:0005578 Позаклітинна матриця |
---|
Біологічний процес | • extracellular matrix organization • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of cell-substrate adhesion • positive regulation of endothelial cell migration • positive regulation of vascular wound healing • positive regulation of angiogenesis • positive regulation of mitotic cell cycle • positive regulation of vascular endothelial growth factor signaling pathway • positive regulation of DNA biosynthetic process • positive regulation of endothelial cell chemotaxis • positive regulation of fibroblast growth factor receptor signaling pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 168.44 – 168.67 Mb | Хр. 17: 14.5 – 14.63 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SMOC2 (англ. SPARC related modular calcium binding 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 446 амінокислот, а молекулярна маса — 49 674[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLLPQLCWLP | | LLAGLLPPVP | | AQKFSALTFL | | RVDQDKDKDC | | SLDCAGSPQK |
PLCASDGRTF | | LSRCEFQRAK | | CKDPQLEIAY | | RGNCKDVSRC | | VAERKYTQEQ |
ARKEFQQVFI | | PECNDDGTYS | | QVQCHSYTGY | | CWCVTPNGRP | | ISGTAVAHKT |
PRCPGSVNEK | | LPQREGTGKT | | DDAAAPALET | | QPQGDEEDIA | | SRYPTLWTEQ |
VKSRQNKTNK | | NSVSSCDQEH | | QSALEEAKQP | | KNDNVVIPEC | | AHGGLYKPVQ |
CHPSTGYCWC | | VLVDTGRPIP | | GTSTRYEQPK | | CDNTARAHPA | | KARDLYKGRQ |
LQGCPGAKKH | | EFLTSVLDAL | | STDMVHAASD | | PSSSSGRLSE | | PDPSHTLEER |
VVHWYFKLLD | | KNSSGDIGKK | | EIKPFKRFLR | | KKSKPKKCVK | | KFVEYCDVNN |
DKSISVQELM | | GCLGVAKEDG | | KADTKKRHTP | | RGHAESTSNR | | QPRKQG |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Vannahme C., Goesling S., Paulsson M., Maurer P., Hartmann U. (2003). Characterization of SMOC-2, a modular extracellular calcium-binding protein. Biochem. J. 373: 805—814. PMID 12741954 DOI:10.1042/BJ20030532
- Rocnik E.F., Liu P., Sato K., Walsh K., Vaziri C. (2006). The novel SPARC family member SMOC-2 potentiates angiogenic growth factor activity. J. Biol. Chem. 281: 22855—22864. PMID 16774925 DOI:10.1074/jbc.M513463200
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SMOC2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20323 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H3U7 (англ.) . Архів оригіналу за 26 лютого 2018. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |